Циклический нуклеотид-связывающий домен - Cyclic nucleotide-binding domain

Циклический нуклеотид-связывающий домен
Структура комплекса CAP-ДНК.[1]
Идентификаторы
Символ	cNMP_binding
Pfam	PF00027
ИнтерПро	IPR000595
УМНАЯ	SM00100
PROSITE	PDOC00691
SCOP2	1cgp / Объем / СУПФАМ
CDD	cd00038
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры PDB 1o7fА: 375-462 2apk :153-242 1 кмВтР: 154-243 1 кмР: 154-243 1cx4А: 170-259 1rl3А: 153-2381ne6А: 153-238 1ne4А: 153-238 1rgs :153-2381apk :153-238 1пвкА: 153-238 1u7eА: 153-2382бпк :275-372 1бпк :271-362 1q43А: 535-6201q5oА: 535-620 1q3eА: 535-620 1vp6С: 253-3361u12А: 253-336 1i6xА: 21-112 1hw5А: 21-1121j59А: 21-112 1o3сА: 21-112 1g6nА: 21-1121 фунт2А: 21-112 1cgpА: 21-112 1ruoА: 21-1122cgpА: 21-112 1o3rА: 21-112 1i5zА: 21-1121o3тА: 21-112 1 запускА: 21-112 1o3qА: 21-112 1 фут 9А: 25-107 1o5lА: 12-103 1wgpА: 532-632

Белки, связывающие циклические нуклеотиды (лагерь или же cGMP ) имеют структурный домен примерно из 120 остатков. Наиболее изученным из этих белков является активатор гена прокариотического катаболита (также известный как белок рецептора цАМФ ) (ген crp), где известно, что такой домен состоит из трех альфа-спиралей и отличительной восьмицепочечной антипараллельной бета-цилиндрической структуры. В этом домене шесть инвариантных аминокислот, три из которых представляют собой остатки глицина, которые считаются важными для поддержания структурной целостности бета-ствола. cAMP- и cGMP-зависимые протеинкиназы (cAPK и cGPK) содержат две тандемные копии циклического нуклеотид-связывающего домена. CAPK состоят из двух разных субъединиц, каталитической цепи и регуляторной цепи, которая содержит обе копии домена. CGPK - это одноцепочечные ферменты, которые включают две копии домена в их N-концевую часть. Циклические нуклеотид-управляемые ионные каналы позвоночных также содержат этот домен. Два таких катионных канала были полностью охарактеризованы, один обнаружен в стержневых клетках, где он играет роль в передаче визуального сигнала.

Белки человека, содержащие этот домен

CNBD1; CNGA1; CNGA2; CNGA3; CNGB1; CNGB3; HCN1;HCN2; HCN3; HCN4; KCNH1; KCNH2; KCNH3; KCNH4; KCNH5;KCNH6; KCNH7; KCNH8; PNPLA6; PNPLA7; PRKAR1A; PRKAR1B; PRKAR2A;PRKAR2B; PRKG1; PRKG2; RAPGEF2; RAPGEF3; RAPGEF4; RAPGEF6; RCNC2;SLC9A10; SLC9A11;

Рекомендации

дальнейшее чтение

• Яу, К. В. (1994). «Циклические нуклеотид-управляемые каналы: расширяющееся новое семейство ионных каналов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 91 (9): 3481–3483. Bibcode:1994PNAS ... 91.3481Y. Дои:10.1073 / пнас.91.9.3481. ЧВК  43603. PMID  7513422.