Двухвалентный анион-натрий-симпортер - Divalent anion–sodium symporter

Идентификаторы
СимволDASS
PfamPF00939
TCDB2.A.47
OPM суперсемейство272
Белок OPM4f35

Двухвалентный анион: Na+ сторонники были обнаружены в бактериях, археи, хлоропласты растений и животные.

Структура

Они различаются по размеру от 432 аминоацильных остатков (М. jannaschii) до 923 остатков (Saccharomyces cerevisiae ). Три С. cerevisiae белки крупные (881-923 остатка); белки животного происхождения существенно меньше (539-616 остатков), а бактериальные белки еще меньше (461-612 остатков). У них есть 11-14 предполагаемых трансмембранных α-спиральных гаечных ключей (TMS). Предложена модель 11 TMS для животных-носителей NaDC-1 и hNaSi-1.[1][2] Два остатка серина в переносчике сульфата человека, hNaSi-1 (ТК № 2.A.47.1.16; Q9BZW2 ), один в TMS 5 и один в TMS 6, необходимы для транспорта сульфатов.[1] Первый носитель и другие изоформы NaDC котранспортируют 3 Na+ с каждым дикарбоксилат. Протонированные трикарбоксилаты также котранспортируются с 3 Na+. Некоторые организмы обладают множественными паралогами семейства DASS (например, 4 для Кишечная палочка; 2 для H. influenzae, 3 для С. cerevisiae, и не менее 4 для C. elegans ).

Гомология

Белки семейства DASS делятся на две группы транспортеров с отчетливой анионной специфичностью: Na+-сульфат (NaS) котранспортеры и Na+-карбоксилатные (NaC) котранспортеры. К млекопитающим этого семейства относятся: SLC13A1 (NaS1), SLC13A2 (NaC1), SLC13A3 (NaC3), SLC13A4 (NaS2) и SLC13A5 (NaC2).[3] Белки семейства DASS кодируют полипептиды плазматической мембраны с 8-13 предполагаемыми трансмембранными доменами и экспрессируются во множестве тканей. Они все На+-связанные сторонники. Затем+Соотношение связывания: анион составляет 3: 1, что указывает на электрогенные свойства. Они отдают предпочтение субстрату двухвалентным анионам, которые включают тетраоксианионы для котранспортеров NaS или промежуточные соединения цикла Кребса (включая моно-, ди- и трикарбоксилаты) для котранспортеров NaC. Были рассмотрены молекулярные и клеточные механизмы, лежащие в основе биохимических, физиологических и структурных свойств членов семейства DASS.[3]

Филогенетическое дерево семейства DASS включает шесть следующих кластеров:

  1. все гомологи животных;
  2. все дрожжевые белки;
  3. функционально не охарактеризованный белок из Ralstonia eutrophus;
  4. три Кишечная палочка белки плюс один из H. influenzae и один из хлоропластов шпината (оксоглутарат SodiT1: транслокатор малата);
  5. ан Кишечная палочка Orf, который слабо группируется с регулируемым лишением серы белком Synechocystis, и
  6. ан М. jannaschii белок, который слабо связывается с H. influenzae Орф.

Отдаленные гомологи белков семейства DASS могут включать членов Арс (экспортер арсенита) (TC № 3.A.4 ) семья, а также NhaB (ТК № 2.А.34 ) и NhaC (ТК № 2.А.35 ) Na+/ЧАС+ семьи-антипортеры. Таким образом, семья DASS является членом суперсемейство ионных транспортеров (IT).[4]

Функция

Функционально охарактеризованные белки семейства DASS (также называемые Семейство SLC13 ) транспорт:

  1. органические ди- и трикарбоксилаты Цикл Кребса а также дикарбоксилат аминокислоты,
  2. неорганический сульфат и (3) фосфат.

Обобщенная транспортная реакция, катализируемая белками семейства DASS, вероятно:

Анион2− (выход) + нМ+ [Na+ или H+] (выход) → Анион2− (дюйм) + нМ+ (в).

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Ли Х, Паджор А.М. (сентябрь 2003 г.). «Серины 260 и 288 участвуют в транспорте сульфата с помощью hNaSi-1». Журнал биологической химии. 278 (39): 37204–12. Дои:10.1074 / jbc.M305465200. PMID  12857732.
  2. ^ Пайор А.М. (1 января 1999 г.). «Натрий-связанные транспортеры для промежуточных продуктов цикла Кребса». Ежегодный обзор физиологии. 61: 663–82. Дои:10.1146 / annurev.physiol.61.1.663. PMID  10099705.
  3. ^ а б Маркович Д (01.01.2012). «Котранспортеры сульфата / карбоксилата натрия (SLC13)». Актуальные темы в мембранах. 70: 239–56. Дои:10.1016 / B978-0-12-394316-3.00007-7. ISBN  9780123943163. PMID  23177988.
  4. ^ Рабус Р., Джек Д.Л., Келли Д.Д., Сайер М.Х. (декабрь 1999 г.). "Транспортеры TRAP: древнее семейство экстрацитоплазматических зависимых от рецепторов растворенных веществ вторичных активных переносчиков". Микробиология. 145 (Pt 12) (12): 3431–45. Дои:10.1099/00221287-145-12-3431. PMID  10627041.