Мотив РНК GOLLD - Википедия - GOLLD RNA motif
ГОЛЛД | |
---|---|
Консенсус вторичная структура и сохранение последовательности 3'-половины гигантской, богато украшенной, производной от озера и лактобацилл (GOLLD) РНК | |
Идентификаторы | |
Символ | ГОЛЛД |
Рфам | RF02032 |
Прочие данные | |
РНК тип | Ген |
ТАК | SO: 0001263 |
PDB структуры | PDBe |
Гигантская, богато украшенная РНК, полученная из озер и лактобацилл (GOLLD) консервированный РНК структура присутствует в бактерии. РНК GOLLD были первоначально обнаружены на основе метагеном последовательности ДНК изолирован от Озеро Гатун в Панаме.[1] Однако известно, что они присутствуют по крайней мере в восьми штаммах культивируемых бактерий. РНК GOLLD необычайно велики по сравнению с другими РНК с консервативной сложной структурой. вторичная структура и в среднем около 800 нуклеотидов. Такие большие и сложные РНК часто рибозимы, хотя биохимическая функция РНК GOLLD остается неизвестной. Обнаружение больших РНК, таких как РНК GOLLD, среди бактерий, которые в основном не культивируются в лабораторных условиях, предполагает, что многие другие необычно большие РНК могут быть обнаружены у бактерий, которые еще не были изучены.[1]
РНК GOLLD в Lactobacillus brevis ATCC 367 был изучен экспериментально.[1] Эта РНК GOLLD, по-видимому, кодируется профаг, и его транскрипция увеличивается во время фаговой литический цикл. Следовательно, эта РНК GOLLD предположительно выполняет функцию, которая полезна фагу во время этого процесса. РНК GOLLD часто расположены рядом с переносить РНК (тРНК), и в некоторых случаях предполагается, что тРНК находится внутри самой структуры РНК GOLLD. Однако биологическая причина, лежащая в основе этой ассоциации, не выяснена.[1]
Недавно обнаруженная крупная бактериальная РНК, названная ROOL мотив РНК, имеет общие свойства с РНК GOLLD. В дополнение к относительно большому размеру и высокой степени структурной сложности этих мотивов РНК, они оба лишь иногда локализуются в профагах и часто расположены рядом с тРНК. Однако последовательность и структура РНК GOLLD и ROOL не связаны.
В Рфам модель GOLLD РНК использует только 3'-половину GOLLD, так как эта область полной РНК очень согласована по своей структуре.
Рекомендации
Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |