HKDC1 - Википедия - HKDC1

HKDC1
Идентификаторы
ПсевдонимыHKDC1, гексокиназный домен, содержащий 1
Внешние идентификаторыOMIM: 617221 MGI: 2384910 ГомолоГен: 128937 Генные карты: HKDC1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение HKDC1
Геномное расположение HKDC1
Группа10q22.1Начинать69,220,332 бп[1]
Конец69,267,552 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_025130

NM_145419

RefSeq (белок)

NP_079406

NP_663394

Расположение (UCSC)Chr 10: 69.22 - 69.27 МбChr 10: 62.38 - 62.42 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гексокиназный домен, содержащий 1 (HKDC1) - это фермент который у человека кодируется HKDC1 ген на 10-й хромосоме.[5] Это недавно обнаруженный гексокиназа изоформа это вероятно фосфорилаты глюкоза в материнском метаболизм во время беременности.[6][7]

Структура

В HKDC1 ген ориентирован в виде головы к хвосту рядом с HK1 ген на 10 хромосоме.[7][8] Это расположение вместе с его аминокислота сходство последовательности с HK1, предполагает, что HKDC1 и HK1 полученный из того же предшественника через тандем дупликация гена мероприятие.[6][7][8] Сходство между HKDC1 и HK1 могло скрыть его открытие в более ранних скринингах на гексокиназы позвоночных.[6] в отличие от HK2 псевдоген HKDC1 содержит неповрежденный открытая рамка чтения из 917 остатки и сохраняется у всех видов животных, что указывает на то, что он кодирует функциональный белок. Более того, кодируемый белок содержит консервативные глюкоза -обвязка сайтов в своих N- и C-терминал домены, а также АТФ -вяжущий сайт в своем C-терминал домен, что указывает на то, что его С-конец способен проявлять гексокиназную активность.[7][8]

Функция

Как недавно идентифицированная пятая изоформа гексокиназы, HKDC1 катализирует то ограничение скорости и первая обязательная стадия метаболизма глюкозы, которая представляет собой АТФ-зависимое фосфорилирование глюкозы до G6P.[9] Хотя его конкретная биологическая функция остается неясной, предполагается, что HKDC1 играет более важную роль в метаболизме глюкозы во время беременность, поскольку матери необходимо обеспечить достаточно энергии как для себя, так и для плод.[6][7] HKDC1 экспрессируется повсеместно, с самыми высокими уровнями экспрессии в глотка, вилочковая железа, двоеточие, пищевод, и глаз ткань.[7][8]

Клиническое значение

Рак

По сравнению с другими гексокиназами, HKDC1 резко сверхэкспрессируется в раковых тканях, что указывает на то, что эта изоформа может играть важную и иную роль в росте рака. Дальнейшие эксперименты, проясняющие эту роль, потребуются для разработки HKDC1 в качестве терапевтической мишени.[9]

Гестационная гипергликемия

Несколько вариантов регулирования, в том числе различные усилители, таргетинг HKDC1 выражение были связаны с гестационный гипергликемия у беременных.[6] Учитывая, что уровень глюкозы у матери во время беременности влияет на оба плод и более поздних результатов в отношении здоровья, более глубокое понимание генетических механизмов, лежащих в основе материнской гликемии во время беременности, может помочь выявить и помочь таким женщинам в группе риска.[6][7]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000156510 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020080 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ «Ген Entrez: гексокиназный домен HKDC1, содержащий 1».
  6. ^ а б c d е ж Guo C, Ludvik AE, Arlotto ME, Hayes MG, Armstrong LL, Scholtens DM, et al. (Февраль 2015 г.). «Скоординированные регуляторные вариации, связанные с гипергликемией беременных, регулируют экспрессию новой гексокиназы HKDC1». Nature Communications. 6: 6069. Дои:10.1038 / ncomms7069. ЧВК  4318120. PMID  25648650.
  7. ^ а б c d е ж грамм Хейс М.Г., Урбанек М., Хиверт М.Ф., Армстронг Л.Л., Моррисон Дж., Гуо С. и др. (Сентябрь 2013). «Идентификация HKDC1 и BACE2 как генов, влияющих на гликемические характеристики во время беременности, посредством исследований ассоциации на уровне всего генома». Сахарный диабет. 62 (9): 3282–91. Дои:10.2337 / db12-1692. ЧВК  3749326. PMID  23903356.
  8. ^ а б c d Ирвин Д.М., Тан Х (март 2008 г.). «Молекулярная эволюция гена гексокиназы позвоночных: идентификация консервативного гена гексокиназы пятого позвоночного». Сравнительная биохимия и физиология. Часть D, Геномика и протеомика. 3 (1): 96–107. Дои:10.1016 / j.cbd.2007.11.002. PMID  20483211.
  9. ^ а б Ли Г. Х., Хуанг Дж. Ф. (март 2014 г.). «Вывод терапевтических мишеней из разнородных данных: HKDC1 - новая потенциальная терапевтическая мишень для рака». Биоинформатика. 30 (6): 748–52. Дои:10.1093 / биоинформатика / btt606. PMID  24162464.