HNRNPL - HNRNPL

HNRNPL
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыHNRNPL, HNRPL, hnRNP-L, P / OKcl.14, гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L
Внешние идентификаторыOMIM: 603083 MGI: 104816 ГомолоГен: 1174 Генные карты: HNRNPL
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение HNRNPL
Геномное расположение HNRNPL
Группа19q13.2Начните38,836,388 бп[1]
Конец38,852,347 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE HNRPL 202072 at fs.png

PBB GE HNRPL 35201 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001005335
NM_001533

NM_177301

RefSeq (белок)

NP_001005335
NP_001524

NP_796275

Расположение (UCSC)Chr 19: 38,84 - 38,85 МбChr 7: 28,81 - 28,82 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L это белок что у людей кодируется HNRNPL ген.[5][6]

Функция

Гетерогенные ядерные РНК (гяРНК), которые включают мРНК предшественники и зрелые мРНК связаны со специфическими белками с образованием гетерогенных комплексов рибонуклеопротеидов (hnRNP). Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L входит в число белков, которые стабильно связаны с комплексами hnRNP, и вместе с другими белками hnRNP, вероятно, играет важную роль в образовании, упаковке, процессинге и функции мРНК. Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L присутствует в нуклеоплазме как часть комплекса HNRP. Белки HNRP также были идентифицированы вне нуклеоплазмы. Обмен hnRNP на мРНК-связывающие белки сопровождает транспорт мРНК из ядра в цитоплазму. Поскольку было показано, что белки HNRP перемещаются между ядро и цитоплазма, возможно, они также имеют цитоплазматические функции. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы.[6]

Взаимодействия

HNRNPL была показана взаимодействовать с участием:

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000282947 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000104824, ENSG00000282947 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015165 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Pinol-Roma S, Swanson MS, Gall JG, Dreyfuss G (январь 1990 г.). «Новый гетерогенный ядерный РНП-белок с уникальным распределением в растущих транскриптах». J Cell Biol. 109 (6 Pt 1): 2575–87. Дои:10.1083 / jcb.109.6.2575. ЧВК  2115934. PMID  2687284.
  6. ^ а б «Ген Entrez: гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин L HNRPL».
  7. ^ Обердорффер С., Мойта Л.Ф., Нимс Д., Фрейтас Р.П., Хакоэн Н., Рао А. (август 2008 г.). "Регулирование альтернативного сплайсинга CD45 гетерогенным рибонуклеопротеином, hnRNPLL". Наука. 321 (5889): 686–91. Дои:10.1126 / science.1157610. ЧВК  2791692. PMID  18669861.
  8. ^ а б c Ким Дж. Х., Хам Б., Ким Ю. К., Чой М., Чан С. К. (май 2000 г.). «Белок-белковое взаимодействие между hnRNPs, перемещающимися между ядром и цитоплазмой». J. Mol. Биол. 298 (3): 395–405. Дои:10.1006 / jmbi.2000.3687. PMID  10772858.
  9. ^ Хам Б., Чо О, Ким Дж. Э, Ким Ю. К., Ким Дж. Х., О Й Л., Чан С. К. (апрель 1998 г.). «Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, взаимодействует с HnRNP L». FEBS Lett. 425 (3): 401–6. Дои:10.1016 / S0014-5793 (98) 00269-5. PMID  9563502. S2CID  4980318.

дальнейшее чтение