Малый ядерный рибонуклеопротеин D2 - Small nuclear ribonucleoprotein D2

SNRPD2
Белок SNRPD2 PDB 1b34.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыSNRPD2, SMD2, SNRPD1, Sm-D2, Малый ядерный рибонуклеопротеин D2, полипептид малого ядерного рибонуклеопротеина D2
Внешние идентификаторыOMIM: 601061 MGI: 98345 ГомолоГен: 3381 Генные карты: SNRPD2
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Геномное расположение SNRPD2
Геномное расположение SNRPD2
Группа19q13.32Начните45,687,454 бп[1]
Конец45,692,569 бп[1]
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_004597
NM_177542
NM_001369751
NM_001369752

NM_026943

RefSeq (белок)

NP_004588
NP_808210
NP_001356680
NP_001356681

NP_081219

Расположение (UCSC)Chr 19: 45.69 - 45.69 МбChr 7: 19.15 - 19.15 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин Sm D2 это белок что у людей кодируется SNRPD2 ген.[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к семейству белков ядра малых ядерных рибонуклеопротеидов. Он необходим для сплайсинга пре-мРНК и биогенеза малых ядерных рибонуклеопротеидов. В этом локусе происходит альтернативный сплайсинг, и были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.[7]

Взаимодействия

Было показано, что малый ядерный рибонуклеопротеин D2 взаимодействовать с участием DDX20,[8] Малый ядерный рибонуклеопротеин D1,[9][10] Малый ядерный рибонуклеопротеиновый полипептид F,[9] CDC5L[11] и SMN1.[12]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000125743 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040824 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Лемайер Т., Рейкер В., Германн Х., Лурманн Р. (январь 1995 г.). «Клонирование кДНК белков D2 и D3 Sm из малых ядерных рибонуклеопротеинов человека: доказательства прямого взаимодействия D1-D2». Proc Natl Acad Sci U S A. 91 (25): 12317–21. Bibcode:1994PNAS ... 9112317L. Дои:10.1073 / пнас.91.25.12317. ЧВК  45428. PMID  7527560.
  6. ^ Лемайер Т., Фулаки К., Лурманн Р. (январь 1991 г.). «Доказательства трех различных белков D, которые по-разному реагируют с аутоантителами против Sm, в ядрах основных snRNPs U1, U2, U4 / U6 и U5». Нуклеиновые кислоты Res. 18 (22): 6475–84. Дои:10.1093 / nar / 18.22.6475. ЧВК  332598. PMID  1701240.
  7. ^ а б «Ген Entrez: малый ядерный рибонуклеопротеид D2, полипептид SNRPD2, 16,5 кДа».
  8. ^ Шарру, B; Pellizzoni L; Perkinson R A; Шевченко А; Mann M; Дрейфусс Дж. (Декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена мышечной атрофии позвоночника, и является компонентом драгоценных камней». J. Cell Biol. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 147 (6): 1181–94. Дои:10.1083 / jcb.147.6.1181. ISSN  0021-9525. ЧВК  2168095. PMID  10601333.
  9. ^ а б Ярость, M G; Zhang W; Христодулопулос I; Zieve G W (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками snRNP». Exp. Cell Res. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 237 (1): 63–9. Дои:10.1006 / excr.1997.3750. ISSN  0014-4827. PMID  9417867.
  10. ^ Камбах, К; Walke S; Young R; Avis J M; de la Fortelle E; Рейкер V A; Lührmann R; Ли Дж; Нагай К. (февраль 1999 г.). «Кристаллические структуры двух белковых комплексов Sm и их значение для сборки spliceosomal snRNPs». Ячейка. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 96 (3): 375–87. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 80550-4. ISSN  0092-8674. PMID  10025403. S2CID  17379935.
  11. ^ Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk J C; Mann M; Ламонд А. I (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. АНГЛИЯ. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN  0261-4189. ЧВК  305846. PMID  11101529.
  12. ^ Мейстер, G; Bühler D; Laggerbauer B; Zobawa M; Lottspeich F; Фишер У (август 2000 г.). «Характеристика ядерного 20S комплекса, содержащего белок выживания моторных нейронов (SMN) и специфическую подгруппу сплайсосомных белков Sm». Гм. Мол. Genet. АНГЛИЯ. 9 (13): 1977–86. Дои:10.1093 / hmg / 9.13.1977. ISSN  0964-6906. PMID  10942426.

дальнейшее чтение