Мотив РНК HopC - HopC RNA motif
| hopC РНК | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура hopC РНК | |
| Идентификаторы | |
| Символ | hopC РНК |
| Рфам | RF01741 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | СНГ-регулирующий элемент |
| Домен (ы) | Helicobacter |
| PDB структуры | PDBe |
В hopC Мотив РНК предсказанный цис-регуляторный элемент идентифицированный биоинформатический экран для сохраненных РНК второстепенные конструкции.[1] hopC РНК находятся исключительно в бактерии классифицируется в род Helicobacter, некоторые из которых человек патогены которые заражают желудок и может вызвать язвы.
hopC РНК находятся перед оперон двух генов, называемых hopC и hopB (также называемый альпа и alpB). Эксперименты по запуску транскрипция для hopCB оперон[2] указывают, что hopC РНК находятся внутри 5 'непереведенный регион этого оперона. В hopCB оперон индуцируется к более высоким уровням экспрессии в ответ на низкий pH.[2] Это согласуется с данными, в привязке которых участвует HopCB. человек эпителиальный клетки[3] что предположительно то, что бактерии делать во время заражения среды желудка с низким pH.
Предыдущая работа предполагала повторение 13 тимидин нуклеотиды может участвовать в регулировании численности hopCB оперон.[2] Однако эта 13-нуклеотидная область расположена выше сайта начала транскрипции и, следовательно, не зависит от hopC мотивные РНК.
Рекомендации
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
- ^ а б c McGowan CC, Нечева AS, Forsyth MH, Cover TL, Blaser MJ (июнь 2003 г.). «Промоторный анализ генов Helicobacter pylori с повышенной экспрессией при низком pH». Мол. Микробиол. 48 (5): 1225–1239. Дои:10.1046 / j.1365-2958.2003.03500.x. PMID 12787351. S2CID 28628324.
- ^ Оденбрайт С., Фаллер Г., Хаас Р. (сентябрь 2002 г.). «Роль белков alpAB и липополисахарида в адгезии Helicobacter pylori к ткани желудка человека». Int. J. Med. Микробиол. 292 (3–4): 247–256. Дои:10.1078/1438-4221-00204. PMID 12398215.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |