Inte: Ligand - Википедия - Inte:Ligand

Inte: Ligand GmbH
Частный
ПромышленностьНауки о жизни
Основан2003
Штаб-квартира
Вена
,
Австрия
Обслуживаемая площадь
Мировой
Ключевые люди
Тьерри Лангер (основатель) Герхард Вольбер (основатель) Герман Штуппнер (основатель) Шарон Д. Брайант (генеральный директор)
ТоварыLigandScout Essential LigandScout Advanced Эксперт LigandScout KNIME iLib: Diverse PharmacophoreDB
УслугиКонтрактные исследования, Дизайн библиотеки In-Silico,

Поддержка оптимизации потенциальных клиентов, виртуальный скрининг, профилирование активности, разработка 3D-фармакофоров,

Научная разработка программного обеспечения
Интернет сайтwww.inteligand.com

Inte: Ligand была основана в Мария Энцерсдорф, Нижняя Австрия (Niederösterreich) в 2003 году.[1] Они основали штаб-квартиру компании на Марияхильферштрассе в Вена, Австрия в том же году.

В 2007 году Inte: Ligand была удостоена премии NÖ Innovation (Innovationpreis) за разработку программного обеспечения для моделирования LigandScout.[2][3][4][5] По состоянию на 2017 год было опубликовано более 1500 литературы, глав книг и обзорных статей, связанных с программными технологиями InteLigand в области виртуального скрининга,[6][7][8] 3D-фармакофорное моделирование,[9][10][11][12] идентификация попаданий,[13][14][15][16][17][18] поддержка принятия решений в области медицинской химии,[19][20][21] профилирование деятельности,[22] стыковка, составная конструкция на основе фрагментов,[23] белок-белковые взаимодействия,[24] перепрофилирование наркотиков[25] и моделирование молекулярной динамики.[26][27][28]

Другие приложения включают обнаружение новых Миелопероксидаза лиганды,[29] ВИЧ ингибиторы обратной транскриптазы,[30] приложения для профилирования антивирусной биоактивности,[31] разработка моделей для прогнозирования ВИЧ Протеазная активность,[32] Цитохром P450 прогноз активности,[33]и имитационные модели для деятельности на Фактор Ха.[34]

Наука и технология

  • LigandScout Essential - это научная программа для разработки молекул de novo, для получения трехмерных фармакофоров на основе структур и лигандов, выполнения молекулярных трехмерных выравниваний, трехмерного моделирования фармакофоров, виртуального скрининга, создания мультиконформационных библиотек соединений для виртуального скрининга, аннотирования библиотек соединений. а также выполнять фильтрацию, сортировку и расширенное редактирование фармакофоров и молекул.
  • LigandScout Advanced - это научная программа, которая имеет все функции LigandScout Essential плюс стыковку, моделирование фармакофора сайта Apo, поиск карманов, анализ траекторий молекулярной динамики.
  • LigandScout Расширения Expert KNIME предоставляют более 45 научных алгоритмов Inte: Ligand, заключенных в расширения KNIME, которые можно использовать для разработки индивидуальных рабочих процессов, связанных с компьютерным дизайном лекарств с использованием платформы KNIME.

Смотрите также

Другие компании и учреждения, предоставляющие программное обеспечение для открытия новых лекарств:

Рекомендации

  1. ^ "Inte: Ligand Software-Entwicklungs- und Consulting GmbH - Вена - Telefon - Kontakt - Информация и консалтинг - Firmen A-Z". firmen.wko.at (на немецком). Получено 2017-07-02.
  2. ^ Вольбер, Герхард; Дорнхофер, Алоис А .; Лангер, Тьерри (01.12.2006). «Эффективное наложение малых органических молекул с помощью 3D-фармакофоров». Журнал компьютерного молекулярного дизайна. 20 (12): 773–788. Дои:10.1007 / s10822-006-9078-7. ISSN  0920-654X. PMID  17051340.
  3. ^ "Land Niederösterreich und Wirtschaftskammer NÖ verleihen NÖ Innovationspreis 2007". OTS.at. Получено 2017-07-02.
  4. ^ "Waldviertelnews.at". www.waldviertelnews.at. Получено 2017-07-02.
  5. ^ Вольбер, Герхард; Лангер, Тьерри (01.01.2005). «LigandScout: 3-D фармакофоры, полученные из лигандов, связанных с белками, и их использование в качестве виртуальных фильтров скрининга». Журнал химической информации и моделирования. 45 (1): 160–169. Дои:10.1021 / ci049885e. ISSN  1549-9596. PMID  15667141.
  6. ^ Карабога, Арно С .; Planesas, Jesús M .; Петронин, Флоран; Тейксидо, Хорди; Суше, Мишель; Перес-Нуэно, Виолета И. (24 мая 2013 г.). «Высокоспецифичная и чувствительная модель фармакофоров для идентификации антагонистов CXCR4. Сравнение с эффективностью стыковки и согласования формы виртуального скрининга». Журнал химической информации и моделирования. 53 (5): 1043–1056. Дои:10.1021 / ci400037y. ISSN  1549-9596. PMID  23577723.
  7. ^ Sanders, Marijn P.A .; Barbosa, Arménio J.M .; Зажицкая, Варвара; Николаес, Джерри А.Ф .; Кломп, Ян П.Г .; де Влиг, Якоб; Дель Рио, Альберто (25 июня 2012 г.). «Сравнительный анализ инструментов скрининга фармакофоров». Журнал химической информации и моделирования. 52 (6): 1607–1620. Дои:10.1021 / ci2005274. ISSN  1549-9596. PMID  22646988.
  8. ^ Kaserer, T .; Обермозер, В .; Weninger, A .; Gust, R .; Шустер, Д. (29 ноября 2016 г.). «Оценка выбранных инструментов трехмерного виртуального скрининга для предполагаемой идентификации частичных агонистов рецептора, активируемого пролифератором пероксисом (PPAR)». Европейский журнал медицинской химии. 124: 49–62. Дои:10.1016 / j.ejmech.2016.07.072. PMID  27560282.
  9. ^ Зайдель, Томас; Bryant, Sharon D .; Ибис, Гекхан; Поли, Джулио; Лангер, Тьерри (2017). Варнек, Александр (ред.). Учебники по химиоинформатике. John Wiley & Sons, Ltd., стр. 279–309. Дои:10.1002 / 9781119161110.ch20. ISBN  9781119161110.
  10. ^ Лагард, Натали; Делахай, Соленн; Загури, Жан-Франсуа; Монтес, Матье (2016-09-06). «Различение лигандов-агонистов и антагонистов ядерных рецепторов с использованием 3D-фармакофоров». Журнал химинформатики. 8 (1): 43. Дои:10.1186 / s13321-016-0154-2. ISSN  1758-2946. ЧВК  5011875. PMID  27602059.
  11. ^ Лю, Цзиюань; Тянь, Чжэнь; Чжан, Ялин (2016-10-06). «Открытие на основе структуры потенциально активных семиохимических веществ для Cydia pomonella (L.)». Научные отчеты. 6 (1): 34600. Дои:10.1038 / srep34600. ISSN  2045-2322. ЧВК  5052595. PMID  27708370.
  12. ^ Вольбер, Герхард; Косара, Роберт (2006). Лангер, Тьерри; Хоффманн, Реми Д. (ред.). Фармакофоры и поиск фармакофоров. Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. стр.131 –150. Дои:10.1002 / 3527609164.ch6. ISBN  9783527609161.
  13. ^ Лангер, Тьерри; Хоффманн, Реми; Брайант, Шарон; Лесур, Бриджит (2009). «Поиск попаданий: к« более умным »подходам». Текущее мнение в фармакологии. 9 (5): 589–593. Дои:10.1016 / j.coph.2009.06.001. PMID  19576852.
  14. ^ Такимото, Сэйсукэ; Сугиура, Айри; Минами, Саки; Тасака, Томохико; Накагава, Ёсиаки; Миягава, Хисаши (01.04.2016). «Исследование in silico агонистов / антагонистов брассинолида». Письма по биоорганической и медицинской химии. 26 (7): 1709–1714. Дои:10.1016 / j.bmcl.2016.02.054. PMID  26935445.
  15. ^ Вуоринен, Анна; Энгели, Роджер; Мейер, Арне; Бахманн, Фабио; Griesser, Ulrich J .; Шустер, Даниэла; Одерматт, Алекс (24.07.2014). «Моделирование фармакофоров на основе лигандов и виртуальный скрининг для открытия новых ингибиторов 17β-гидроксистероиддегидрогеназы 2». Журнал медицинской химии. 57 (14): 5995–6007. Дои:10.1021 / jm5004914. ISSN  0022-2623. ЧВК  4111740. PMID  24960438.
  16. ^ Перди, Андрей; Ковач, Андрей; Вольбер, Герхард; Блано, Дидье; Гобец, Станислав; Солмайер, Том (15 мая 2009 г.). «Открытие новых ингибиторов бензол-1,3-дикарбоновой кислоты бактериальных лигаз MurD и MurE с помощью подхода виртуального скрининга на основе структуры». Письма по биоорганической и медицинской химии. 19 (10): 2668–2673. Дои:10.1016 / j.bmcl.2009.03.141. PMID  19369074.
  17. ^ Вальтенбергер, Биргит; Гарша, Ульрике; Теммл, Вероника; Лирс, Жозефина; Верц, Оливер; Шустер, Даниэла; Ступпнер, Германн (2016-04-25). «Открытие эффективных ингибиторов растворимой эпоксидгидролазы (sEH) с помощью виртуального скрининга на основе фармакофоров». Журнал химической информации и моделирования. 56 (4): 747–762. Дои:10.1021 / acs.jcim.5b00592. ISSN  1549-9596. PMID  26882208.
  18. ^ Voet, Arnout R.D .; Кумар, Ашутош; Беренджера, Франсуа; Чжан, Кам Ю. Дж. (2014-04-01). «Комбинирование подходов in silico и in cerebro для виртуального скрининга и прогнозирования позы в SAMPL4». Журнал компьютерного молекулярного дизайна. 28 (4): 363–373. Дои:10.1007 / s10822-013-9702-2. ISSN  0920-654X. PMID  24446075.
  19. ^ ДеБонис, Сальваторе; Скуфиас, Димитриос А .; Индорато, Роза-Лор; Лигер, Франсуа; Марке, Бернар; Лаггнер, Кристиан; Жозеф, Бенуа; Козельский, Франк (2008-03-01). «Взаимосвязь структуры и активности аналогов S-тритил-1-цистеина как ингибиторов митотического кинезина Eg5 человека». Журнал медицинской химии. 51 (5): 1115–1125. Дои:10.1021 / jm070606z. ISSN  0022-2623. PMID  18266314.
  20. ^ Полищук, Павел Г .; Самойленко, Георгий В .; Христова, Татьяна М .; Крыско, Ольга Л .; Кабанова, Татьяна А .; Кабанов Владимир М .; Корнылов Александр Юрьевич; Климчук, Ольга; Лангер, Тьерри (2015-10-08). «Дизайн, виртуальный скрининг и синтез антагонистов αIIbβ3 в качестве антитромбоцитарных агентов». Журнал медицинской химии. 58 (19): 7681–7694. Дои:10.1021 / acs.jmedchem.5b00865. ISSN  0022-2623. PMID  26367138.
  21. ^ Баррека, Мария Летиция; Де Лука, Лаура; Ираси, Нунцио; Рао, Анджела; Ферро, Стефания; Мага, Джованни; Чимирри, Альба (2007-03-01). «Идентификация фармакофоров на основе структуры новых химических каркасов как ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы». Журнал химической информации и моделирования. 47 (2): 557–562. Дои:10.1021 / ci600320q. ISSN  1549-9596. PMID  17274611.
  22. ^ Лангер, Тьерри; Брайант, Шэрон Д. (2013-10-01). «Вычислительные методы целевого профилирования лекарств и полифармакологии». Открытие и дизайн лекарств In Silico. Серия будущих научных книг. Future Science Ltd. стр. 178–188. Дои:10.4155 / ebo.13.417. ISBN  978-1-909453-01-2.
  23. ^ Дейон-Юнг, Лоуренс; Морис, Кристоф; Шери, Флоренция; Гей, Джули; Лангер, Тьерри; Франц, Мари-Селин; Розот, Роджер; Далко-Чиба, Мария (16.03.2016). «Фрагментный скрининг in silico на основе фармакофора: мощный подход к эффективному обнаружению свинца». Med. Chem. Сообщество. 7 (3): 506–511. Дои:10.1039 / c5md00444f. ISSN  2040-2511.
  24. ^ Голестанян, Саханд; Шарифи, Амирхоссейн; Popowicz, Grzegorz M .; Азизян, Хома; Форумади, Алиреза; Швагерчак, Александра; Holak, Tad A .; Аманлу, Масуд (15 января 2016 г.). «Открытие новых двойных ингибиторов против белков Mdm2 и Mdmx с помощью in silico подходов и анализа связывания». Науки о жизни. 145: 240–246. Дои:10.1016 / j.lfs.2015.12.047. PMID  26746660.
  25. ^ Вэй, Иньсян; Ма, Юаньфан; Чжао, Цин; Рен, Чжигуан; Ли, Ян; Хоу, Тинцзюнь; Пэн, Хуэй (2012-08-01). «Новое применение старого лекарства: ингибирование ABCG2 с помощью сорафениба». Молекулярная терапия рака. 11 (8): 1693–1702. Дои:10.1158 / 1535-7163.MCT-12-0215. ISSN  1535-7163. PMID  22593228.
  26. ^ Ширгахи Талари, Фаэзех; Багерзаде, Ковсар; Голестанян, Саханд; Ярстфер, Майкл; Аманлу, Масуд (28 декабря 2015 г.). «Сильные ингибиторы теломеразы человека: молекулярно-динамическое моделирование, множественный виртуальный скрининг на основе фармакофоров и биохимические анализы». Журнал химической информации и моделирования. 55 (12): 2596–2610. Дои:10.1021 / acs.jcim.5b00336. ISSN  1549-9596. PMID  26529120.
  27. ^ Рейкерс, Кристин; Шумахер, Фабиан; Майнл, Вальтер; Glatt, Hansruedi; Клейзер, Буркхард; Вольбер, Герхард (01.01.2016). «In Silico Прогнозирование активности человеческой сульфотрансферазы 1E1 на основе фармакофоров на основе моделирования молекулярной динамики». Журнал биологической химии. 291 (1): 58–71. Дои:10.1074 / jbc.M115.685610. ISSN  0021-9258. ЧВК  4697188. PMID  26542807.
  28. ^ Видер, Маркус; Перриконе, Уго; Бореш, Стефан; Зайдель, Томас; Лангер, Тьерри (12 февраля 2016 г.). «Оценка стабильности характеристик фармакофоров с использованием моделирования молекулярной динамики». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 470 (3): 685–689. Дои:10.1016 / j.bbrc.2016.01.081. PMID  26785387.
  29. ^ Malle, E .; Furtmüller, P. G .; Sattler, W .; Обингер, К. (2007). «Миелопероксидаза: цель для разработки новых лекарств?». Британский журнал фармакологии. 152: 838–854. Дои:10.1038 / sj.bjp.0707358. ЧВК  2078229.
  30. ^ Barreca, M. L .; De Luca, L .; Iraci, N .; Rao, A .; Ferro, S .; Maga, G .; Чимирри, А (2007). «Идентификация фармакофоров на основе структуры новых химических каркасов как ненуклеозидных ингибиторов обратной транскриптазы». J. Chem. Инф. Модель. 47 (2): 557–562. Дои:10.1021 / ci600320q. PMID  17274611.
  31. ^ Steindl, T. M; Schuster, D .; Wolber, G .; Laggner, C .; Лангер, Т. (2007). «Высокопроизводительное моделирование фармакофоров на основе структуры как основа для успешного параллельного виртуального скрининга». J. Comput.-Aided Mol. Des. 20 (12): 703–715. Дои:10.1007 / s10822-006-9066-у.
  32. ^ Steindl, T. M; Шустер, Лаггнер; Chuang, K .; Hoffmann, R .; Лангер, Т. (2007). «Параллельный скрининг и профилирование активности с моделями фармакофоров ингибиторов протеазы ВИЧ». J. Chem. Инф. Модель. 47 (2): 563–571. Дои:10.1021 / ci600321m.
  33. ^ Schuster, D .; Laggner, C .; Steindl, T. M .; Лангер, Т. (2006). «Разработка и валидация профилографа in silico P450 на основе фармакофорных моделей». Curr. Drug Discov. Technol. 3 (1): 1–48. Дои:10.2174/157016306776637609.
  34. ^ Кроват, Э. М .; Fruhwirth, K. H .; Лангер, Т. (2005). «Идентификация фармакофоров, скрининг in Silico и дизайн виртуальной библиотеки для ингибиторов человеческого фактора Ха». J. Chem. Инф. Модель. 45 (1): 146–159. Дои:10.1021 / ci049778k.