LDB1 - LDB1

LDB1
Белок LDB1 PDB 2XJY.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыLDB1, CLIM2, NLI, CLIM-2, LDB-1, привязка домена LIM 1
Внешние идентификаторыOMIM: 603451 MGI: 894762 ГомолоГен: 2891 Генные карты: LDB1
Расположение гена (человек)
Хромосома 10 (человек)
Chr.Хромосома 10 (человек)[1]
Хромосома 10 (человек)
Геномное расположение LDB1
Геномное расположение LDB1
Группа10q24.32Начинать102,106,489 бп[1]
Конец102,120,368 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE LDB1 203451 в формате fs.png

PBB GE LDB1 35160 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001113407
NM_003893
NM_001321612

NM_001113408
NM_010697
NM_001360336

RefSeq (белок)

NP_001106878
NP_001308541
NP_003884

NP_001106879
NP_034827
NP_001347265

Расположение (UCSC)Chr 10: 102.11 - 102.12 МбChr 19: 46.03 - 46.05 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

LIM домен-связывающий белок 1 это белок что у людей кодируется LDB1 ген.[5][6][7]

Взаимодействия

LDB1 был показан взаимодействовать с LMO4,[8][9] TCF3,[10] TAL1[10] и CBFA2T3.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000198728 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025223 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Ямашита Т., Агульник А.Д., Коупленд Н.Г., Гилберт Д.Д., Дженкинс Н.А., Вестфаль Г. (апрель 1998 г.). «Геномная структура и хромосомная локализация гена белка 1, связывающего домен LIM мыши, Ldb1». Геномика. 48 (1): 87–92. Дои:10.1006 / geno.1997.5163. PMID  9503020.
  6. ^ Семина Э.В., Алтерр М.Р., Мюррей Дж.С. (декабрь 1998 г.). «Клонирование и хромосомная локализация двух новых человеческих генов, кодирующих факторы связывания LIM-домена CLIM1 и CLIM2 / LDB1 / NLI». Геном мамм. 9 (11): 921–4. Дои:10.1007 / s003359900899. PMID  9799849. S2CID  28813194.
  7. ^ "Ген Entrez: связывание домена LIM LDB1 1".
  8. ^ Сазерленд, Кейт Д; Visvader Jane E; Чунг Дэвид Й Х; Сумма Элеонора Ю. М; Линдеман Джеффри Дж; Кэмпбелл Иэн Джи (октябрь 2003 г.). «Мутационный анализ гена LMO4, кодирующего белок, взаимодействующий с BRCA1, в карциномах молочной железы». Int. J. Рак. 107 (1): 155–8. Дои:10.1002 / ijc.11343. ISSN  0020-7136. PMID  12925972. S2CID  20908722.
  9. ^ Дин, Джанет Э; Маккей Джоэл П.; Kwan Ann HY; Сумма Элеонора Ю. М; Visvader Jane E; Мэтьюз Жаклин М. (май 2003 г.). «Структурная основа для распознавания ldb1 N-концевыми доменами LIM LMO2 и LMO4». EMBO J. 22 (9): 2224–33. Дои:10.1093 / emboj / cdg196. ISSN  0261-4189. ЧВК  156068. PMID  12727888.
  10. ^ а б c Гоардон, Николас; Ламберт Джули А; Родригес Патрик; Ниссер Филипп; Герблот Сабина; Тибо Пьер; Дюмениль Доминик; Струбулис Джон; Ромео Поль-Анри; Хоанг Транг (январь 2006 г.). «ETO2 координирует клеточную пролиферацию и дифференцировку во время эритропоэза». EMBO J. 25 (2): 357–66. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600934. ISSN  0261-4189. ЧВК  1383517. PMID  16407974.

дальнейшее чтение