LGP2 - LGP2
Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DHX58 также известный как RIG-I-подобный рецептор 3 (RLR-3) или RIG-I-подобный рецептор LGP2 (RLR) - это RIG-I-подобный рецептор дцРНК геликаза фермент что у людей кодируется DHX58 ген.[5][6] В белок закодирован геном DHX58 известен как LGP2 (Лаборатория генетики и физиологии 2).[5][7][8]
Структура и функции
LGP2 был впервые идентифицирован и охарактеризован в контексте ткань молочной железы в 2001,[5] но его функция оказалась более актуальной в области врожденный противовирусный иммунитет. Было обнаружено, что LGP2 необходим для получения эффективных антивирусных реакций против многих вирусов, которые распознаются RIG-I и MDA5.[9]
Поскольку в LGP2 отсутствует КАРТА доменов, его влияние на антивирусную передачу сигналов, вероятно, связано с взаимодействием с дцРНК вирусной лиганд или другие RLR (RIG-I и MDA5).[10]
Было показано, что LGP2 напрямую взаимодействует[10] с RIG-I через его C-концевой репрессорный домен (RD). Первичные сайты контакта в этом взаимодействии вероятны между RD LGP2 и CARD или геликазным доменом RIG-I, как это видно с самоассоциацией RIG-I,[10] но это не подтверждено. Было обнаружено, что активность геликазы LGP2 важна для его положительной регуляции передачи сигналов RIG-I.[9] Сверхэкспрессия LGP2 способен ингибировать опосредованную RIG-I передачу противовирусных сигналов как в присутствии, так и в отсутствие вирусных лигандов.[10][11][12] Это ингибирование передачи сигналов RIG-I не зависит от способности LGP2 связывать вирусные лиганды и, следовательно, не связано с конкуренцией лигандов.[7][13] Хотя LGP2 связывается с дцРНК с более высокой аффинностью,[12] он необходим для опосредованного RIG-I распознавания синтетических лигандов дцРНК.[9] RIG-I, когда сверхэкспрессирован[7] и в LGP2 сбить исследования[14] было показано, что он вызывает противовирусный ответ в отсутствие вирусного лиганда.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108771 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017830 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б c Цуй Ю., Ли М., Уолтон К.Д., Сан К., Ганновер Дж. А., Фурт, Пенсильвания, Хеннигхаузен, Л. (декабрь 2001 г.). «Локус Stat3 / 5 кодирует новый эндоплазматический ретикулум и подобные геликазе белки, которые предпочтительно экспрессируются в нормальной и опухолевой ткани молочной железы». Геномика. 78 (3): 129–34. Дои:10.1006 / geno.2001.6661. PMID 11735219.
- ^ «Энтрез Ген: LGP2, вероятно, ортолог мыши D11lgp2».
- ^ а б c Чайлдс К., Рэндалл Р., Гудборн С. (апрель 2012 г.). «Белки парамиксовируса V взаимодействуют с РНК-геликазой LGP2, подавляя RIG-I-зависимую индукцию интерферона». Дж. Вирол. 86 (7): 3411–21. Дои:10.1128 / JVI.06405-11. ЧВК 3302505. PMID 22301134.
- ^ Мацумия Т, Стаффорини Д.М. (2010). «Функция и регуляция гена-I, индуцируемого ретиноевой кислотой». Крит. Rev. Immunol. 30 (6): 489–513. Дои:10.1615 / critrevimmunol.v30.i6.10. ЧВК 3099591. PMID 21175414.
- ^ а б c Сато Т., Като Х., Кумагаи Й., Йонеяма М., Сато С., Мацусита К., Цудзимура Т., Фудзита Т., Акира С., Такеучи О. (январь 2010 г.). «LGP2 является позитивным регулятором противовирусных реакций, опосредованных RIG-I и MDA5». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 107 (4): 1512–7. Дои:10.1073 / pnas.0912986107. ЧВК 2824407. PMID 20080593.
- ^ а б c d Сайто Т., Хираи Р., Лу Ю.М., Оуэн Д., Джонсон С.Л., Синха С.К., Акира С., Фуджита Т., Гейл М. (январь 2007 г.). «Регулирование врожденной противовирусной защиты через общий репрессорный домен в RIG-I и LGP2». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (2): 582–7. Дои:10.1073 / pnas.0606699104. ЧВК 1766428. PMID 17190814.
- ^ Rothenfusser S, Goutagny N, DiPerna G, Gong M, Monks BG, Schoenemeyer A, Yamamoto M, Akira S, Fitzgerald KA (октябрь 2005 г.). «РНК-геликаза Lgp2 ингибирует TLR-независимое восприятие репликации вируса геном-I, индуцируемым ретиноевой кислотой». J. Immunol. 175 (8): 5260–8. Дои:10.4049 / jimmunol.175.8.5260. PMID 16210631.
- ^ а б Ёнеяма М., Кикучи М., Мацумото К., Имаидзуми Т., Миягиши М., Тайра К., Фой Е., Лоо Ю.М., Гейл М., Акира С., Йонехара С., Като А., Фудзита Т. (сентябрь 2005 г.). «Общие и уникальные функции DExD / H-бокса геликаз RIG-I, MDA5 и LGP2 в противовирусном врожденном иммунитете». J. Immunol. 175 (5): 2851–8. Дои:10.4049 / jimmunol.175.5.2851. PMID 16116171.
- ^ Ван И, Людвиг Дж., Шуберт К., Голдек М., Шлее М., Ли Х, Юранек С., Шенг Дж., Микура Р., Тушл Т., Хартманн Дж., Пател Д. Д. (июль 2010 г.). «Структурные и функциональные сведения о распознавании паттернов РНК 5'-ppp рецептором врожденного иммунитета RIG-I». Nat. Struct. Мол. Биол. 17 (7): 781–7. Дои:10.1038 / nsmb.1863. ЧВК 3744876. PMID 20581823.
- ^ Бурел С.А., Мачемер Т., Рагон Флорида, Като Х., Каунтай П., Гринли С., Салим А., Гарде В.А., Хунг Г., Перальта Р., Фрейер С.М., Генри С.П. (июль 2012 г.). «Уникальный химерный олигонуклеотид O-метоксиэтил-рибоза-ДНК индуцирует атипичную дифференцировку генов 5-зависимой индукции ответа на интерферон I типа». J. Pharmacol. Exp. Ther. 342 (1): 150–62. Дои:10.1124 / jpet.112.193789. PMID 22505629. S2CID 1899247.
дальнейшее чтение
- Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID 8889548.
- Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
- Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Комуро А., Хорват С.М. (2007). «РНК- и вируснезависимое ингибирование противовирусной передачи сигналов с помощью РНК-геликазы LGP2». Дж. Вирол. 80 (24): 12332–42. Дои:10.1128 / JVI.01325-06. ЧВК 1676302. PMID 17020950.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 17 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |