La домен - La domain
| La домен | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 структура раствора la домена связывающего c-mpl белка | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | Ла | ||||||||
| Pfam | PF05383 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR006630 | ||||||||
| УМНЫЙ | ЦПН | ||||||||
| PROSITE | PDOC00280 | ||||||||
| МЕРОПЫ | I75 | ||||||||
| SCOP2 | 2mpr / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| TCDB | 1.B.3 | ||||||||
| CDD | cd07323 | ||||||||
| |||||||||
В молекулярной биологии La домен это консервированный белковый домен.
Человек 60 кДа SS-A / Ro рибонуклеопротеины (RNP) состоят из одного из четырех малых Y РНК и как минимум два белки, Ro60 и Ла. Белок La - это 47 кДа полипептид который часто действует как аутоантиген в системная красная волчанка и Синдром Шегрена.[1] в ядро, La действует как РНК-полимераза III (RNAP III) фактор транскрипции, а в цитоплазма, La действует как перевод фактор.[2] В ядре La связывает к 3'UTR зарождающейся RNAP III стенограммы чтобы помочь в складывании и созревании.[3] В цитоплазме La распознает определенные классы мРНК которые содержат 5'-концевой олигопиримидиновый (5'TOP) мотив, известный как контролирующий синтез белка.[4] Специфическое признание опосредовано N-концевой домен La, который включает мотив La и Мотив распознавания РНК (RRM). Мотив La принимает альфа / бета складывать который включает крылатая спираль мотив.[5]
Гомологичный La домен, содержащий белки были идентифицированы в широком диапазоне организмы Кроме Археи, бактерии и вирусы.[6]
использованная литература
- ^ Идзуми Р. Э., Дас С., Барат Б., Райчаудхури С., Дасгупта А. (апрель 2004 г.). «Пептид из аутоантигена La блокирует независимую от кэп-трансляции трансляцию полиовируса и вируса гепатита С и выявляет единственный тирозин, критически важный для связывания La РНК и стимуляции трансляции». Дж. Вирол. 78 (7): 3763–76. Дои:10.1128 / jvi.78.7.3763-3776.2004. ЧВК 371053. PMID 15016896.
- ^ Intine RV, Тененбаум С.А., Сакулич А.Л., Кин Д.Д., Марайя Р.Дж. (ноябрь 2003 г.). «Дифференциальное фосфорилирование и субклеточная локализация La RNPs, связанных с предшественниками тРНК и трансляционных мРНК». Мол. Ячейка. 12 (5): 1301–7. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00429-5. PMID 14636586.
- ^ Альфано С., Санфеличе Д., Бабон Дж., Келли Дж., Джекс А., Карри С., Конте М.Р. (апрель 2004 г.). «Структурный анализ кооперативного связывания РНК мотивом La и центральным доменом RRM человеческого белка La». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (4): 323–9. Дои:10.1038 / nsmb747. PMID 15004549. S2CID 24034320.
- ^ Кин JD (декабрь 2003 г.). «Посттранскрипционная генерация макромолекулярных комплексов». Мол. Ячейка. 12 (6): 1347–9. Дои:10.1016 / S1097-2765 (03) 00496-9. PMID 14690589.
- ^ Kenan DJ, Кин JD (апрель 2004 г.). «Ла получает свои крылья». Nat. Struct. Мол. Биол. 11 (4): 303–5. Дои:10.1038 / nsmb0404-303. PMID 15048103. S2CID 8623162.
- ^ Лин-Марк Н., Кларксон С. Г. (январь 1995 г.). «Белок, связывающий дрожжевую РНК, напоминающий аутоантиген человека La». J. Mol. Биол. 245 (2): 81–5. Дои:10.1006 / jmbi.1994.0008. PMID 7799435.