Мотив Лактис-плазмиды РНК - Lactis-plasmid RNA motif

лактис-плазмидная РНК
Лактис-плазмида-РНК.svg
Консенсусная вторичная структура лактис-плазмидные РНК
Идентификаторы
Символлактис-плазмидная РНК
РфамRF01742
Прочие данные
РНК типмРНК
Домен (ы)молочнокислые бактерии
PDB структурыPDBe

В лактис-плазмидный мотив РНК консервированный РНК структура идентифицирована биоинформатика.[1] РНК ограничены молочнокислые бактерии, и особенно часто встречаются в Lactococcus lactis. Обычно они лежат рядом с repB гены и почти встречаются в плазмиды. Эти данные позволяют предположить, что лактис-плазмидные РНК участвуют в контроле численности плазмид.[2] Однако многие плазмиды, несущие лактис-плазмидные РНК также несут ctRNA -pND324 РНК, которые участвуют в регуляции количества копий плазмиды. Следовательно лактис-плазмидные РНК могут иметь иную функцию.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК  2864571. PMID  20230605.
  2. ^ Ким К., Мейер Р.Дж. (октябрь 1986 г.). «Число копий плазмиды R1162 широкого диапазона хозяев регулируется малой РНК». Нуклеиновые кислоты Res. 14 (20): 8027–8046. Дои:10.1093 / нар / 14.20.8027. ЧВК  311832. PMID  2430262.

внешняя ссылка