Мотив ManA РНК - Википедия - ManA RNA motif
| manA РНК | |
|---|---|
 Консенсусная вторичная структура manA РНК | |
| Идентификаторы | |
| Символ | manA РНК |
| Рфам | RF01745 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | СНГ-регулирующий элемент |
| Домен (ы) | Фотобактерии |
| PDB структуры | PDBe |
В manA Мотив РНК (также называемый manA) относится к сохраненному РНК структура, которая была идентифицирована биоинформатика.[1][2] Экземпляры manA Мотив РНК обнаружен в бактерии в род Фотобактерии и фаги которые заражают определенные виды цианобактерии. Однако наиболее предсказуемые manA Последовательности РНК происходят из ДНК собран из невозделываемых морские бактерии. Почти все manA РНК расположены так, что могут находиться в 5 'непереведенные регионы из белок -кодирование гены, поэтому было высказано предположение, что manA РНК функционируют как цис-регуляторные элементы. Учитывая относительную сложность их вторичная структура, и их гипотеза СНГ-регулирующая роль, они могут быть рибопереключатели.
Считается, что гены регулируются manA РНК чаще всего участвуют в метаболизм сахаров фруктоза и манноза, синтез нуклеотиды, бактериальный фотосинтез и класс протеина шапероны известный как ibpA. manA РНК также часто соседствуют с переносить РНК, и, вероятно, записаны вместе с ними. Хотя эти гены не считаются типичными для фагов, ранее было замечено, что фаги, инфицирующие цианобактерии, обычно включают такие гены.[3][4][5]
Рекомендации
- ^ Вайнберг З., Перро Дж., Мейер М.М., Брейкер Р.Р. (декабрь 2009 г.). «Исключительные структурированные некодирующие РНК, выявленные с помощью анализа бактериального метагенома». Природа. 462 (7273): 656–659. Дои:10.1038 / природа08586. ЧВК 4140389. PMID 19956260.
- ^ Вайнберг З., Ван Дж. Х, Бог Дж. И др. (Март 2010 г.). «Сравнительная геномика обнаруживает 104 кандидата структурированных РНК из бактерий, архей и их метагеномов». Геном Биол. 11 (3): R31. Дои:10.1186 / gb-2010-11-3-r31. ЧВК 2864571. PMID 20230605.
- ^ Салливан МБ, Коулман М.Л., Вейгеле П., Ровер Ф., Чизхолм С.В. (май 2005 г.). «Три генома Prochlorococcus cyanophage: характерные особенности и экологическая интерпретация». ПЛОС Биол. 3 (5): e144. Дои:10.1371 / journal.pbio.0030144. ЧВК 1079782. PMID 15828858.
- ^ Ровер Ф., Тербер Р.В. (май 2009 г.). «Вирусы манипулируют морской средой». Природа. 459 (7244): 207–212. Дои:10.1038 / природа08060. PMID 19444207. S2CID 4397295.
- ^ Линделл Д., Джаффе Дж. Д., Коулман М.Л. и др. (Сентябрь 2007 г.). «Полногеномная динамика экспрессии морского вируса и хозяина обнаруживает особенности совместной эволюции». Природа. 449 (7158): 83–86. Дои:10.1038 / природа06130. PMID 17805294.
внешняя ссылка
 | Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |