Marseilleviridae - Marseilleviridae

Marseilleviridae
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Nucleocytoviricota
Учебный класс:Megaviricetes
Заказ:Pimascovirales
Семья:Marseilleviridae
Роды

Marseilleviridae это семья из вирусы Впервые назван в 2012 году.[1] В геномы из этих вирусов двухцепочечная ДНК. Амеба часто хозяева, но есть свидетельства того, что они находятся в люди также.[2][3][4][5] По состоянию на 2016 г. Международный комитет по таксономии вирусов распознают четыре вида в этом семействе, разделенных на 2 рода.[6][7] Он является членом нуклеоцитоплазматические большие ДНК-вирусы клады.

Таксономия

Группа: dsDNA

[7]

Связанные вирусы

Изображения замороженных Marseilleviridae частицы (слева и в центре) и увеличенная диаграмма структуры около вершины. Черные стрелки указывают на большие плотные тела. Белые стрелки указывают липидный бислой.

С тех пор были обнаружены дополнительные виды.[1] Был назван первый признанный член этой семьи Acanthamoeba polyphaga marseillevirus. Второй член Acanthamoeba castellanii lausannevirus. Были выделены еще два вируса, но имена еще не названы. Другой член этой семьи был изолирован от доноров крови.[4] Изолят от насекомых—Инсектомима вирус - также сообщалось.[8]

Похоже, что вирусы делятся как минимум на 3 линии происхождения: (1) Марсельлевирус и Cannes8virus (2) Инсектомима и Тунисвирус и (3) Лозанневирус. Шестой потенциальный член этой семьи -Мельбурневирус- похоже, относится к Марсельлевирус/Cannes8virus клады.[9]

Сообщалось о седьмом вирусе - Brazilian Marseillevirus.[10] Этот вирус, по-видимому, принадлежит к четвертой линии вирусов этого семейства.

Сообщалось также о другом вирусе - Tokyovirus.[11]

Еще один член этого семейства - курлавирус.[12]


Этот таксон был переработан.[13] В настоящее время известно пять линий передачи (A-E).

Lineage A

Lineage B

Lineage C

Lineage D

Lineage E

Другой предполагаемый член этой семьи - Марсельлевирус Шанхай. Если этот вирус подтвердится, он будет принадлежать к линии A.

Структура

Вирусы Marseilleviridae имеют форму икосаэдра. Диаметр около 250 нм. Геномы имеют круглую форму, около 372 килобайт в длину. В геноме 457 открытых рамок считывания.[6]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
Не назначенХвост-ХвостТ = 16Без оболочкиЛинейныйОдночастный
МарсельлевирусИкосаэдрКруговой

Жизненный цикл

Транскрипция с использованием шаблонов ДНК - это метод транскрипции. Амеба служит естественным хозяином.[6]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
МарсельлевирусАмебаНиктоСлияниеЛизисЦитоплазмаЦитоплазмаРаспространение в воде

Геномика

Было обнаружено, что промоторная последовательность AAATATTT связана с 55% идентифицированных генов этого вируса.[14] Большинство этих последовательностей встречается в нескольких копиях.

История

Один из первых представителей этого семейства был описан в 2009 году.[15] Остальные члены описаны примерно тогда (2007 г.) и с тех пор были задокументированы.[16]

Рекомендации

  1. ^ а б Колсон, Филипп; Паньье, Изабель; Юсуф, Нияз; Фурнус, Гислен; Ла Скола, Бернар; Рауль, Дидье (2012). "'Marseilleviridae ', новое семейство гигантских вирусов, заражающих амебы ". Архив вирусологии. 158 (4): 915–20. Дои:10.1007 / s00705-012-1537-y. PMID  23188494.
  2. ^ Ла Скола, Бернар (2014). «Взгляд на протистов как на источник патогенных вирусов». Микробный патогенез. 77: 131–5. Дои:10.1016 / j.micpath.2014.09.005. PMID  25218687.
  3. ^ Колсон, Филипп; Фанселло, Лаура; Гименес, Грегори; Армугом, Фабрис; Desnues, Кристель; Фурнус, Гислен; Юсуф, Нияз; Миллион, Матье; Ла Скола, Бернар; Рауль, Дидье (2013). «Доказательства мегавирома у человека». Журнал клинической вирусологии. 57 (3): 191–200. Дои:10.1016 / j.jcv.2013.03.018. PMID  23664726.
  4. ^ а б Попгеоргиев, Николай; Бойер, Микаэль; Фанселло, Лаура; Монтейл, Соня; Роберт, Кэтрин; Заклепка, Ромен; Наппез, Клод; Азза, Саид; Кьярони, Жак; Рауль, Дидье; Desnues, Кристель (2013). «Марсельоподобный вирус, выделенный из крови, сданной бессимптомными людьми». Журнал инфекционных болезней. 208 (7): 1042–50. Дои:10.1093 / infdis / jit292. PMID  23821720.
  5. ^ Ахерфи, Сара; Колсон, Филипп; Одоли, Жиль; Наппез, Клод; Ксерри, Люк; Валенси, Одри; Миллион, Матье; Лепиди, Юбер; Костелло, Реджис; Рауль, Дидье (2016). «Марсельвирус в лимфоме: гигант в лимфатическом узле». Ланцетные инфекционные болезни. 16 (10): e225 – e234. Дои:10.1016 / S1473-3099 (16) 30051-2. PMID  27502174.
  6. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 12 августа 2015.
  7. ^ а б «Таксономия вирусов: выпуск 2016 г.». ICTV. Получено 6 июля 2017.
  8. ^ Бугалми, Мондхер; Паньье, Изабель; Ахерфи, Сара; Колсон, Филипп; Рауль, Дидье; Ла Скола, Бернар (2013). "Первое выделение марсельлевируса у Diptera Syrphidae Эристалис Tenax ". Интервирология. 56 (6): 386–94. Дои:10.1159/000354560. PMID  24157885.
  9. ^ Doutre, G; Philippe, N; Абергель, К; Клавери, Дж. М. (2014). «Анализ генома первого представителя Marseilleviridae из Австралии показывает, что большинство его генов способствует адаптации вируса». Журнал вирусологии. 88 (24): 14340–9. Дои:10.1128 / JVI.02414-14. ЧВК  4249118. PMID  25275139.
  10. ^ Дорнас, Фабио; Ассис, Фелипе; Ахерфи, Сара; Арантес, Талита; Абрахао, Йонатас; Колсон, Филипп; Ла Скола, Бернар (2016). «Бразильский Marseillevirus является членом-основателем линии в семье Marseilleviridae». Вирусы. 8 (3): 76. Дои:10.3390 / v8030076. ЧВК  4810266. PMID  26978387.
  11. ^ Такемура, Масахару (2016). "Проект последовательности генома Tokyovirus, член семьи Marseilleviridae Изолирован от реки Аракава в Токио, Япония ". Анонсы генома. 4 (3): e00429–16. Дои:10.1128 / genomeA.00429-16. ЧВК  4901213. PMID  27284144.
  12. ^ Чаттерджи, Анирван; Кондабагил, Киран (2017). «Полная последовательность генома курлавируса, нового члена семейства Marseilleviridae, выделенного в Мумбаи, Индия». Архив вирусологии. 162 (10): 3243. Дои:10.1007 / s00705-017-3469-z. PMID  28685284.
  13. ^ Fabre E, Jeudy S, Santini S, Legendre M, Trauchessec M, Claverie JM и др. (2017). Репликация нумеавируса зависит от временного удаленного управления ядром хозяина. Нац Коммуна 8: 15087
  14. ^ Оливейра, Грациэле Перейра; Лима, Маурисио Тейшейра; Арантес, Талита Соуза; Ассис, Фелипе Лопес; Родригес, Родриго Араужо Лима; Да Фонсека, Флавиу Гимарайнш; Бонжардим, Клаудио Антонио; Крун, Эрна Геессиен; Колсон, Филипп; Ла Скола, Бернар; Абрахао, Жонатас Сантос (2017). «Исследование промоторных последовательностей марсельвирусов выявляет поразительное изобилие мотива AAATATTT в межгенных областях». Журнал вирусологии. 91 (21): e01088–17. Дои:10.1128 / JVI.01088-17. ЧВК  5640848. PMID  28794030.
  15. ^ Boyer, M; Ютин, Н; Pagnier, I; Баррасси, L; Fournous, G; Espinosa, L; Роберт, C; Azza, S; Солнце, S; Россманн, М. Г.; Сюзан-Монти, М; Ла Скола, B; Кунин, Э. В; Рауль, Д. (2009). «Гигантский марсельский вирус подчеркивает роль амеб как плавильного котла в появлении химерных микроорганизмов». Труды Национальной академии наук. 106 (51): 21848–53. Bibcode:2009PNAS..10621848B. Дои:10.1073 / pnas.0911354106. ЧВК  2799887. PMID  20007369.
  16. ^ Ахерфи, Сара; Ла Скола, Бернар; Паньье, Изабель; Рауль, Дидье; Колсон, Филипп (2014). «Расширяющееся семейство Marseilleviridae». Вирусология. 466-467: 27–37. Дои:10.1016 / j.virol.2014.07.014. PMID  25104553.

внешняя ссылка