MethBase - MethBase

MethBase
Database.png
Содержание
ОписаниеБаза данных для одного цитозин разрешающая способность Метилирование ДНК данные и связанные аннотации.
ОрганизмыЧеловек
Шимпанзе
Горилла
Макака-резус
Мышь
Арабидопсис
Связаться с нами
ЛабораторияЭндрю Д. Смит
Основное цитированиеЦян Сонг и др. (2013) [1]
Дата выхода2013
Доступ
Формат данныхTrackhub на Браузер генома UCSC
Интернет сайтhttp://smithlabresearch.org/software/methbase/

MethBase это база данных Метилирование ДНК данные получены из секвенирование следующего поколения данные.[1] MethBase обеспечивает визуализацию общедоступных бисульфитное секвенирование и бисульфитное секвенирование с пониженным представлением эксперименты через Браузер генома UCSC. Содержимое MethBase включает одно-CpG сайт разрешения уровней метилирования для каждого сайта CpG в геном Представляет интерес аннотация областей гипометилирования, часто связанных с промоторы генов, и аннотация аллель -специфическое метилирование, связанное с геномный импринтинг.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Сун, Цян; Decato Benjamin E; Хонг Элизабет; Чжоу Мэн; Fang Fang; Цюй Цзянхань; Гарвин Тайлер; Кесслер Майкл; Чжоу Цзюнь; Смит Эндрю Д. (декабрь 2013 г.). «Справочная база данных метиломов и конвейер анализа для облегчения интегративной и сравнительной эпигеномики». PLoS ONE. 8 (12): e81148. Bibcode:2013PLoSO ... 881148S. Дои:10.1371 / journal.pone.0081148. ЧВК  3855694. PMID  24324667.

внешняя ссылка