Цитозин - Википедия - Cytosine

Не путать с цистеин, цистин, цитизин, или же цитидин.
Цитозин
Химическая структура цитозина.svg
Цитозин-3D-шары.png
Цитозин-3D-vdW.png
Имена
Название ИЮПАК
4-аминопиримидин-2 (1ЧАС)-один
Другие имена
4-амино-1ЧАС-пиримидин-2-он
Идентификаторы
3D модель (JSmol )
ЧЭБИ
ЧЭМБЛ
ChemSpider
ECHA InfoCard100.000.681 Отредактируйте это в Викиданных
КЕГГ
MeSHЦитозин
UNII
Характеристики
C4ЧАС5N3О
Молярная масса111,10 г / моль
Плотность1,55 г / см3 (рассчитано)
Температура плавления От 320 до 325 ° C (от 608 до 617 ° F; от 593 до 598 K) (разлагается)
Кислотность (пKа)4,45 (вторичный), 12,2 (первичный)[1]
-55.8·10−6 см3/ моль
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
проверитьY проверять (что проверитьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

Цитозин (/ˈsаɪтəˌsяп,-ˌzяп,-ˌsɪп/;[2][3] C) - одна из четырех основных баз, найденных в ДНК и РНК, вместе с аденин, гуанин, и тимин (урацил в РНК). Это пиримидин производная, с гетероциклический ароматическое кольцо и два присоединенных заместителя ( амин группа в позиции 4 и кето группа в позиции 2). В нуклеозид цитозина цитидин. В Уотсон-Крике базовая пара, он образует три водородные связи с гуанин.

История

Цитозин был открыт и назван Альбрехт Коссель и Альбертом Нойманом в 1894 году, когда он был гидролизован из теленка вилочковая железа ткани.[4][5] Структура была предложена в 1903 году и была синтезирована (и таким образом подтверждена) в лаборатории в том же году.

В 1998 году цитозин был использован для ранней демонстрации квантовая обработка информации когда исследователи Оксфордского университета внедрили Алгоритм Дойча-Йозса на двух кубит квантовый компьютер ядерного магнитного резонанса (NMRQC).[6]

В марте 2015 года ученые НАСА сообщили об образовании цитозина вместе с урацилом и тимином из пиримидин в лабораторных условиях, подобных космическим, что представляет интерес, поскольку пиримидин был обнаружен в метеоритах, хотя его происхождение неизвестно.[7]

Химические реакции

Цитозин
Гуанин
Цитозин и гуанин с указанием направления водородных связей (стрелка указывает положительный заряд на отрицательный).
Метилирование цитозина происходит на углероде номер 5.

Цитозин можно найти как часть ДНК, как часть РНК или как часть нуклеотид. В качестве цитидинтрифосфат (CTP), он может действовать как кофактор для ферментов и может передавать фосфат для преобразования аденозиндифосфат (ADP) в аденозинтрифосфат (АТФ).

В ДНК и РНК цитозин соединен с гуанин. Однако он по своей природе нестабилен и может превращаться в урацил (самопроизвольное дезаминирование ). Это может привести к точечная мутация если не отремонтировать Ремонт ДНК ферменты такие как урацилгликозилаза, которая расщепляет урацил в ДНК.

Цитозин также может быть метилированный в 5-метилцитозин ферментом, называемым ДНК-метилтрансфераза или быть метилированным и гидроксилированный сделать 5-гидроксиметилцитозин. Разница в скорости дезаминирования цитозина и 5-метилцитозина (до урацила и тимин ) составляет основу бисульфитное секвенирование.[8]

Биологическая функция

Когда нашли третье место в кодон из РНК цитозин является синонимом урацил, так как они взаимозаменяемы как третье основание. Когда третье основание встречается как второе основание в кодоне, оно всегда взаимозаменяемо. Например, UCU, UCC, UCA и UCG - все серин, независимо от третьей базы.

Активное ферментативное дезаминирование цитозина или 5-метилцитозина АПОБЕК Семейство цитозиндезаминаз может иметь как положительные, так и отрицательные последствия для различных клеточных процессов, а также для эволюции организма.[9] С другой стороны, влияние дезаминирования на 5-гидроксиметилцитозин остается менее изученным.

Теоретические аспекты

Цитозин не был обнаружен в метеоритах, что позволяет предположить, что первые цепи РНК и ДНК пришлось искать в другом месте, чтобы получить этот строительный блок. Цитозин, вероятно, образовался в некоторых родительских телах метеоритов, однако не сохранялся в этих телах из-за эффективного дезаминирование реакция на урацил.[10]

Рекомендации

  1. ^ Dawson, R.M.C .; и другие. (1959). Данные для биохимических исследований. Оксфорд: Clarendon Press.
  2. ^ «Цитозин». Dictionary.com Несокращенный. Случайный дом.
  3. ^ «Цитозин». Словарь Merriam-Webster.
  4. ^ А. Коссель и Альберт Нойман (1894) "Darstellung und Spaltungsprodukte der Nucleïnsäure (Adenylsäure)" (Получение и продукты расщепления нуклеиновых кислот (аденовая кислота)), Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft zu Berlin, 27 : 2215–2222. Название «цитозин» придумано на странице 2219: "… Ein Produkt von basechen Eigenschaften, für welches wir den Namen" Cytosin "vorschlagen." (… Продукт с основными свойствами, для которого мы предлагаем название «цитозин».)
  5. ^ Kossel, A .; Steudel, H.Z. (1903). "Weitere Untersuchungen über das Cytosin". Physiol. Chem. 38 (1–2): 49–59. Дои:10.1515 / bchm2.1903.38.1-2.49.
  6. ^ Jones, J.A .; М. Моска (1998-08-01). «Реализация квантового алгоритма на квантовом компьютере ядерного магнитного резонанса». J. Chem. Phys. 109 (5): 1648–1653. arXiv:Quant-ph / 9801027. Дои:10.1063/1.476739. Архивировано из оригинал на 2008-06-12. Получено 2007-10-18.
  7. ^ Марлер, Рут (3 марта 2015 г.). «НАСА Эймс воспроизводит строительные блоки жизни в лаборатории». НАСА. Получено 5 марта 2015.
  8. ^ Хаяцу, Хикоя (2008). «Открытие опосредованного бисульфитом превращения цитозина в урацил, ключевой реакции для анализа метилирования ДНК - Личный кабинет». Труды Японской академии. Серия B, Физические и биологические науки. 84 (8): 321–330. Bibcode:2008PJAB ... 84..321H. Дои:10.2183 / pjab.84.321. ISSN  0386-2208. ЧВК  3722019. PMID  18941305.
  9. ^ Chahwan R .; Вонтакал С.Н .; Роа С. (2010). «Перекрестное взаимодействие между генетической и эпигенетической информацией через дезаминирование цитозина». Тенденции в генетике. 26 (10): 443–448. Дои:10.1016 / j.tig.2010.07.005. PMID  20800313.
  10. ^ Таскер, Элизабет. "Семена жизни пришли из космоса?". Сеть блогов Scientific American. Получено 2016-11-24.

Внешние ссылки и цитаты