Метилацидифилум инфернорум - Methylacidiphilum infernorum

Метилацидифилум инфернорум
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Веррукомикробия
Учебный класс:
Неклассифицированный
Заказ:
Methylacidiphilales
Семья:
Метилацидифиловые
Род:
Метилацидифил
Разновидность:
М. инфернорум
Биномиальное имя
Метилацидифилум инфернорум
Hou et al. 2008 г.
Тип штамма
Изолировать V4
Синонимы

Methylokorus infernorum Dunfield et al. 2007 г.
Штамм V4 Dunfield et al. 2007 г.
Candidatus Methylacidiphilum infernorum Hou et al.

Метилацидифилум инфернорум чрезвычайно ацидофильный метанотрофный аэробный бактерии, впервые выделенные и описанные в 2007 г., растущие на почве и отложениях на Врата ада, Новая Зеландия.[1][2][3] Подобные организмы также были изолированы на геотермальных участках на Италия и Россия.

А полиэкстремофил, эти неподвижные стержни оптимально растут при pH от 2,0 до 2,5 и температура 60 ° С. Это метанотрофный обязательные бактерии, которые растут на 25% (об. / об.) метан в воздухе. Это также очень зависит от углекислый газ концентрации для роста, оптимально на 8% (об. / об.) СО2 в воздухе.[1]

Из-за его классификации в типе Веррукомикробия и его экстремальный ацидофильный фенотип М. инфернорум уникален среди всех известных метанотрофы.[1]

Биология

Геном

У него одна круговая хромосома из 2287145 пар оснований. При геномном анализе было установлено, что М. инфернорум может использовать роман метилотрофный путь потому что он кодирует метанмонооксигеназа ферменты, но отсутствуют известные генетические модули для окисления метанола и формальдегида.[1][4]

Все ферменты, необходимые для Кальвин Бенсон цикл Бассема были идентифицированы генетическим анализом.[5]

Метаболизм

Было предсказано, что М. инфернорум обладают большинством ключевых метаболических путей биосинтеза всех аминокислот, нуклеотидов и кофакторов, за единственным исключением кобаламин кофактор.[5]

Генетические исследования показали, что ферменты, которые он использует в нескольких метаболических путях, отличается от ферментов, используемых другими метилотрофы как, например, в биосинтезе ароматических аминокислот, биосинтезе липоевой кислоты, цикл мочевины а также по количеству и разнообразию кодируемых переносчиков.[5]

Бактерии способны противодействовать чрезвычайно кислой среде благодаря наличию различных ферментов, таких как глутаматдекарбоксилаза, антипортер глутамата / γ-амиобутирата, аргининдекарбоксилаза и антипортер аргинина / агматина.[5]

Рекомендации

  1. ^ а б c d Питер Д. и др. (2007). «Окисление метана чрезвычайно ацидофильной бактерией типа Verrucomicrobia». Природа. 450 (7171): 879–882. Bibcode:2007Натура.450..879Д. Дои:10.1038 / природа06411. PMID  18004300.
  2. ^ Ноэль Р. Криг; Вольфганг Людвиг; Уильям Уитмен; Брайан П. Хедлунд; Брюс Дж. Пастер; Джеймс Т. Стейли; Наоми Уорд; Дэниел Браун, ред. (2011). Руководство Бергей по систематической бактериологии: Том 4: Bacteroidetes, Spirochaetes, Tenericutes (Mollicutes), Acidobacteria, Fibrobacteres, Fusobacteria, Dictyoglomi, Gemmatimonadetes, Lentisphaerae, Verrucomicrobia, Chlamydomycetes и Planet. Springer Science & Business Media. С. 795–6. ISBN  978-0-387-68572-4.
  3. ^ Малгожата Павловска (22 апреля 2014 г.). Снижение выбросов свалочного газа. CRC Press. п. 64. ISBN  978-0-415-63077-1.
  4. ^ Хэнсон Р., Хэнсон Т. (1996). «Метанотрофные бактерии». Microbiol. Rev. 60 (2): 439–471. Дои:10.1128 / MMBR.60.2.439-471.1996. ЧВК  239451. PMID  8801441.
  5. ^ а б c d Hou S, et al. (2008). «Полная последовательность генома чрезвычайно ацидофильного изолята метанотрофа V4, Methylacidiphilum infernorum, представителя бактериального типа Verrucomicrobia». Биол. Прямой. 3 (26): 26. Дои:10.1186/1745-6150-3-26. ЧВК  2474590. PMID  18593465.

внешняя ссылка