Натриальба - Википедия - Natrialba

Натриальба
Научная классификация
Домен:
Королевство:
Тип:
Учебный класс:
Заказ:
Семья:
Род:
Натриальба

Камекура и Дьялл-Смит 1996[1]
Разновидность

В таксономия, Натриальба это род из Галобактерии.[4] Род состоит из множества разнообразных видов, которые могут выжить в экстремальных экологических нишах, особенно они способны жить в водах, насыщенных или почти насыщенных солью (галофилы ).[5][6] У них есть определенные приспособления к жизни в соленой среде. Например, их клеточный аппарат адаптирован к высоким концентрациям соли за счет заряженного аминокислоты на их поверхности, позволяя клетке удерживать молекулы воды вокруг этих компонентов. Осмотическое давление и эти аминокислоты помогают контролировать количество соли в клетка.[7]

Например, N. magadii является аэробный хемоорганотрофный, двойной экстремофил требующие щелочных условий и повышенной солености для оптимального роста. Эти суровые условия привели к изменению состава заряженных аминокислот в белки (средний изоэлектрическая точка составляет всего 4,64, тогда как у других организмов среднее значение составляет 6,5), при этом почти все белки имеют высокую кислотность.[8] В геном из N. magadii состоит из четырех репликоны с общей последовательностью 4 443 643 п.н. и кодирует 4 212 предполагаемых белков. Анализ генома выявил несколько гены кодирующие предполагаемые белки, участвующие в адаптации к гиперсолености, стрессовой реакции, гликозилирование, и полисахарид биосинтез. Кроме того, управляемый протонами АТФ-синтаза и множество предполагаемых цитохромы и другие белки, необходимые для аэробного дыхания и перенос электронов был найден. Геном кодирует ряд предполагаемых протеазы / пептидазы.[9]

Их устойчивость к соли позволяет использовать некоторых представителей этого рода в биотехнологических процессах.[10]

Рекомендации

  1. ^ Камекура, М .; Seno, Y .; Дьял-Смит, М. (1996-05-23). «Галолизин R4, сериновая протеиназа из галофильной археи Haloferax mediterranei; клонирование, экспрессия и структурные исследования генов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 1294 (2): 159–167. Дои:10.1016/0167-4838(96)00016-7. ISSN  0006-3002. PMID  8645734.
  2. ^ Hezayen, F F; Рем, Б. Н; Тиндалл, Би Джей; Steinbüchel, А (2001). «Перенос Natrialba asiatica B1T в Natrialba taiwanensis sp. Nov. И описание Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Нового чрезвычайно галофильного, аэробного, непигментированного представителя архей из Египта, который производит внеклеточную поли (глутаминовую кислоту)». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (3): 1133–1142. Дои:10.1099/00207713-51-3-1133. PMID  11411682.
  3. ^ Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Чжоу, П .; Май.; Ventosa, A .; Грант, В. Д. (сентябрь 2001 г.). «Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. И Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Новые галоалкалифильные археи из содовых озер в автономном районе Внутренняя Монголия, Китай». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (Pt 5): 1693–1698. Дои:10.1099/00207713-51-5-1693. ISSN  1466-5026. PMID  11594597.
  4. ^ Увидеть NCBI сайт на Натриальбе. Данные извлечены из "Ресурсы таксономии NCBI". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 2007-03-19.
  5. ^ КАМЕКУРА, МАСАХИРО; ДАЙЛЛ-СМИТ, МАЙКЛ Л. (1995). «Таксономия семейства Halobacteriaceae и описание двух новых родов Halorubrobacterium и Natrialba». Журнал общей и прикладной микробиологии. 41 (4): 333–350. Дои:10.2323 / jgam.41.333. ISSN  0022-1260.
  6. ^ Камекура, М .; Dyall-Smith, M. L .; Упасани, В .; Ventosa, A .; Кейтс, М. (июль 1997 г.). "Разнообразие алкалифильных галобактерий: предложения по переносу Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii и Natronobacterium pharaonis на Halorubrum, Natrialba и Natronomonas gen. Nov., Соответственно, как Halorubrum vacuolatum. Nov. И Natronba magad. Nov. pharaonis comb. nov., соответственно ". Международный журнал систематической бактериологии. 47 (3): 853–857. Дои:10.1099/00207713-47-3-853. ISSN  0020-7713. PMID  9226918.
  7. ^ Рид, Кристофер Дж .; Льюис, Хантер; Трехо, Эрик; Уинстон, Верн; Эвилия, Кэрин (2013). «Белковые адаптации у архей-экстремофилов». Археи. 2013: 373275. Дои:10.1155/2013/373275. ISSN  1472-3646. ЧВК  3787623. PMID  24151449.
  8. ^ Козловский, Лукаш П. (04.01.2017). "Proteome-pI: база данных изоэлектрических точек протеома". Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D1112 – D1116. Дои:10.1093 / нар / gkw978. ЧВК  5210655. PMID  27789699.
  9. ^ Сиддарамаппа, Шивакумара; Challacombe, Жан Ф .; Декастро, Розана Э .; Пфайффер, Фридхельм; Састре, Диего Э .; Хименес, Мария I .; Паджи, Роберто А .; Деттер, Джон С .; Давенпорт, Карен В. (2012-05-04). «Сравнительный взгляд на геномику генетического содержания алкалифильной галоархеи Natrialba magadii ATCC 43099T». BMC Genomics. 13: 165. Дои:10.1186/1471-2164-13-165. ЧВК  3403918. PMID  22559199.
  10. ^ Кеббуш-Гана, Салима; Гана, Мохамед Ламин; Ферриун, Имен; Хемили, Суад; Ленчи, Несрин; Акмоуси-Туми, Сихем; Буанане-Даренфед, Набила Амель; Джелали, Насер-Эддин (01.11.2013). «Производство биосурфактанта на сыром финиковом сиропе в солевых условиях захваченными клетками штамма E21 Natrialba sp., Чрезвычайно галофильной бактерии, выделенной из солнечного солярия (Айн Салах, Алжир)» Экстремофилов. 17 (6): 981–993. Дои:10.1007 / s00792-013-0580-2. ISSN  1431-0651. PMID  24061687.

дальнейшее чтение

Научные журналы

Научные книги

  • Гиббонс, NE (1974). «Семейство V. Halobacteriaceae fam. Nov.». В RE Бьюкенен; NE Гиббонс (ред.). Руководство Берджи по детерминантной бактериологии (8-е изд.). Балтимор: The Williams & Wilkins Co.

Научные базы данных

внешняя ссылка