Натриальба - Википедия - Natrialba

Натриальба
Научная классификация
Домен:	Археи
Королевство:	Euryarchaeota
Тип:	Euryarchaeota
Учебный класс:	Галобактерии
Заказ:	Галобактерии
Семья:	Галобактерии
Род:	Натриальба; Камекура и Дьялл-Смит 1996
Разновидность
	N. aegyptia; N. asiatica; Н. chahannaoensis; Н. hulunbeirensis; N. magadii; N. taiwanensis;

В таксономия, Натриальба это род из Галобактерии.^[4] Род состоит из множества разнообразных видов, которые могут выжить в экстремальных экологических нишах, особенно они способны жить в водах, насыщенных или почти насыщенных солью (галофилы ).^[5]^[6] У них есть определенные приспособления к жизни в соленой среде. Например, их клеточный аппарат адаптирован к высоким концентрациям соли за счет заряженного аминокислоты на их поверхности, позволяя клетке удерживать молекулы воды вокруг этих компонентов. Осмотическое давление и эти аминокислоты помогают контролировать количество соли в клетка.^[7]

Например, N. magadii является аэробный хемоорганотрофный, двойной экстремофил требующие щелочных условий и повышенной солености для оптимального роста. Эти суровые условия привели к изменению состава заряженных аминокислот в белки (средний изоэлектрическая точка составляет всего 4,64, тогда как у других организмов среднее значение составляет 6,5), при этом почти все белки имеют высокую кислотность.^[8] В геном из N. magadii состоит из четырех репликоны с общей последовательностью 4 443 643 п.н. и кодирует 4 212 предполагаемых белков. Анализ генома выявил несколько гены кодирующие предполагаемые белки, участвующие в адаптации к гиперсолености, стрессовой реакции, гликозилирование, и полисахарид биосинтез. Кроме того, управляемый протонами АТФ-синтаза и множество предполагаемых цитохромы и другие белки, необходимые для аэробного дыхания и перенос электронов был найден. Геном кодирует ряд предполагаемых протеазы / пептидазы.^[9]

Их устойчивость к соли позволяет использовать некоторых представителей этого рода в биотехнологических процессах.^[10]

Рекомендации

^ Камекура, М .; Seno, Y .; Дьял-Смит, М. (1996-05-23). «Галолизин R4, сериновая протеиназа из галофильной археи Haloferax mediterranei; клонирование, экспрессия и структурные исследования генов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 1294 (2): 159–167. Дои:10.1016/0167-4838(96)00016-7. ISSN 0006-3002. PMID 8645734.
^ Hezayen, F F; Рем, Б. Н; Тиндалл, Би Джей; Steinbüchel, А (2001). «Перенос Natrialba asiatica B1T в Natrialba taiwanensis sp. Nov. И описание Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Нового чрезвычайно галофильного, аэробного, непигментированного представителя архей из Египта, который производит внеклеточную поли (глутаминовую кислоту)». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (3): 1133–1142. Дои:10.1099/00207713-51-3-1133. PMID 11411682.
^ Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Чжоу, П .; Май.; Ventosa, A .; Грант, В. Д. (сентябрь 2001 г.). «Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. И Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Новые галоалкалифильные археи из содовых озер в автономном районе Внутренняя Монголия, Китай». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (Pt 5): 1693–1698. Дои:10.1099/00207713-51-5-1693. ISSN 1466-5026. PMID 11594597.
^ Увидеть NCBI сайт на Натриальбе. Данные извлечены из "Ресурсы таксономии NCBI". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 2007-03-19.
^ КАМЕКУРА, МАСАХИРО; ДАЙЛЛ-СМИТ, МАЙКЛ Л. (1995). «Таксономия семейства Halobacteriaceae и описание двух новых родов Halorubrobacterium и Natrialba». Журнал общей и прикладной микробиологии. 41 (4): 333–350. Дои:10.2323 / jgam.41.333. ISSN 0022-1260.
^ Камекура, М .; Dyall-Smith, M. L .; Упасани, В .; Ventosa, A .; Кейтс, М. (июль 1997 г.). "Разнообразие алкалифильных галобактерий: предложения по переносу Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii и Natronobacterium pharaonis на Halorubrum, Natrialba и Natronomonas gen. Nov., Соответственно, как Halorubrum vacuolatum. Nov. И Natronba magad. Nov. pharaonis comb. nov., соответственно ". Международный журнал систематической бактериологии. 47 (3): 853–857. Дои:10.1099/00207713-47-3-853. ISSN 0020-7713. PMID 9226918.
^ Рид, Кристофер Дж .; Льюис, Хантер; Трехо, Эрик; Уинстон, Верн; Эвилия, Кэрин (2013). «Белковые адаптации у архей-экстремофилов». Археи. 2013: 373275. Дои:10.1155/2013/373275. ISSN 1472-3646. ЧВК 3787623. PMID 24151449.
^ Козловский, Лукаш П. (04.01.2017). "Proteome-pI: база данных изоэлектрических точек протеома". Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D1112 – D1116. Дои:10.1093 / нар / gkw978. ЧВК 5210655. PMID 27789699.
^ Сиддарамаппа, Шивакумара; Challacombe, Жан Ф .; Декастро, Розана Э .; Пфайффер, Фридхельм; Састре, Диего Э .; Хименес, Мария I .; Паджи, Роберто А .; Деттер, Джон С .; Давенпорт, Карен В. (2012-05-04). «Сравнительный взгляд на геномику генетического содержания алкалифильной галоархеи Natrialba magadii ATCC 43099T». BMC Genomics. 13: 165. Дои:10.1186/1471-2164-13-165. ЧВК 3403918. PMID 22559199.
^ Кеббуш-Гана, Салима; Гана, Мохамед Ламин; Ферриун, Имен; Хемили, Суад; Ленчи, Несрин; Акмоуси-Туми, Сихем; Буанане-Даренфед, Набила Амель; Джелали, Насер-Эддин (01.11.2013). «Производство биосурфактанта на сыром финиковом сиропе в солевых условиях захваченными клетками штамма E21 Natrialba sp., Чрезвычайно галофильной бактерии, выделенной из солнечного солярия (Айн Салах, Алжир)» Экстремофилов. 17 (6): 981–993. Дои:10.1007 / s00792-013-0580-2. ISSN 1431-0651. PMID 24061687.

дальнейшее чтение

Научные журналы

Conde, J.D .; Guillen, J .; Nercessian, D .; Ordonez, M.V .; и другие. (Сентябрь 2011 г.). «Определение вторичной структуры с помощью FTIR архейного убиквитин-подобного полипептида из Natrialba magadii». Европейский биофизический журнал. 40 (9): 1101–1107. Дои:10.1007 / s00249-011-0719-у. PMID 21701865.
Орен А; Ventosa A (2000). "Подкомитет Международного комитета по систематической бактериологии по таксономии Halobacteriaceae. Протоколы заседаний, 16 августа 1999 г., Сидней, Австралия". Int. J. Syst. Evol. Микробиол. 50 (3): 1405–1407. Дои:10.1099/00207713-50-3-1405. PMID 10843089.

Научные книги

Гиббонс, NE (1974). «Семейство V. Halobacteriaceae fam. Nov.». В RE Бьюкенен; NE Гиббонс (ред.). Руководство Берджи по детерминантной бактериологии (8-е изд.). Балтимор: The Williams & Wilkins Co.

Научные базы данных

внешняя ссылка

Этот археи -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[1] Камекура, М .; Seno, Y .; Дьял-Смит, М. (1996-05-23). «Галолизин R4, сериновая протеиназа из галофильной археи Haloferax mediterranei; клонирование, экспрессия и структурные исследования генов». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология. 1294 (2): 159–167. Дои:10.1016/0167-4838(96)00016-7. ISSN 0006-3002. PMID 8645734.

[2] Hezayen, F F; Рем, Б. Н; Тиндалл, Би Джей; Steinbüchel, А (2001). «Перенос Natrialba asiatica B1T в Natrialba taiwanensis sp. Nov. И описание Natrialba aegyptiaca sp. Nov., Нового чрезвычайно галофильного, аэробного, непигментированного представителя архей из Египта, который производит внеклеточную поли (глутаминовую кислоту)». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (3): 1133–1142. Дои:10.1099/00207713-51-3-1133. PMID 11411682.

[3] Xu, Y .; Wang, Z .; Xue, Y .; Чжоу, П .; Май.; Ventosa, A .; Грант, В. Д. (сентябрь 2001 г.). «Natrialba hulunbeirensis sp. Nov. И Natrialba chahannaoensis sp. Nov., Новые галоалкалифильные археи из содовых озер в автономном районе Внутренняя Монголия, Китай». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 51 (Pt 5): 1693–1698. Дои:10.1099/00207713-51-5-1693. ISSN 1466-5026. PMID 11594597.

[4] Увидеть NCBI сайт на Натриальбе. Данные извлечены из "Ресурсы таксономии NCBI". Национальный центр биотехнологической информации. Получено 2007-03-19.

[5] КАМЕКУРА, МАСАХИРО; ДАЙЛЛ-СМИТ, МАЙКЛ Л. (1995). «Таксономия семейства Halobacteriaceae и описание двух новых родов Halorubrobacterium и Natrialba». Журнал общей и прикладной микробиологии. 41 (4): 333–350. Дои:10.2323 / jgam.41.333. ISSN 0022-1260.

[6] Камекура, М .; Dyall-Smith, M. L .; Упасани, В .; Ventosa, A .; Кейтс, М. (июль 1997 г.). "Разнообразие алкалифильных галобактерий: предложения по переносу Natronobacterium vacuolatum, Natronobacterium magadii и Natronobacterium pharaonis на Halorubrum, Natrialba и Natronomonas gen. Nov., Соответственно, как Halorubrum vacuolatum. Nov. И Natronba magad. Nov. pharaonis comb. nov., соответственно ". Международный журнал систематической бактериологии. 47 (3): 853–857. Дои:10.1099/00207713-47-3-853. ISSN 0020-7713. PMID 9226918.

[7] Рид, Кристофер Дж .; Льюис, Хантер; Трехо, Эрик; Уинстон, Верн; Эвилия, Кэрин (2013). «Белковые адаптации у архей-экстремофилов». Археи. 2013: 373275. Дои:10.1155/2013/373275. ISSN 1472-3646. ЧВК 3787623. PMID 24151449.

[8] Козловский, Лукаш П. (04.01.2017). "Proteome-pI: база данных изоэлектрических точек протеома". Исследования нуклеиновых кислот. 45 (D1): D1112 – D1116. Дои:10.1093 / нар / gkw978. ЧВК 5210655. PMID 27789699.

[9] Сиддарамаппа, Шивакумара; Challacombe, Жан Ф .; Декастро, Розана Э .; Пфайффер, Фридхельм; Састре, Диего Э .; Хименес, Мария I .; Паджи, Роберто А .; Деттер, Джон С .; Давенпорт, Карен В. (2012-05-04). «Сравнительный взгляд на геномику генетического содержания алкалифильной галоархеи Natrialba magadii ATCC 43099T». BMC Genomics. 13: 165. Дои:10.1186/1471-2164-13-165. ЧВК 3403918. PMID 22559199.

[10] Кеббуш-Гана, Салима; Гана, Мохамед Ламин; Ферриун, Имен; Хемили, Суад; Ленчи, Несрин; Акмоуси-Туми, Сихем; Буанане-Даренфед, Набила Амель; Джелали, Насер-Эддин (01.11.2013). «Производство биосурфактанта на сыром финиковом сиропе в солевых условиях захваченными клетками штамма E21 Natrialba sp., Чрезвычайно галофильной бактерии, выделенной из солнечного солярия (Айн Салах, Алжир)» Экстремофилов. 17 (6): 981–993. Дои:10.1007 / s00792-013-0580-2. ISSN 1431-0651. PMID 24061687.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]