Орхидея пятнистая дихорхавирус - Orchid fleck dichorhavirus
Орхидея пятнистая дихорхавирус | |
---|---|
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Царство: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Негарнавирикота |
Класс: | Monjiviricetes |
Порядок: | Mononegavirales |
Семья: | Rhabdoviridae |
Род: | Дихорхавирус |
Виды: | Орхидея пятнистая дихорхавирус |
Синонимы | |
Вирус пятнистости орхидеи |
Орхидея пятнистая дихорхавирус, обычно называемый вирусом орхидейной пятнистости (OFV), представляет собой сегментированный одноцепочечный (ss) без оболочки РНК отрицательная прядь вирус, переданный ложным пауком клещ, Бревипалпус калифорнийский. OFV вызывает некротические и хлоротичные поражения на листьях[1] многих родов в семье Орхидные.
Введение
Вирус орхидейной пятнистости, несмотря на свое присутствие во всем мире, поражает лишь небольшой круг людей. Орхидеи не используются в пищу, а служат в основном как орнамент. Таким образом, ежегодно о OFV пишется от 2 до 3 научных отчетов. Целый геном OFV была секвенирована, и ее шесть основных белок продукты также были секвенированы.[2]
Многое еще не известно о OFV, в том числе как именно и почему вектор клещи путешествуют от орхидеи к орхидеям и многое другое виды-хозяева цветов открываются ежегодно. Чем больше информации обнаруживают исследователи, тем больше они понимают, что им еще многое предстоит узнать. Многие любители орхидей принимают участие в "гражданская наука "опубликовав свои выводы, связанные с OFV, на международном садоводство блоги и форумы.
Морфология вириона
OFV был впервые описан как палочкообразный [3] но в зависимости от метода подготовки ОФВ может иметь пулевидную или палочковидную форму. В среднем OFV составляет 40 нм в диаметре и от 100 до 150 нм в длину. Каждая вирусная частица организована в виде плотной спирали из 25 витков с шагом около 4,5 нм.[4]
Геномика
OFV содержит две молекулы оцРНК, РНК1 и РНК2, из 6413 и 6001. пар оснований соответственно. GenBank содержит весь секвенированный геном OFV. РНК1 (GenBank AB244417) кодирует пять белков, тогда как РНК2 (GenBank AB244418) кодирует только один.[2] Обе нити обладают открытые рамки для чтения (ORF), которые читаются в отрицательном смысле.
РНК1
- ORF1: белок нуклеокапсид (N)
- ORF2: Фосфопротеин (П)
- ORF3: белки, участвующие в движении вируса от клетки к клетке
- ORF4: Матричный (M) белок
- ORF5: Гликопротеин (Г)
РНК2
- ORF6: белок полимеразы (L) (РНК-зависимая РНК-полимераза )
Патофизиология
Хлоротик и некротические пятна, пятна и / или кольцевые пятна, а также желтые пятна или пятна - все это симптомы OFV инфекция. Исследования также показали, что OFV может предотвращать распространение других вирусов в уже инфицированном OFV растении.[5]
Вектор
Ложный паутинный клещ, Б. калифорнийский служит основным вектором для OFV.[6]Brevipalpus клещи проходят четыре различных активных жизненных этапа, каждая из которых разделена неподвижными куколка этапы.[7] Протонимфа, дейтонимфа и взрослые особи могут инфицировать растения-хозяева OFV, тогда как личинка стадия не заразна.[5] Даже после трех недель инкубация OFV-положительного клеща на OFV-устойчивом растении, Б. калифорнийский оказался заразным, что свидетельствует о стойкости ОФВ.[8]
Хосты
OFV способен естественным образом инфицировать около 50 различных видов 31 рода, принадлежащих к семейству Orchidaceae. 25 других видов из 11 семейств, не являющихся орхидеями, были инфицированы путем передачи сока или искусственной вирусной инокуляции.[5]
Жизненный цикл
Исследования не показали, действительно ли OFV реплицируется в Б. калифорнийский [8] но электронная микроскопия обнаружил замысловатый вирусный жизненный цикл внутри клеток-хозяев.
Вирусная ssRNA реплицируется и записано в мРНК в клетке-хозяине ядро. Затем вирусная мРНК экспортируется из ядра в цитоплазма где он переводится в вирусный белок хозяином рибосомы. Затем вирусные белки повторно входят в ядро, где они объединяются в вироплазма. Там различные структурные белки вируса собираются с обеими цепями оцРНК с образованием полных частиц OFV. Эти частицы часто группируются между внутренним и внешним ядерные мембраны, вызывая видимые выступы, которые часто выходят в цитоплазматический пузырьки. Электронная микроскопия выявила скопления вирусных частиц, расположенных перпендикулярно внутренней ядерной мембране, т.е. эндоплазматический ретикулум, а также вышеупомянутые цитоплазматические пузырьки, образующие характерные структуры «колеса со спицами».[5]
Влияние на фитнес
Зараженные орхидеи цветут не так хорошо, как здоровые, что влияет на эффективность опыление и оплодотворение. Кроме того, цветущие орхидеи выглядят безжизненными, что делает их менее привлекательными на рынке срезанных цветов.[5]
Эпидемиология
Случаи появления вируса орхидейной пятнистости или OF-подобных вирусов зарегистрированы в Австралии, Бразилии, Китае, Колумбии, Коста-Рике, Дании, Германии, Японии, Корее, Южной Африке и США, то есть на всех континентах, кроме Антарктиды.[5]
В связи с тем, что репликация вирусов зависит от их клетки-хозяина, OFV нельзя культивировать независимо. Однако два неорхидных-индикатора-хозяина (растения, используемые в исследованиях, демонстрируют характерные симптомы конкретных вирусных инфекций) C. киноа и T. expansa обычно используются для инокуляции и выделения вирусов.[5]
Нет никаких известных возбудителей самого OFV, кроме его переносчика, Б. калифорнийский имеет симбиотические отношения с бактериями этого рода Кардиний. Симбионт - причина появления клещей. Thelytokous способ размножения (где самки производятся из неоплодотворенных яиц) и объяснение отсутствия самцов Б. калифорнийский клещи.[9]
Диагностика
Образцы тонких тканей растений с видимыми симптомами ОФВ могут подвергаться:[5]
- Электронная микроскопия для визуализации вирионов и полных вирусных частиц
- Серологический анализ для выявления и выделения конкретных вирусные белки
- Обратная транскрипционная полимеразная цепная реакция для идентификации вирусной РНК
Профилактика
Способы предотвращения распространения ОФВ между отдельными растениями:[10]
- Убедитесь, что саженцы не содержат вирусов
- Улучшить карантин меры
- Устраните источники инфекции (клещи или другие зараженные растения)
- Обеспечьте подходящую среду для выращивания
- Работать над созданием устойчивых к OFV растений посредством генная инженерия
лечение
Если растение заражено OFV, неясно, обрезка явно инфицированная ткань вылечит растение от вируса. Также неясно, производят ли инфицированные растения семена, содержащие вирусные частицы.
История
Самая ранняя зарегистрированная работа, касающаяся вируса Orchid Fleck Virus, была опубликована в Японии в 1969 году. О OFV сообщалось как о концентрации коротких стержнеобразных частиц в хлоротичных поражениях на листьях лодочных орхидей этого рода. Цимбидиум.[3]
Актуальность для человека
Орхидеи и другие тропические цветы чрезвычайно важны для сельского хозяйства многих стран. Юго восточный азиат страны. В Ванда 'Мисс Жоаким' гибрид орхидеи Сингапур Национальный цветок. По данным Общества орхидей, мировой рынок орхидей оценивается более чем в 1 миллиард долларов, при этом в 2010 году лидировали Япония и США.[11] В США в 2005 году было произведено орхидей на сумму около 144 миллионов долларов.[12]
использованная литература
- ^ (Образ) Kubo KS, Freitas-Astu´a J, Machado MA, Kitajima EW 2009. Симптомы орхидейной пятнистости могут быть естественным образом вызваны двумя разными вирусами, передающимися Brevipalpus. J Gen Plant Pathol 75:250–255.
- ^ а б Кондо Х., Маеда Т., Ширако Ю., Тамада Т. 2006. Вирус орхидейной пятнистости - это рабдовирус с необычным двудольным геномом. J Gen Virol 87: 2413–2421.
- ^ а б Дой Й, Араи К., Йора К. 1969. Распространение бактериальных вирусных частиц при мозаичной болезни Масаки и болезни кольцевых пятен Cymbidium. Энн Фитопатол Соц Jpn 35: 388.
- ^ Кондо Х, Маеда Т, Тамада Т 2009. Идентификация и характеристика структурных белков вируса пятнистости орхидеи. Arch Virol 154: 37–45.
- ^ а б c d е ж г час Пэн Д.В., Чжэн Г.Х., Чжэн З.З., Тонг QX, Мин YL 2013 Вирус орхидейной пятнистости: неклассифицированный двудольный растительный вирус с отрицательной РНК. Архив вирусологии. 158 (2): 313-323.
- ^ Маэда Т., Кондо Х, Мицухата К., Тамада Т. 1998. Доказательства того, что вирус пятнистости орхидеи устойчиво эффективно передается клещом Brevipalpus californicus. В архиве 2017-12-01 в Wayback Machine В: Proceedings of the 7th Int Cong Plant Pathol, pp 13–18.
- ^ Чайлдерс С.К., Родригес JCV 2011. Обзор клещей Brevipalpus (Acari: Tenuipalpidae) и передаваемых ими вирусов растений Зоосимпозия 6:168–180.
- ^ а б Кондо Х., Маеда Т. и Тамада Т. 2003. Вирус орхидейной пятнистости: передача клещей Brevipalpus californicus, биологические свойства и структура генома. Exp Appl Acarol 30, 215–223. Дои:10.1023 / B: APPA.0000006550.88615.10
- ^ Groot TVM и Breeuwer JAJ 2006. Симбионты Cardinium индуцируют гаплоидные телитоки в большинстве клонов трех близкородственных видов Brevipalpuss. Экспериментальная и прикладная акарология, 39, 257–271.
- ^ Лю Л., Линь З.К., Го Ю. 2010. Прогресс в молекулярной биологии вируса фаленопсиса и соответствующие меры профилактики. Anhui Agric Sci Bull 16 (21–23): 126.
- ^ «Рынок орхидей превысил отметку в 1 миллиард долларов». Общество орхидей. Общество орхидей. 10 июня 2011 г.. Получено 17 сентября 2020.
- ^ Министерство сельского хозяйства США. 2006a. Резюме цветоводства за 2005 год. Совет по сельскохозяйственной статистике, Вашингтон, округ Колумбия