OriDB - OriDB

OriDB
Database.png
Содержание
ОписаниеИсточник репликации ДНК база данных.
ОрганизмыSaccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe
Контакт
ЛабораторияЛаборатория Недушинского.
Основное цитированиеSiow al. (2012)[1]
Дата выхода2006, 2012
Доступ
Интернет сайтhttp://cerevisiae.oridb.org, http://pombe.oridb.org
Разное
ЛицензияСвободный

OriDB это биологическая база данных подтвержденных и прогнозируемых Сайты происхождения репликации ДНК в модельных организмах Saccharomyces cerevisiae и Schizosaccharomyces pombe.[1][2]

База данных происхождения репликации ДНК (OriDB) обеспечивает доступ к упорядоченным опубликованным наборам данных, которые предсказали и / или подтвердили местоположение источников репликации. Каждый потенциальный сайт происхождения репликации указан как подтвержденный, вероятный или сомнительный в зависимости от уровня подтверждающих данных. Для каждого сайта доступна дополнительная информация, в том числе:

  • геномное местоположение исходного сайта;
  • то Последовательность ДНК;
  • графическое изображение исходного сайта, включающее экспериментальные данные;
  • опубликованные исследования, предполагающие происхождение;
  • ссылки на соответствующие оригинальные исследования.

Кроме того, имеется графический просмотрщик, который позволяет пользователям выбирать хромосомные области и отображать выбранные наборы данных. Все оригинальные наборы данных, представленные в OriDB, доступны для скачивания.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Siow, CC; Nieduszynska, SR; Мюллер, Калифорния; Недушинский, Калифорния (январь 2012 г.). «OriDB, база данных происхождения репликации ДНК обновлена ​​и расширена». Исследования нуклеиновых кислот. 40 (Проблема с базой данных): D682-6. Дои:10.1093 / nar / gkr1091. ЧВК  3245157. PMID  22121216.
  2. ^ Nieduszynski, CA; Хирага, S; Ак, П; Бенхэм, CJ; Дональдсон, AD (январь 2007 г.). "OriDB: база данных происхождения репликации ДНК". Исследования нуклеиновых кислот. 35 (Проблема с базой данных): D40-6. Дои:10.1093 / нар / gkl758. ЧВК  1781122. PMID  17065467.

внешняя ссылка