PDCD10 - PDCD10
Белок запрограммированной гибели клеток 10 это белок что у людей кодируется PDCD10 ген.[5][6]
Функция
Этот ген кодирует белок, первоначально идентифицированный в линии премиелоидных клеток, сходный с белками, участвующими в апоптозе. Для этого гена были идентифицированы три альтернативных транскрипта, кодирующих один и тот же белок, различающиеся только своими 5 'UTR.[6]
Ген
Мутации потери функции в PDCD10 привести к возникновению болезни кавернозных мальформаций головного мозга (CCM).[5] Поэтому этот ген еще называют CCM3. Кавернозные мальформации головного мозга (ККМ) - это сосудистые мальформации головного и спинного мозга, состоящие из расширенных капиллярных сосудов.
Взаимодействия
CCM3 кодирует белок под названием Programmed Cell Death 10 (PDCD10). Функции этого белка начали понимать только недавно. PDCD10 играет роль в развитии сосудов и передаче сигналов VEGF1,[7] апоптоз[8] и функционирует как часть более крупного сигнального комплекса, который включает киназу III зародышевого центра.[9][10] В частности, было показано, что PDCD10 взаимодействовать с РП6-213Н19.1,[11] STK25,[11][12] STRN,[11] STRN3,[11] MOBKL3,[11] CTTNBP2NL,[11] STK24[11][12][13] и FAM40A.[11]
Модельные организмы
| Характеристика | Фенотип |
|---|---|
| Гомозигота жизнеспособность | Аномальный |
| Рецессивный смертельное исследование | Аномальный |
| Плодородие | Нормальный |
| Масса тела | Нормальный |
| Беспокойство | Нормальный |
| Неврологический осмотр | Нормальный |
| Сила захвата | Нормальный |
| Горячая тарелка | Нормальный |
| Дисморфология | Нормальный |
| Косвенная калориметрия | Нормальный |
| Тест толерантности к глюкозе | Нормальный |
| Слуховой ответ ствола мозга | Нормальный |
| DEXA | Нормальный |
| Рентгенография | Нормальный |
| Температура тела | Нормальный |
| Морфология глаза | Нормальный |
| Клиническая химия | Нормальный |
| Гематология | Нормальный |
| Лимфоциты периферической крови | Нормальный |
| Микроядерный тест | Нормальный |
| Вес сердца | Нормальный |
| Гистопатология кожи | Нормальный |
| Гистопатология глаз | Нормальный |
| Сальмонелла инфекционное заболевание | Нормальный[14] |
| Citrobacter инфекционное заболевание | Нормальный[15] |
| Все тесты и анализы от[16][17] |
Модельные организмы были использованы при изучении функции PDCD10. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Pdcd10tm1a (КОМП) Wtsi[18][19] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[20][21][22]
Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[16][23] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[16] Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких дополнительных значительных отклонений от нормы.[16]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000114209 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000027835 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ а б Bergametti F, Denier C, Labauge P, Arnoult M, Boetto S, Clanet M, Coubes P, Echenne B, Ibrahim R, Irthum B, Jacquet G, Lonjon M, Moreau JJ, Neau JP, Parker F, Tremoulet M, Tournier- Lasserve E (январь 2005 г.). «Мутации в гене запрограммированной клеточной смерти 10 вызывают кавернозные аномалии головного мозга». Американский журнал генетики человека. 76 (1): 42–51. Дои:10.1086/426952. ЧВК 1196432. PMID 15543491.
- ^ а б "Энтрез Ген: PDCD10 запрограммированная гибель клеток 10".
- ^ Хэ И, Чжан Х, Ю Л., Гунель М., Боггон Т. Дж., Чен Х, Мин В. (2010). «Стабилизация передачи сигналов VEGFR2 кавернозной мальформацией головного мозга 3 имеет решающее значение для развития сосудов». Научная сигнализация. 3 (116): ra26. Дои:10.1126 / scisignal.2000722. ЧВК 3052863. PMID 20371769.
- ^ Guclu B., Ozturk AK, Pricola KL, Bilguvar K, Shin D, O'Roak BJ, Gunel M (ноябрь 2005 г.). «Мутации в гене PDCD10, связанном с апоптозом, вызывают кавернозную аномалию мозга 3». Нейрохирургия. 57 (5): 1008–13. Дои:10.1227 / 01.NEU.0000180811.56157.E1. PMID 16284570. S2CID 10303325.
- ^ Fidalgo M, Fraile M, Pires A, Force T, Pombo C, Zalvide J (апрель 2010 г.). «CCM3 / PDCD10 стабилизирует белки GCKIII, способствуя сборке Гольджи и ориентации клеток». Журнал клеточной науки. 123 (Pt 8): 1274–84. Дои:10.1242 / jcs.061341. PMID 20332113.
- ^ Ceccarelli DF, Laister RC, Mulligan VK, Kean MJ, Goudreault M, Scott IC, Derry WB, Chakrabartty A, Gingras AC, Sicheri F (июль 2011 г.). «CCM3 / PDCD10 гетеродимеризуется с белками киназы III зародышевого центра (GCKIII) с использованием механизма, аналогичного гомодимеризации CCM3». Журнал биологической химии. 286 (28): 25056–64. Дои:10.1074 / jbc.M110.213777. ЧВК 3137079. PMID 21561863.
- ^ а б c d е ж грамм час Гудро М., Д'Амброзио Л.М., Кин М.Дж., Маллин М.Дж., Ларсен Б.Г., Санчес А., Чаудри С., Чен Г.И., Сичери Ф., Несвижский А.И., Эберсолд Р., Рот Б., Гинграс А.С. (январь 2009 г.). «Сеть взаимодействия с высокой плотностью фосфатазы PP2A идентифицирует новый комплекс фосфатазы и киназы, взаимодействующий со стриатином, связанный с белком кавернозной мальформации 3 головного мозга (CCM3)». Молекулярная и клеточная протеомика. 8 (1): 157–71. Дои:10.1074 / mcp.M800266-MCP200. ЧВК 2621004. PMID 18782753.
- ^ а б Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- ^ Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
- ^ "Сальмонелла данные о заражении Pdcd10 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ "Citrobacter данные о заражении Pdcd10 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
- ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID 85911512.
- ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
- ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
- ^ "Информатика генома мыши".
- ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК 3572410. PMID 21677750.
- ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID 21677718.
- ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID 17218247. S2CID 18872015.
- ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК 3218837. PMID 21722353.
дальнейшее чтение
- Craig HD, Günel M, Cepeda O, Johnson EW, Ptacek L, Steinberg GK, Ogilvy CS, Berg MJ, Crawford SC, Scott RM, Steichen-Gersdorf E, Sabroe R, Kennedy CT, Mettler G, Beis MJ, Fryer A, Авад И.А., Лифтон Р.П. (ноябрь 1998 г.). «Мультилокусное сцепление идентифицирует два новых локуса для менделевской формы инсульта, кавернозной мальформации мозга, в 7p15-13 и 3q25.2-27». Молекулярная генетика человека. 7 (12): 1851–8. Дои:10.1093 / hmg / 7.12.1851. PMID 9811928.
- Guclu B, Ozturk AK, Pricola KL, Seker A, Ozek M, Gunel M (ноябрь 2005 г.). «Венозные мальформации головного мозга имеют различное генетическое происхождение от кавернозных пороков развития головного мозга». Инсульт: журнал церебрального кровообращения. 36 (11): 2479–80. Дои:10.1161 / 01.STR.0000183616.99139.d3. PMID 16239636.
- Guclu B., Ozturk AK, Pricola KL, Bilguvar K, Shin D, O'Roak BJ, Gunel M (ноябрь 2005 г.). «Мутации в гене PDCD10, связанном с апоптозом, вызывают кавернозную аномалию мозга 3». Нейрохирургия. 57 (5): 1008–13. Дои:10.1227 / 01.NEU.0000180811.56157.E1. PMID 16284570. S2CID 10303325.
- Liquori CL, Berg MJ, Squitieri F, Ottenbacher M, Sorlie M, Leedom TP, Cannella M, Maglione V, Ptacek L, Johnson EW, Marchuk DA (январь 2006 г.). «Низкая частота мутаций PDCD10 в группе пробандов CCM3: потенциал для четвертого локуса CCM». Человеческая мутация. 27 (1): 118. Дои:10.1002 / humu.9389. PMID 16329096. S2CID 30609244.
- Verlaan DJ, Roussel J, Laurent SB, Elger CE, Siegel AM, Rouleau GA (декабрь 2005 г.). «Мутации CCM3 необычны при кавернозных мальформациях головного мозга». Неврология. 65 (12): 1982–3. Дои:10.1212 / 01.wnl.0000188903.75144.49. PMID 16380626. S2CID 190798.
- Цанг Х. Т., Коннелл Дж. В., Браун С. Е., Томпсон А., Рид Е., Сандерсон С. М. (сентябрь 2006 г.). «Систематический анализ человеческих взаимодействий с белками CHMP: дополнительные белки, содержащие домен MIT, связываются с множеством компонентов человеческого комплекса ESCRT III». Геномика. 88 (3): 333–46. Дои:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.
- Лабож П., Кривошич В., Деньье С., Турнье-Лассерв Е., Годрик А. (июнь 2006 г.). «Частота каверном сетчатки у 60 пациентов с семейными каверномами головного мозга: клиническое и генетическое исследование». Архив офтальмологии. 124 (6): 885–6. Дои:10.1001 / archopht.124.6.885. PMID 16769843.
- Чен П.Й., Чанг В.С., Чжоу Р.Х., Лай Ю.К., Лин С.К., Чи С.Ю., Ву С.В. (2007). «Два негомологичных гена, связанных с заболеваниями головного мозга, SERPINI1 и PDCD10, тесно связаны асимметричным двунаправленным промотором эволюционно консервативным образом». BMC Молекулярная биология. 8: 2. Дои:10.1186/1471-2199-8-2. ЧВК 1796892. PMID 17212813.
- Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК 1847948. PMID 17353931.
- Ма Х, Чжао Х, Шан Дж, Лонг Ф, Чэнь И, Чен И, Чжан И, Хань Х, Ма Д. (июнь 2007 г.). «PDCD10 взаимодействует с Ste20-родственной киназой MST4, способствуя росту и трансформации клеток посредством модуляции пути ERK». Молекулярная биология клетки. 18 (6): 1965–78. Дои:10.1091 / mbc.E06-07-0608. ЧВК 1877091. PMID 17360971.