Polynucleobacter asymbioticus - Википедия - Polynucleobacter asymbioticus

Polynucleobacter asymbioticus
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Бетапротеобактерии
Заказ:
Burkholderiales
Семья:
Burkholderiaceae
Род:
Полинуклеобактерии
Разновидность:
P. asymbioticus
Биномиальное имя
Polynucleobacter asymbioticus
Hahn et al. 2016 г.
Тип штамма
QLW-P1DMWA-1, DSM 18221, CIP 109841[1]
Синонимы

Полинуклеобактерии необходимы subsp. асимбиотикус, Полинуклеобактерии sp. QLW-P1DMWA-1, штамм QLW-P1DMWA-1

Polynucleobacter asymbioticus является аэробный, каталаза - и оксидаза -положительный, химио-органотрофный, неподвижный, свободно живущий бактерия рода Полинуклеобактерии. Типовой штамм был выделен из небольшого пруда, расположенного в Австрийские Альпы в районе Зальцбург [2] и описан как новый подвид Полинуклеобактерии необходимы в 2009.[3] Классификация типового штамма затруднялась тем, что его ближайший описанный родственник представлял облигатных эндосимбионтов, т.е. P. needarius, не доступен в виде чистой культуры, подходящей для стандартных тестов (эксперименты по гибридизации ДНК-ДНК) для определения видов прокариот. Поэтому штамм предварительно отнесен к подвидам P. needarius subsp. асимбиотикус. Позднее секвенирование генома типового штамма[4] выявили, что штамм представляет собой новый вид в пределах рода Полинуклеобактерии. Таким образом, его таксономический ранг был поднят с подвида на видовой уровень.[5] Штаммы P. asymbioticus обитают как планктонные организмы в кислых, богатых гумином пресноводных системах.[6] Сравнительный анализ генома показал, что P. asymbioticus представляет нетипичного члена семьи Burkholderiaceae относительно небольшого размера генома и пассивного образа жизни.[7] В недавнем исследовании использовалась коллекция из 37 P. asymbioticus штаммы, выделенные из различных прудов, расположенных в более крупном регионе Австрийских Альп, чтобы получить представление об эволюции Полинуклеобактерии бактерии.[8]

Рекомендации

  1. ^ Straininfo из Полинуклеобактерии необходимы subsp. асимбиотикус
  2. ^ Hahn, M.W., Pöckl, M. и Wu, Q.L. (2005) Низкое внутривидовое разнообразие у Полинуклеобактерии популяция субкластера, численно доминирующая бактериопланктон пресноводного пруда. Appl. Environ. Microbiol. 71: 4539–4547.
  3. ^ Hahn, M.W., Lang, E., Brandt, U., Wu, Q.L., Scheuerl, T. (2009) Исправленное описание рода Полинуклеобактерии и виды P. needarius и предложение двух подвидов, P. needarius подвид необходимость subsp. ноя и P. needarius subsp. асимбиотикус subsp. ноя Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59: 2002-2009.
  4. ^ Майнке, Л., А. Коупленд, А. Лапидус, С. Лукас, К. В. Берри, Т. Глава Дель Рио, Н. Хэммон, Э. Далин, Х. Тайс, С. Питлак, П. Ричардсон, Д. Брюс, Л. Гудвин, К. Хан, Р. Тапиа, Дж. К. Деттер, Дж. Шмутц, Т. Бреттин, Ф. Лаример, М. Лэнд, Л. Хаузер, Н. К. Кирпидес, Н. Иванова, М. Гёкер, Т. Войке , QL Wu, M. Pöckl, MW Hahn и H.-P. Кленк (2012). Полная последовательность генома Полинуклеобактерии необходимы subsp. асимбиотикус типовой штамм (QLW-P1DMWA-1T). Стандарты геномных наук 6: 74-83.
  5. ^ Хан М. В., Шмидт Дж., Питт А., Тайпале С. Дж., Ланг Э. (2016). Реклассификация четырех Полинуклеобактерии необходимы напряжения как Polynucleobacter asymbioticus гребень. ноя., Polynucleobacter duraquae sp. ноя., Полинуклеобактерии yangtzensis sp. ноя., и Polynucleobacter sinensis sp. nov., и исправленное описание вида Полинуклеобактерии необходимы. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66: 2883–2892.
  6. ^ Хетцингер М., Хан М.В., Джезберова Дж., Шмидт Дж., Колл У. (2017). Микродиверсификация пелагиали Полинуклеобактерии вид в основном обусловлен приобретением геномных островов из частично межвидового генофонда. Appl. Environ. Microbiol. 83: 3 e02266-16
  7. ^ Hahn, MW, Scheuerl, T., Jezberová, J., Koll, U., Jezbera, J., Šimek, K., Vannini, C., Petroni, G., и QL Wu (2012), пассивный, но успешный путь планктонной жизни: геномный и экспериментальный анализ экологии свободноживущей популяции Polynucleobacter. PLoS ONE 7 (3): e32772.
  8. ^ Хетцингер М., Хан М.В., Джезберова Дж., Шмидт Дж., Колл У. (2017). Микродиверсификация пелагиали Полинуклеобактерии вид в основном обусловлен приобретением геномных островов из частично межвидового генофонда. Appl. Environ. Microbiol. 83: 3 e02266-16

внешняя ссылка