Полинуклеобактерии - Polynucleobacter

Полинуклеобактерии
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Класс:
Бетапротеобактерии
Порядок:
Burkholderiales
Семья:
Burkholderiaceae
Род:
Полинуклеобактерии
Хекманн и Шмидт 1987,
исправить. Hahn et al. 2009 г.,
исправить. Hahn et al. 2016 г.
Типовой вид
Полинуклеобактерии необходимы
Виды

P. acidiphobus Хан и другие. 2011
P. aenigmaticus Хан и другие. 2017
P. asymbioticus Хан и другие. 2016
P. campilacus Хан и другие. 2018
P. cosmopolitanus Хан и другие. 2010
P. difficilis Хан и другие. 2012
P. duraquae Хан и другие. 2016
P. hirudinilacicola Хан и другие. 2018
P. meluiroseus Питт и другие. 2018
P. needarius Heckm. И Sch. 1987 г.
P. paneuropaeus Hoetzi. и другие. 2019
П. рарус Хан и другие. 2011
P. sinensis Хан и другие. 2016
P. sphagniphilus Хан и другие. 2017
P. victoriensis Хан и другие. 2017
P. wuianus Хан и другие. 2017
П. yangtzensis Хан и другие. 2016

Полинуклеобактерии это род Протеобактерии, первоначально созданная Хекманном и Шмидтом (1987)[1] иметь исключительно обязательный эндосимбионты из инфузории принадлежность к роду Euplotes.

Недавно появилось несколько новых Полинуклеобактерии описаны виды,[2][3][4][5][6][7][8][9], которые все представляют собой свободно живущие (т.е. не связанные с хостом) планктонный пресная вода бактерии. Таким образом, род Полинуклеобактерии в настоящее время включает один вид, содержащий облигатных эндосимбионтов инфузорий, и девять видов, представляющих свободноживущие планктонные штаммы. В типовые штаммы планктонных видов были изолированы из пресноводных систем, расположенных в Армения, Австрия, Китай, Франция, Германия, Норвегия, Уганда, а Соединенные Штаты. В настоящее время род насчитывает 17 видов.

Свободная жизнь Poynucleobacter бактерии представляют собой важных членов бактериопланктон в пресноводных системах, таких как озера, пруды и ручьи.[10]

Геномика

Два геном проекты завершены на P. needarius штаммы: один проект по обязательно свободноживущему штамму, изолированному из кислого пресноводного пруда,[11] и один проект на облигатном эндосимбионте инфузории Euplotes aediculatus.[12]

Анализ последовательностей генома привел к открытию консервативного Мотив РНК.

использованная литература

  1. ^ Хекманн, К. и Х. Дж. Шмидт (1987) Полинуклеобактерии необходимы ген. nov., sp. ноя., обязательно эндосимбиотический бактерия, живущая в цитоплазме Euplotes эдикулатус. Int. J. Syst. Бактериол. 37: 456-457. (DOI: 10.1099 / 00207713-37-4-456)
  2. ^ Хан, М.В., Э. Ланг, У. Брандт, Х. Люнсдорф, К. Л. Ву и Э. Стакебрандт (2010) Polynucleobacter cosmopolitanus sp. nov., свободноживущие планктонные бактерии, населяющие пресноводные озера и реки. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 60: 166-173. (DOI: 10.1099 / ijs.0.010595-0)
  3. ^ Хан, M.W., Э. Ланг, У. Брандт и К. Шпрёер (2011) Polynucleobacter acidiphobus sp. nov., представитель многочисленной группы планктонных пресноводных бактерий. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61: 788-794. (DOI: 10.1099 / ijs.0.023929-0)
  4. ^ Хан, М.В., Э. Ланг, М. Тарао и У. Брандт (2011 г.) Полинуклеобактер рарус sp. nov., свободноживущая планктонная бактерия, выделенная из кислого озера. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 61: 781-787 (DOI: 10.1099 / ijs.0.017350-0)
  5. ^ Хан, М.В., А. Минасян, Э. Ланг, У. Колл и К. Спрёер (2012) Polynucleobacter difficilis sp. nov., планктонная пресноводная бактерия, аффилированная с подклассом B1 рода Полинуклеобактерии. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 62: 376-383. (DOI: 10.1099 / ijs.0.031393-0)
  6. ^ Hahn, M.W., J. Schmidt, A. Pitt, S.J. Тайпале и Э. Ланг (2016) Реклассификация четырех Полинуклеобактерии необходимы штаммы как представители Polynucleobacter asymbioticus расческа. ноя., Polynucleobacter duraquae sp. ноя., Полинуклеобактерии yangtzensis sp. ноя и Polynucleobacter sinensis sp. nov., и исправленное описание Полинуклеобактерии необходимы. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 66: 2883-2892. (DOI: 10.1099 / ijsem.0.001073)
  7. ^ Хан, M.W., L.R. Хайманн, У. Колл, Дж. Шмидт, Э. Ланг, М. Хёцингер (2017) Polynucleobacter wuianus sp. nov., свободноживущая пресноводная бактерия, аффилированная с комплексом криптических видов PnecC. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 67: 379-385. (DOI: 10.1099 / ijsem.0.001637)
  8. ^ Питт А., Шмидт Дж., Ланг Э., Уитман В. Б., Войке Т., Хан М. В. (2018). Полинуклеобактерии мелуйрозный sp. nov., бактерия, выделенная из озера, расположенного в горах средиземноморского острова Корсика. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 68: 1975-1985 [1]
  9. ^ Хетцингер М., Шмидт Дж., Питт А., Колл У., Ланг Э., Хан М. В. (2019) Полинуклеобактер паневропаеус sp. nov., характеризующийся шестью штаммами, изолированными из пресноводных озер, расположенных на 3000 км поперечного сечения с севера на юг по всей Европе. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 69:203-213. (DOI: 10.1099 / ijsem.0.003130)
  10. ^ Jezberová, J., J. Jezbera, U. Brandt, E.S. Линдстрем, С. Лангенхедер и М.В. Хан (2010). Повсеместность Полинуклеобактерии необходимы ssp. асимбиотикус в непроточных пресноводных местообитаниях неоднородной 2000 км2 площадь. Environ. Microbiol. 12: 658-669.
  11. ^ ЗОЛОТАЯ КАРТА: Gc00537 Геномный проект: Полинуклеобактерии необходимы subsp. асимбиотикус QLW-P1DMWA-1, GOLD - База данных геномов онлайн
  12. ^ ЗОЛОТАЯ КАРТА: Gc00757 Геномный проект: Полинуклеобактерии необходимы subsp. необходимость STIR1, GOLD - база данных геномов онлайн

внешние ссылки