Pseudomonas oryzihabitans - Pseudomonas oryzihabitans
| Pseudomonas oryzihabitans | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Протеобактерии |
| Класс: | Гаммапротеобактерии |
| Порядок: | Pseudomonadales |
| Семья: | Pseudomonadaceae |
| Род: | Псевдомонады |
| Группа видов: | Pseudomonas putida группа |
| Виды: | P. oryzihabitans |
| Биномиальное имя | |
| Pseudomonas oryzihabitans Кодома, и другие., 1985 | |
| Тип штамма | |
| ATCC 43272 | |
| Синонимы | |
Flavimonas oryzihabitans (Кодама и другие. 1985) Холмс и другие. 1987 | |
Pseudomonas oryzihabitans, также известен как Flavimonas oryzihabitans, представляет собой неферментирующий желто-пигментированный, грамотрицательный, палочковидная бактерия, которая может вызывать сепсис, перитонит, эндофтальмит, и бактериемия.[1] Это оппортунистический возбудитель человека и теплокровных животных, который обычно встречается в нескольких источниках окружающей среды, от почвы до рисовых полей. Их можно отличить от других неферментеров по отрицательной оксидазной реакции и аэробному характеру.[1] Этот организм может заразить людей с серьезными заболеваниями, в том числе перенесших операцию или катетеры в их теле.[2] На базе 16S РНК анализа, эти бактерии были помещены в Pseudomonas putida группа.[3]
История
Часть рода Псевдомонады, первоначально описанные в 1894 году, эти бактерии были впервые обнаружены в моче и образцах желудочно-кишечного тракта в 1928 году двумя учеными Э. Дрезель и О. Стикл.[4] Сначала этот организм получил название Chromobacterium typhiflavuum потому что он очень напоминал бактерии, вызывающие брюшной тиф.[4] Смена названия на Pseudomonas oryzihabitans произошло в 1985 году после того, как ученый Кентаро Кодама и его команда изолировали бактерии с рисового поля и обнаружили, что они фенотипически сходны с организмами псевдомонад.[4] Этот организм также был изолирован в больничной среде из самых разных мест, таких как раны, глаза, кожа, уши и некоторых других мест, хотя их можно найти и во влажной среде.[5] На сегодняшний день мало что известно о патогенных свойствах P. oryzihabitans, поэтому возможные вирулентные штаммы невозможно полностью описать или идентифицировать.
Патогенез
Pseudomonas oryzihabitans, хотя и является необычным патогеном, может вызывать инфекции у людей, которые обычно иммунная система. Хотя большинство штаммов этих бактерий не вызывают инфекций, пациенты, которые приобретают P. oryzihabitans скорее всего, имеют какое-либо основное заболевание, и оно распространяется во время госпитализации.[5] Это включает пациентов, которые недавно перенесли операцию, а также тех, кто страдает такими заболеваниями, как СПИД, лейкемия и другие болезни, пагубно влияющие на иммунную систему.[6]
Из нескольких исследований, касающихся случаев P. oryzihabitans, исследования показывают, что существует тесная связь между инфекцией, основным заболеванием и наличием катетеров у пациентов.[2] Это означает, что инфекции чаще всего возникают у людей, которые страдают изнурительным заболеванием и в организме которых находится искусственный материал. Вместе с катетерами, P. oryzihabitans чаще всего встречаются в местах, где есть респираторное оборудование и устройства для непрерывного амбулаторного диализа, и эти бактерии могут распространяться через загрязненные жидкости и нестерилизованные или оскверненные медицинские инструменты.[2] В этом случае важно поддерживать внутреннюю и внешнюю гигиену, чтобы остановить распространение бактерий и предотвратить инфекционные заболевания. Инфекции могут быть либо нозокомиально приобретенные, что означает, что бактерии возникли во время пребывания пациента в больнице в течение сорока восьми часов после госпитализации, или они являются внебольничными, что означает, что у пациента были доказательства инфекции до госпитализации или в течение первых 48 часов в больнице. больница.[5]
Большинство инфекций приводит к бактериемии у крайне больных пациентов или перитониту у лиц, постоянно проходящих амбулаторный перитонеальный диализ.[2] Несколько сообщений об инфекциях, вызываемых этими бактериями, коррелируют с пациентами, больными СПИДом.[6] P. oryzihabitans все чаще идентифицируется как причина оппортунистических инфекций, используя слабую иммунную систему людей. Тем не менее, инфекция редко перерастает в сепсис, но были случаи, когда пациенты заражались этим заболеванием. Хотя эти бактерии могут вызывать инфекции, их роль в качестве патогена сомнительна, поскольку это случается не очень часто.
Диагноз / симптомы
Симптомы инфекции P. oryzihabitans на самом деле довольно расплывчаты и похожи на признаки, которые могут указывать на другие болезни или заболевания, поэтому их относительно сложно идентифицировать, глядя только на симптомы. Однако в некоторых случаях эти инфекции возникают в результате ослабления иммунной системы человека, поэтому они могут возникать у выздоравливающих или больных пациентов. Большинство пациентов после лечения от другого заболевания или во время восстановления после операции испытывают озноб и повышение температуры тела.[2] Хотя эти симптомы могут означать разные вещи, очевидно, что выздоровление пациента приостановлено и что имеется какая-то инфекция. В примере, когда у женщины развилась инфекция P. oryzihabitans из случая синусит, она испытала такой же озноб и повышенную температуру, но также и выделения из носа, содержащие гной, боль в правом лице и лихорадку.[2]
Чтобы установить, что эти пациенты инфицированы Pseudomonas oryzihabitans, образцы крови собираются для анализов и отправляются для идентификации культур. Поскольку присутствие этих бактерий может изначально не определяться какими-либо симптомами, их выявление в лаборатории поможет в лечении. В определенных ситуациях его роль как патогена также определяется по свидетельствам легочный Признаки и симптомы, рентгенограмма находки и положительные посевы крови.[5]
лечение
В прошлом сообщалось о случаях P. oryzihabitans, пациентам давали антибиотики для лечения инфекции. Эти бактерии довольно легко поддаются лечению с помощью ряда антибиотиков, к которым они чувствительны. Антибиотики, на которые реагирует инфекционное заболевание, - это гентамицин, ципрофлоксацин, карбапенемы, цефалосприны, аминогликозиды и хинолоны.[2] Хотя есть несколько видов лекарств, которые могут лечить P. oryzihabitans, то карбапенем показал лучшие результаты против инфекций. В исследовании, в котором выращивали культуры этих бактерий, тесты показали, что все изоляты были чувствительны к карбапенемным антибиотикам, однако уязвимость к другим лекарствам различалась между группами.[5] Прошлые исследования также показали, что P. oryzihabitans были восприимчивы in vitro к антипсевдомону пенициллины.[4] Лечение бактерий различается и зависит от хозяина и различных штаммов бактерий. P. oryzihabitans.
Сопротивление
Типы антибиотиков, которые P. oryzihabitans устойчивы к ампициллину, амоксициллин-клавулановой кислоте и цефазолину.[7] Поскольку эти бактерии не так опасны или вирулентны для хозяина, антибиотики должны устранить инфекцию, хотя в некоторых случаях, поскольку они могут быть обнаружены вокруг участков протезного материала, требуется удаление катетера.[8]
Профилактика
Чтобы предотвратить заражение этими бактериями, необходима тщательная гигиена, особенно если в теле находятся посторонние материалы или предметы, такие как катетеры. Однако даже это не может полностью предотвратить P. oryzihabitans из-за загрязнения окружающей среды, которое может привести к заражению этим организмом.[6]
В случае пациентов с постоянными катетерами следует проявлять особую осторожность, чтобы не произошло внебольничная инфекция. Этим людям рекомендуется избегать использования мочалок и влажных предметов для ухода за кожей, поскольку они могут быть местами роста и заражения бактерий.[6]
Экология
Изучая среду, в которой P. oryzihabitans обнаружены, ученые могут получить более четкое представление о том, как возникают инфекции и как эти бактерии могут быть обнаружены у людей за пределами больниц. Хотя бактерии могут быть приобретены нозокомиальным путем, необходимо учитывать окружающую среду как хозяина для них. Эти бактерии, хотя и наблюдаются в больницах, изначально могут быть обнаружены во влажной среде, например, в местах с водой, стоячей или проточной или почвой. Данные указывают на то, что источники окружающей среды могли быть причиной развития инфекционного заболевания, а также присутствия посторонних предметов в организме.[6]
Эти бактерии были впервые глубоко изучены и идентифицированы после того, как они были изолированы от рисовые поля.[9]
В одном исследовании исследователи обнаружили, что P. oryzihabitans загрязненная питьевая вода и поставлен вопрос о том, обычно ли эти бактерии встречаются в естественно распределенной воде.[6] Системы водоснабжения контактировали с объектом, который напрямую связан с воронки, которые являются известными местами обитания бактерий. Поскольку воронки представляют собой большие подземные полости, в них достаточно места для сбора воды, что делает эту среду идеальным местом для P. oryzihabitans расти.
Эти бактерии способны сохраняться в биопленки где они относительно защищены от дезинфекции хлором.[10]Этим объясняется их присутствие в питьевой воде.
Когда инфекция, вызванная P. oryzihabitans было зарегистрировано у пациента со СПИДом и постоянным катетером, ученые взяли образцы из дома этого человека, чтобы увидеть, где находятся эти бактерии, и выяснить возможное объяснение его инфекции. Пациент утверждал, что он следовал строгим гигиеническим правилам, касающимся катетеров, поэтому причиной инфекции является фактор окружающей среды. В конечном итоге они проследили происхождение бактерий до губки для ванны. Чтобы исследователи подтвердили эти выводы, они также протестировали банные губки из других домашних хозяйств и обнаружили: P. oryzihabitans в некоторых отдельных образцах.[7] Это говорит о том, что вода может быть загрязнена этими бактериями, что, в свою очередь, может привести к потенциальным инфекциям у некоторых людей.
Клиническое значение
Инфекции от P. oryzihabitans все чаще ассоциируются с катетерной бактериемией, перитонитом, раневыми инфекциями и менингитом (после операции), в основном у пациентов с заболеваниями, которые значительно ослабляют человека.[7]
Присутствие инородного материала в организме предрасполагает пациентов к инфекциям, а также людей с сильно ослабленной иммунной системой.[7]
В большинстве случаев заражение происходит внутрибольнично, однако при поступлении в больницу выявляются инфекции.[7] Также есть случаи, когда P. oryzihabitans был причиной сепсиса у некоторых людей. Единственной другой оксидазонегативной Pseudomonas является P. luteola.
Физиология
Ячейки Pseudomonas oryzihabitans стержни с закругленными концами. Эти грамотрицательные бактерии могут перемещаться из-за жгутик, причем клетки встречаются единично и очень редко - парами. Штаммы этих бактерий производят в своих клетках желтый нерастворимый в воде пигмент.[9]
Их метаболизм ограничен аэробной дыхательной системой. Они являются окислительными, но не ферментативными, и когда они изолированы и культивируются, их рост происходит на МакКонки агар и SS-агар.[9]
использованная литература
- ^ а б Freney et al., "Послеоперационная детская септицемия, вызванная Pseudomonas luteola (CDC Group Ve-1) и Pseudomonas oryzihabitans (CDC Group Ve-2)", Journal of Clinical Microbiology 26 (1988): 1241-1243
- ^ а б c d е ж г Lejbkowicz et al., «Бактериемия и синусит, вызванные инфекцией Flavimonas oryzihabitans», Scandinavian Journal of Infectious Diseases 35 (2003): 411-414
- ^ Анзай; Kim, H; Парк, JY; Вакабаяси, H; Ояйдзу, H; и другие. (Июль 2000 г.). «Филогенетическая принадлежность псевдомонад на основе последовательности 16S рРНК». Int J Syst Evol Microbiol. 50 (4): 1563–89. Дои:10.1099/00207713-50-4-1563. PMID 10939664.
- ^ а б c d Lucas et al., "Сепсис, вызванный Flavimonas orzyhabitans", Medicine 73 (1994): 209-214.
- ^ а б c d е Джакометти и др., «Необычные клинические проявления инфекции, вызванной Flavimonas oryzihabitans», Европейский журнал клинической микробиологии и инфекционных заболеваний 17 (1998): 645-648
- ^ а б c d е ж Dussart-Baptista et al., «Периодическое извлечение штаммов Pseudomonas oryzihabitans из закарстифицированного мелового водоносного горизонта», Water Research 41 (2007): 96-102
- ^ а б c d е Марин и др., «Инфекция катетера Хикмана Pseudomonas (ранее Flavimonas) orzyhabitans, прослеженная до синтетической губки для ванн», Journal of Clinical Microbiology 38 (2000): 4577-4579
- ^ Эстебан и др., «Перитонит, вызванный Pseudomonas orzyhabitans, у пациента, находящегося на непрерывном амбулаторном перитонеальном диализе», «Клиническая микробиология и инфекция» 8 (2002): 607-608
- ^ а б c Кодама и др., «Два новых вида Pseudomonas: P. oryzihabitans, выделенные из рисовых полей и клинических образцов, и P. luteola, выделенные из клинических образцов», Int J Syst Bacteriol 35 (1985): 467-474
- ^ Dussart, L .; Dupont, J.P .; Циммерлин, И .; Lacroix, M .; Saiter, J.M .; Junter, G.-A .; Жуэнн, Т. (2003). «Возникновение сидячих Pseudomonas oryzihabitans из закарстованного мелового водоносного горизонта». Водные исследования. 37 (7): 1593–1600. Дои:10.1016 / S0043-1354 (02) 00555-9. ISSN 0043-1354.