Вирус псевдомонады phi6 - Википедия - Pseudomonas virus phi6
 | Эта статья нужны дополнительные цитаты для проверка. (Май 2012 г.) (Узнайте, как и когда удалить этот шаблон сообщения) |
| Вирус псевдомонады phi6 | |
|---|---|
 | |
| РНК-упакованный прокапсид (белковая оболочка) Вирус псевдомонады phi6 | |
 | |
| Геном вируса псевдомонады phi6 | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Duplornaviricota |
| Учебный класс: | Vidaverviricetes |
| Заказ: | Миндивиралес |
| Семья: | Cystoviridae |
| Род: | Цистовирус |
| Разновидность: | Вирус псевдомонады phi6 |
| Синонимы | |
Φ6 (Фи 6) наиболее изучен бактериофаг из вирус семья Cystoviridae. Он заражает Псевдомонады бактерии (обычно растительно-патогенный P. syringae ). Он состоит из трех частей, сегментирован, двухцепочечный РНК геном, всего ~ 13,5 kb в длину. Φ6 и его родственники имеют липидная мембрана вокруг их ядракапсид, редкий признак среди бактериофагов. Это литический фаг, хотя при определенных обстоятельствах наблюдалась задержка лизиса, которую можно описать как «состояние носителя».
Жизненный цикл
Φ6 обычно присоединяется к типу IV пилус из P. syringae с прикрепляющим белком P3. Считается, что затем клетка втягивает пилус, притягивая фаг к бактерии. Слияние вирусный конверт с бактериальный внешняя мембрана способствует фагу белок, P6. Муралитический (пептидогликан -переваривающий) фермент Р5, затем переваривает часть клеточная стенка, и нуклеокапсид попадает в клетку, покрытую внешней бактериальной мембраной.
Копия чувственная нить большого сегмента генома (6374 базы ) затем синтезируется (транскрипция ) на вершинах капсид, с РНК-зависимой РНК-полимераза, P2, и высвобождается в клетку-хозяин цитозоль. Четыре белка переведено из большого сегмента спонтанно собираются в прокапсиды, которые затем упаковывают смысловую цепь большого сегмента, полимеризуя ее дополнять при входе через P2 полимераза В то время как большой сегмент транслируется (экспрессируется) и синтезируется (реплицируется), родительский фаг высвобождает копии смысловых цепей среднего сегмента (4061 основание) и малого сегмента (2948 оснований) в цитозоль. Они переводятся и упаковываются в прокапсиды в следующем порядке: средний, затем маленький. Заполненные капсиды затем покрываются нуклеокапсидным белком P8, а затем белки внешней мембраны каким-то образом привлекают бактерии. внутренняя мембрана, который затем обволакивает нуклеокапсид.
Литический белок, P5, содержится между оболочкой нуклеокапсида P8 и вирусной оболочкой. Завершенное потомство фага остается в цитозоле до тех пор, пока достаточный уровень литического белка P5 не разрушит стенку клетки-хозяина. Затем цитозоль вырывается, разрушая внешнюю мембрану, высвобождая фаг. Бактерия убита этим лизис.
РНК-зависимая РНК-полимераза
РНК-зависимый РНК-полимеразы (RdRP) - важные компоненты в жизненном цикле двухцепочечные РНК (дцРНК) вирусы. Однако не совсем понятно, насколько эти важные ферменты функции во время вирусной репликации. Экспрессия и характеристика очищенного рекомбинантного RdRP Ф6 является первой прямой демонстрацией активности RdRP, катализируемой одним белок из дцРНК вирус. Рекомбинантный Φ6 RdRP очень активен. in vitro, обладает репликацией РНК и транскрипция деятельности, и может использовать оба гомологичный и гетерологичный РНК молекулы как шаблоны. Кристаллическая структура полимеразы Ф6, решенная в комплексе с рядом лигандов, дает представление о механизме праймер-независимого инициирования РНК-зависимой Полимеризация РНК. Эта РНК-полимераза, по-видимому, действует без сигма-фактора / субъединицы. Очищенный RdRP Φ6 демонстрирует постепенное удлинение in vitro и самособирается вместе с белками полимеразного комплекса в субвирусные частицы, которые полностью функциональны.[3]
Исследование
Φ6 был изучен как модель, чтобы понять, как сегментировано РНК-вирусы упаковки своих геномов, ее структура была изучена учеными, интересующимися липид -содержащие бактериофаги, и он был использован в качестве модельного организма для тестирования эволюционный теория, такая как Трещотка Мюллера. Фаг Φ6 широко используется в дополнительных экспериментальная эволюция фага исследования.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ 6-й отчет ICTV Мерфи, Ф. А., Фоке, К. М., Бишоп, Д. Х. Л., Габриаль, С. А., Джарвис, А. В. Мартелли, Г. П. Майо, М. А. и Саммерс, М. Д. (редакторы) (1995). Таксономия вирусов. Шестой отчет Международного комитета по таксономии вирусов. Архивы вирусологии Приложение 10 https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/ICTV%206th%20Report.pdf
- ^ Крупович, Март; и другие. (Май 2015 г.). «Чтобы переименовать все (522) существующие бактериальные вирусы и 2 вида вирусов архей» (PDF). Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 29 августа 2019.
- ^ Койвунен; и другие. (2008). "Анализ структуры-функции РНК-зависимой РНК-полимеразы дцРНК бактериофага Φ6". Сегментированные двухцепочечные РНК-вирусы: структура и молекулярная биология. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-21-9.