Rhodoplanes azumiensis - Википедия - Rhodoplanes azumiensis
| Rhodoplanes azumiensis | |
|---|---|
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Протеобактерии |
| Класс: | Alphaproteobacteria |
| Порядок: | Ризобиальные |
| Семья: | Hyphomicrobiaceae |
| Род: | Родопланы |
| Виды: | R. azumiensis |
| Биномиальное имя | |
| Rhodoplanes azumiensis Хираиши 2017 | |
Rhodoplanes azumiensis термотолерантный Протеобактерии изолирован от осадочного шлама и цианобактериальный коврики, расположенные в Горячие источники Наканою, расположенный в Адзуми район, Мацумото, Префектура Нагано, Япония. R. azumiensis это фотогетеротроф который способен использовать многие органические материалы в качестве источника углерода. Колонии и жидкие культуры имеют коричневато-красный цвет при фототрофном выращивании и бесцветные при аэробном выращивании в темноте.[1]
Изоляция
Образцы были взяты из осадочной грязи и цианобактериальных матов, расположенных в горячих источниках Наканою в Японии. Затем образцы помещали в 20 мл с завинчивающейся крышкой. пробирки содержащий 10 мл Родопланы (RPL) и инкубировали при 42 ° C. Возникли розовые культуры, которые высевали на чашки с агаром RPL и инкубировали в аэробных условиях при 42 ° C. Изоляционные штрихи проводились несколько раз, пока не были выделены 2 новых вида.
Секвенирование ДНК и подтверждение новизны
20 штаммов Родопланы были выделены описанным выше методом, из них 18 имели 100% -ное сходство 16S рРНК к ранее описанной и опубликованной 16S рРНК Родопланы виды. Два новых изолированных вида продемонстрировали 96,9-98,7% сходства с ранее изолированными. Родопланы виды. ДНК-ДНК гибридизация Затем было проведено исследование, чтобы определить, являются ли эти два изолированных вида новыми или нет. Rhodoplanes azumiensis гибридизировано от 48 до 52% с ранее изолированными Родопланы виды, позволившие исследователям определить, что это действительно был новый штамм.
Характеристики
R. azumiensis находятся грамотрицательный стержни шириной 1 мкм и длиной 2-4 мкм. Они способны к подвижности благодаря единственной полярной жгутики. R. azumiensis использует подающий надежды для размножения и образования розеткообразных кластеров в более старых культурах. Колонии и жидкие культуры коричневато-красные при фототрофном выращивании и бесцветные при аэробном выращивании в темноте. Их основные каротиноид компоненты Родопин, спириллоксантин, ангидрородовибрин, родовибрин, и ликопин позволяя им использовать максимумы поглощения при 376, 498, 529, 594, 800, 859 и 892 нм. R. azumiensis 16S рРНК Содержимое GC составляет 70,4%. Оптимальный рост составляет 40 ° C, оптимальный pH от 6,8 до 7,2, и они могут использовать пируват, цитрат, малат, ацетат, лактат, сукцинат, фумарат, и малонатный так как источники углерода.
использованная литература
- ^ Хираиши, Акира (1 декабря 2017 г.). «Характеристика термотолерантных фототрофных бактерий, Rhodoplanes tepidicaeni sp. Nov. И Rhodoplanes azumiensis sp. Nov., Изолированных из геотермального источника». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 67 (12): 5038–5045. Дои:10.1099 / ijsem.0.002408. PMID 29034848.