МРНК RpoS 5'UTR - RpoS mRNA 5′UTR

мРНК rpoS кодирует фактор стресса rpoS, сигма S (σ^S или же σ³⁸ ) в кишечная палочка и родственные бактерии, где DsrA в сочетании с См как РНК-связывающий белок, Hfq продвигать перевод этого РПОС мРНК.^[1] 5 ' UTR мРНК rpoS образует самоингибирующее стержень петля это защищает последовательность шайн-далгарно и поэтому подавляет перевод. В вторичная структура 5′UTR был предсказан ацетилирование 2'-гидроксилов рибозы с помощью NMIA и с помощью программы предсказания вторичной структуры RNAstructure.^[2]^[3] DsrA стимулирует трансляцию rpoS путем связывания в 5'UTR и заставляет петлю ствола открываться, обнажая сайт связывания рибосомы.

Сайт-направленный мутагенез и анализ делеции обнаружил мотив AAYAA, идентифицированный перед структурой стержневой петли, которая необходима для связывания Hfq.^[4] Сравнительная степень геномика показал, что эта регуляторная вторичная структура сохраняется в нескольких грамотрицательные бактерии разновидность.

Рекомендации

^ Хенгге-Аронис, Р. (сентябрь 2002 г.). «Передача сигнала и регуляторные механизмы, участвующие в контроле субъединицы σS (RpoS) РНК-полимеразы». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 66 (3): 373–395, содержание таблицы 395. Дои:10.1128 / MMBR.66.3.373-395.2002. ISSN 1092-2172. ЧВК 120795. PMID 12208995.
^ Merino, J .; Wilkinson, A .; Coughlan, L .; Уикс, М. (март 2005 г.). «Анализ структуры РНК при разрешении одиночных нуклеотидов путем селективного ацилирования 2'-гидроксила и удлинения праймера (SHAPE)». Журнал Американского химического общества. 127 (12): 4223–4231. Дои:10.1021 / ja043822v. ISSN 0002-7863. PMID 15783204.
^ Мэтьюз, H .; Дисней, Д .; Чайлдс, L .; Schroeder, J .; Zuker, M .; Тернер, Х. (май 2004 г.). «Включение ограничений химической модификации в алгоритм динамического программирования для прогнозирования вторичной структуры РНК». Труды Национальной академии наук. 101 (19): 7287–7292. Bibcode:2004ПНАС..101.7287М. Дои:10.1073 / pnas.0401799101. ISSN 0027-8424. ЧВК 409911. PMID 15123812.
^ Soper, J .; Вудсон, А. (сентябрь 2008 г.). «Лидер мРНК rpoS рекрутирует Hfq для облегчения отжига с мРНК DsrA». РНК. 14 (9): 1907–1917. Дои:10.1261 / rna.1110608. ISSN 1355-8382. ЧВК 2525945. PMID 18658123.

Этот молекулярный или же клеточная биология статья - это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[pmid12208995-1] Хенгге-Аронис, Р. (сентябрь 2002 г.). «Передача сигнала и регуляторные механизмы, участвующие в контроле субъединицы σS (RpoS) РНК-полимеразы». Обзоры микробиологии и молекулярной биологии. 66 (3): 373–395, содержание таблицы 395. Дои:10.1128 / MMBR.66.3.373-395.2002. ISSN 1092-2172. ЧВК 120795. PMID 12208995.

[pmid15783204-2] Merino, J .; Wilkinson, A .; Coughlan, L .; Уикс, М. (март 2005 г.). «Анализ структуры РНК при разрешении одиночных нуклеотидов путем селективного ацилирования 2'-гидроксила и удлинения праймера (SHAPE)». Журнал Американского химического общества. 127 (12): 4223–4231. Дои:10.1021 / ja043822v. ISSN 0002-7863. PMID 15783204.

[pmid15123812-3] Мэтьюз, H .; Дисней, Д .; Чайлдс, L .; Schroeder, J .; Zuker, M .; Тернер, Х. (май 2004 г.). «Включение ограничений химической модификации в алгоритм динамического программирования для прогнозирования вторичной структуры РНК». Труды Национальной академии наук. 101 (19): 7287–7292. Bibcode:2004ПНАС..101.7287М. Дои:10.1073 / pnas.0401799101. ISSN 0027-8424. ЧВК 409911. PMID 15123812.

[pmid18658123-4] Soper, J .; Вудсон, А. (сентябрь 2008 г.). «Лидер мРНК rpoS рекрутирует Hfq для облегчения отжига с мРНК DsrA». РНК. 14 (9): 1907–1917. Дои:10.1261 / rna.1110608. ISSN 1355-8382. ЧВК 2525945. PMID 18658123.

[1]

[2]

[3]

[4]