SMARCA1 - SMARCA1

SMARCA1
Идентификаторы
Псевдонимы	SMARCA1, ISWI, NURF140, SNF2L, SNF2L1, SNF2LB, SNF2LT, SWI, SWI2, hSNF2L, связанный с SWI / SNF, связанный с матрицей, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство a, член 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 300012 MGI: 1935127 ГомолоГен: 55711 Генные карты: SMARCA1
Расположение гена (человек)
Chr.	Х-хромосома (человек)
Конец	129,523,500 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Х-хромосома (мышь)
Конец	47,892,974 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• отжиг геликазной активности; • Связывание ДНК; • связывание нуклеотидов; • ДНК-зависимая активность АТФазы; • GO: 0008026 геликазная активность; • гидролазная активность, действующая на ангидриды кислот, в фосфорсодержащих ангидридах; • GO: 0001948 связывание с белками; • нуклеосомозависимая активность АТФазы; • связывание нуклеиновой кислоты; • связывание нуклеосом; • гидролазная активность; • Связывание АТФ; • связывание фактора транскрипции; • АТФазная активность; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II;
Сотовый компонент	• СЕРФ комплекс; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • внутриклеточная мембраносвязанная органелла; • НУРФ комплекс;
Биологический процесс	• ремоделирование хроматина; • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • транскрипция, ДНК-шаблон; • АТФ-зависимое ремоделирование хроматина; • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон; • развитие мозга; • дифференциация нейронов; • Ренатурация цепи ДНК; • организация хроматина; • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II; • позиционирование нуклеосом;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6594
	93761
	ENSG00000102038
	ENSMUSG00000031099
	P28370
	Q6PGB8
NM_001282874; NM_001282875; NM_003069; NM_139035; NM_001378261;
	NM_001378262; NM_001378263; NM_001378264
	NM_001290708; NM_053123; NM_001358618; NM_001358619
NP_001269803; NP_001269804; NP_003060; NP_001365190; NP_001365191;
	NP_001365192; NP_001365193
	NP_001277637; NP_444353; NP_001345547; NP_001345548
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Вероятный глобальный активатор транскрипции SNF2L1 это белок что у людей кодируется SMARCA1 ген.^[5]^[6]^[7]

Белок, кодируемый этим геном, является членом SWI / SNF семейство белков. Члены этой семьи имеют геликаза и АТФаза деятельности и считаются регулирующими транскрипция определенных генов путем изменения хроматин структура вокруг этих генов. Два варианты расшифровки кодирование разных изоформы были обнаружены для этого гена.^[7]

дальнейшее чтение

Боженок Л, Уэйд П.А., Варга-Вайс П (2002). «Комплекс ремоделирования хроматина WSTF-ISWI нацелен на очаги гетерохроматической репликации». EMBO J. 21 (9): 2231–41. Дои:10.1093 / emboj / 21.9.2231. ЧВК 125993. PMID 11980720.
Магуайр ПБ, Винн К.Дж., Харни Д.Ф. и др. (2003). «Идентификация протеома фосфотирозина из тромбин-активированных тромбоцитов». Протеомика. 2 (6): 642–8. Дои:10.1002 / 1615-9861 (200206) 2: 6 <642 :: AID-PROT642> 3.0.CO; 2-I. PMID 12112843.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК 139241. PMID 12477932.
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID 14702039.
Барак О., Лаззаро М.А., Куч Н.С. и др. (2004). «Тканеспецифический, встречающийся в природе вариант человеческого SNF2L инактивирует ремоделирование хроматина». J. Biol. Chem. 279 (43): 45130–8. Дои:10.1074 / jbc.M406212200. PMID 15310751.
Ван Ф., Чжан Р., Бейшлаг ТВ и др. (2004). «Роли Brahma и Brahma / SWI2-родственного гена 1 в гипоксической индукции гена эритропоэтина». J. Biol. Chem. 279 (45): 46733–41. Дои:10.1074 / jbc.M409002200. PMID 15347669.
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК 528928. PMID 15489334.
Бантинг Г.С., Барак О., Эймс Т.М. и др. (2005). «CECR2, белок, участвующий в нейруляции, образует новый комплекс ремоделирования хроматина с SNF2L». Гм. Мол. Genet. 14 (4): 513–24. Дои:10.1093 / hmg / ddi048. PMID 15640247.
Росс М.Т., Графхэм Д.В., Коффи А.Дж. и др. (2005). «Последовательность ДНК Х-хромосомы человека». Природа. 434 (7031): 325–37. Дои:10.1038 / природа03440. ЧВК 2665286. PMID 15772651.
Лаццаро М.А., Пепин Д., Пескадор Н. и др. (2006). «Имитационный переключающий белок SNF2L регулирует экспрессию стероидогенного острого регуляторного белка во время терминальной дифференцировки клеток гранулезы яичника». Мол. Эндокринол. 20 (10): 2406–17. Дои:10.1210 / me.2005-0213. PMID 16740656.

Эта статья о ген на человека Х хромосома и / или связанный с ним белок это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000102038 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031099 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[pmid1408766-5] Окабе И., Бейли Л.С., Аттри О, Сринивасан С., Перкель Дж. М., Лоран BC, Карлсон М., Нельсон Д. Л., Нуссбаум Р. Л. (октябрь 1992 г.). «Клонирование человеческих и бычьих гомологов SNF2 / SWI2: глобального активатора транскрипции в дрожжах S. cerevisiae». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (17): 4649–55. Дои:10.1093 / nar / 20.17.4649. ЧВК 334196. PMID 1408766.

[pmid14609955-6] Барак О., Лаззаро М.А., Лейн WS, Speicher DW, Picketts DJ, Shiekhattar R (ноябрь 2003 г.). «Выделение человеческого NURF: регулятор экспрессии гена Engrailed». EMBO J. 22 (22): 6089–100. Дои:10.1093 / emboj / cdg582. ЧВК 275440. PMID 14609955.

[entrez-7] а ^б «Ген Entrez: SMARCA1, связанный с SWI / SNF, связанный с матриксом, актин-зависимый регулятор хроматина, подсемейство а, член 1».

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

SMARCA1 - SMARCA1

Рекомендации

дальнейшее чтение