Сенекавирус - Senecavirus

Сенекавирус
3CJI Senecavirus.png
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Рибовирия
Королевство:Орторнавиры
Тип:Писувирикота
Учебный класс:Pisoniviricetes
Заказ:Пикорнавиралес
Семья:Picornaviridae
Род:Сенекавирус
Типовой вид
Сенекавирус А
Синонимы
  • Вирус долины Сенека
  • Вирус долины Сенеки-001

Сенекавирус это род вирусы в порядке Пикорнавиралес, в семье Picornaviridae. Свинья и, возможно, также корова служат естественными хозяевами. В настоящее время в этом роду существует только один вид: типовой вид Сенекавирус А.[1][2] Сенекавирус компетентен в репликации онколитический пикорнавирус. Он обладает избирательным тропизмом в отношении рака с нейроэндокринными особенностями, включая мелкоклеточный рак легкого (SCLC) и несколько детских солидных опухолей, включая ретинобластому, нейробластому и медуллобластому.[3] Клинические испытания фазы I Сенекавирус у взрослых с нейроэндокринными опухолями показали, что сенекавирус, по-видимому, безопасно вводить в дозах до 1E11 vp / кг.[4]Имеет потенциал противоопухолевый Мероприятия.[5][6]

Структура

Вирусы в Сенекавирус без оболочки, с икосаэдрической, сферической и круглой геометриями, с T = псевдо3-симметрией. Диаметр около 30 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 7,3 килобайт.[1]

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
СенекавирусИкосаэдрПсевдо T = 3Без оболочкиЛинейныйОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в клетку-хозяин достигается путем прикрепления вируса к рецепторам хозяина, которые опосредуют эндоцитоз. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Вирус выходит из клетки-хозяина путем лизиса и виропоринов. Свинья и, возможно, также корова служат естественным хозяином.[1]

Рецептор вируса долины Сенека был идентифицирован как рецептор токсина сибирской язвы 1.[7]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
СенекавирусСвиньи, КороваОнколитическийЭндоцитоз клеточных рецепторовЛизисЦитоплазмаЦитоплазмаНеизвестный

Таксономия

Группа: оцРНК (+)

[2]

Открытие и происхождение

Полная последовательность генома сенекавируса была завершена в 2008 году.[8]

Об инфекционном клоне сенекавируса было сообщено в 2012 году.[9]

Предполагается, что сенекавирус атакует раковые стволовые клетки.[10]

Диагностические моноклональные антитела были созданы против сенекавируса.[11]

Хотя последовательность генома, кодирующего белок SVV, наиболее похожа на членов Кардиовирус род, некодирующая РНК внутренний сайт входа рибосомы (IRES) больше всего похож на таковые из Пестивирус род, включая вирус классической чумы свиней, и Гепацивирус род, в том числе Вирус гепатита с.[12]

РНК SVV IRES имеет сходство по последовательности, структуре и функции с IRES вируса гепатита С. Субдомен IIa IRES SVV и HCV имеет сходную структуру и функцию связывания лиганда, как видно из его кристаллической структуры.[13] Эта область субдомена IIa классифицируется как переключатель РНК, реагирующий на лиганд, который принимает четко определенные свободные от лиганда и связанные конформации без разрыва или образования каких-либо пар оснований в своей вторичной структуре при взаимном преобразовании между двумя состояниями.[14] Этот переключатель РНК из SVV IRES был включен в треугольные наноструктуры РНК.[15]

Клинические испытания

Первоначальный изолят разрабатывается в качестве противоракового терапевтического средства. виртуальная компания Neotropix, Inc. под названием NTX-010.

Фаза I

  • Исследование безопасности сенекавируса у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями.[16] Это исследование было опубликовано в 2011 году, и данные показывают, что вирус хорошо переносился 30 пациентами, и наблюдались некоторые признаки противоопухолевой активности. Эти данные потребовали дальнейшего исследования вируса в ходе испытания II фазы в г. мелкоклеточный рак легких.[4]

Фаза II

Репликация вируса

Считается, что сенекавирус интернализуется посредством интернализации, опосредованной рецептором, но рецептор-хозяин пока не идентифицирован.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  2. ^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.
  3. ^ Редди, П. С .; Берроуз, К. Д .; Hales, L.M .; Ганеш, С .; Jones, B.H .; Idamakanti, N .; Hay, C .; Li, S. S .; Skele, K. L .; Васько, А. -Дж .; Yang, J .; Уоткинс, Д. Н .; Rudin, C.M .; Халленбек, П. Л. (2007). «Вирус долины Сенека, системно доставляемый онколитический пикорнавирус и лечение нейроэндокринного рака». Журнал JNCI Национального института рака. 99 (21): 1623–1633. Дои:10.1093 / jnci / djm198. ЧВК  5261858. PMID  17971529.
  4. ^ а б Рудин С.М., Пуарье Дж. Т., Зензер Н. Н., Стивенсон Дж., Леш Д., Берроуз К. Д., Редди П. С., Ханн С. Л., Халленбек П.Л. (15 февраля 2011 г.). «Фаза I клинического исследования вируса долины Сенека (SVV-001), пикорнавируса, способного к репликации, на запущенных солидных опухолях с нейроэндокринными особенностями». Клинические исследования рака. 17 (4): 888–95. Дои:10.1158 / 1078-0432.CCR-10-1706. ЧВК  5317273. PMID  21304001. Получено 30 мая 2013.
  5. ^ Национальный институт рака Определение вируса-001 долины Сенека. Национальный институт рака Проверено 9 октября 2008.
  6. ^ Мортон С.Л., Хоутон П.Дж., Колб Е.А. и др. (Август 2010 г.). «Первоначальное тестирование репликационного вируса долины Сенека (NTX-010) программой педиатрических доклинических испытаний». Педиатр Рак крови. 55 (2): 295–303. Дои:10.1002 / pbc.22535. ЧВК  3003870. PMID  20582972.
  7. ^ Miles LA, Burga LN, Gardner EE, Bostina M, Poirier JT, Rudin CM (2017) Рецептор 1 токсина сибирской язвы является клеточным рецептором для вируса долины Сенека. J Clin Invest
  8. ^ Hales, L.M .; Ноулз, Н. Дж .; Редди, П. С .; Xu, L .; Hay, C .; Халленбек, П. Л. (2008). «Полный анализ последовательности генома вируса-001 долины Сенека, нового онколитического пикорнавируса». Журнал общей вирусологии. 89 (5): 1265–1275. Дои:10.1099 / vir.0.83570-0. PMID  18420805.
  9. ^ Poirier, J. T .; Редди, П. С .; Idamakanti, N .; Li, S. S .; Пень, К. Л .; Берроуз, К. Д .; Hallenbeck, P.L .; Рудин, Ч. М. (2012). «Характеристика полноразмерного клона инфекционной кДНК и репортерного производного GFP онколитического пикорнавируса SVV-001». Журнал общей вирусологии. 93 (Pt 12): 2606–2613. Дои:10.1099 / vir.0.046011-0. PMID  22971818.
  10. ^ Фридман, Г. К .; Кэссиди, К. А .; Beierle, E.A .; Markert, J.M .; Гиллеспи, Г. Ю. (2012). «Нацеливание на педиатрические стволовые клетки рака с помощью онколитической виротерапии». Педиатрические исследования. 71 (4–2): 500–510. Дои:10.1038 / пр.2011.58. ЧВК  3607376. PMID  22430386.
  11. ^ Ян, М .; Van Bruggen, R .; Сюй, В. (2011). «Создание и диагностическое применение моноклональных антител против вируса долины Сенека». Журнал ветеринарных диагностических исследований. 24 (1): 42–50. Дои:10.1177/1040638711426323. PMID  22362934.
  12. ^ Уиллкокс, М. М .; Шкафчик, N .; Gomwalk, Z .; Royall, E .; Бахшеш, М .; Belsham, G.J .; Idamakanti, N .; Берроуз, К. Д .; Редди, П. С .; Hallenbeck, P.L .; Робертс, Л. О. (2011). «Структурные особенности элемента внутреннего входа рибосомы вируса долины Сенека (IRES): пикорнавирус с пестивирусоподобным IRES». Журнал вирусологии. 85 (9): 4452–4461. Дои:10.1128 / JVI.01107-10. ЧВК  3126232. PMID  21325406.
  13. ^ Бурнеке, Марк; Дибров, Сергей; Гу, Цзин; Уайлс, Дэвид; Германн, Томас (11 ноября 2014 г.). «Функциональная консервация, несмотря на структурную дивергенцию в переключателях РНК, реагирующих на лиганд». Proc Natl Acad Sci U S A. 111 (45): 15952–7. Bibcode:2014ПНАС..11115952Б. Дои:10.1073 / pnas.1414678111. ЧВК  4234586. PMID  25349403.
  14. ^ Бурнеке, Марк; Германн, Томас (август 2015 г.). «Механические переключатели РНК, реагирующие на лиганд». РНК Биология. 12 (8): 780–786. Дои:10.1080/15476286.2015.1054592. ЧВК  4615790. PMID  26158858.
  15. ^ Бурнеке, Марк; Дибров, Сергей; Германн, Томас (23 февраля 2016 г.). "Дизайн самоорганизующихся нанотреугольников РНК под контролем кристаллической структуры". Angew Chem Int Ed Engl. 55 (12): 4097–100. Дои:10.1002 / anie.201600233. ЧВК  4824544. PMID  26914842.
  16. ^ «Исследование безопасности вируса долины Сенека у пациентов с солидными опухолями с нейроэндокринными особенностями».
  17. ^ «Вирус долины Сенека-001 после химиотерапии при лечении пациентов с мелкоклеточным раком легких в развернутой стадии».
  18. ^ «Вирус-001 долины Сенека и циклофосфамид в лечении молодых пациентов с рецидивирующей или рефрактерной нейробластомой, рабдомиосаркомой или редкими опухолями с нейроэндокринными особенностями».

внешняя ссылка