Тип варианта признака последовательности - Sequence feature variant type
В Тип варианта элемента последовательности (SFVT) относится к определенной вариации последовательности (мутации) данного функция последовательности в белок. Рассмотрим белок, его аминокислотная последовательность определяет его структуру и функции. Некоторые участки последовательности в первую очередь связаны с сворачивание белка, таким образом, структура, в то время как другие области связаны с функция белка, например ферментный каталитический сайт. Во многих связанных разновидность, области в соответствующем белке будут оставаться консервативными от вида к виду, в то время как точная аминокислота в каждом месте может и часто изменяется. Чтобы четко проиллюстрировать как консервативную природу функциональных областей, так и точное изменение действительной аминокислоты, определен тип варианта признака последовательности.
Функция последовательности
Признак последовательности - это в основном набор аминокислот в белке, где набор может представлять собой непрерывный диапазон или несколько дискретных остатков. Большинство характеристик последовательности взято из экспериментальных результатов, но есть некоторые из результатов вычислительного анализа.
Тип варианта элемента последовательности
Для каждого признака последовательности существуют различия между многими белками разных родственных видов. Типы вариантов определяют точную аминокислоту в каждом месте функции. Чем больше мутация в каждом месте функции, тем больше у нее типов вариантов. Для данного белка после определения его аминокислотной последовательности определяется его вариантный тип признака последовательности.
Заявление
SFVT можно использовать для изучения функций белков у многих родственных видов. Такие исследования были проведены на нескольких патогенах человека.
SFVT также доступны на База данных исследований гриппа для белков гриппа и на База данных и ресурсы для анализа вирусных патогенов для вируса денге.