Короткоцепочечная дегидрогеназа - Википедия - Short-chain dehydrogenase
| короткоцепочечная дегидрогеназа | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | adh_short | ||||||||
| Pfam | PF00106 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR002198 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00060 | ||||||||
| SCOP2 | 1HDC / Объем / СУПФАМ | ||||||||
| OPM суперсемейство | 119 | ||||||||
| Белок OPM | 1xu7 | ||||||||
| CDD | cd02266 | ||||||||
| Мембранома | 246 | ||||||||
| |||||||||
Семейство короткоцепочечных дегидрогеназ / редуктаз (SDR)[2] очень большой семья ферментов, большинство из которых, как известно, являются НАД- или НАДФ-зависимыми оксидоредуктазы. Первым представителем этого семейства была охарактеризована Drosophila алкогольдегидрогеназа, это семейство раньше называлось[3][4][5] алкогольдегидрогеназы «насекомого типа» или «короткоцепочечные». Большинство членов этого семейства представляют собой белки, состоящие примерно из 250–300 аминокислотных остатков. Большинство дегидрогеназ имеют как минимум 2 домена,[6] первый связывает кофермент, часто НАД, а второй связывает субстрат. Последний домен определяет специфичность субстрата и содержит аминокислоты, участвующие в катализе. В кофермент-связывающем домене обнаружено небольшое сходство последовательностей, хотя имеется большая степень структурного сходства, и поэтому было высказано предположение, что структура дегидрогеназ возникла в результате слияния генов общей нуклеотидной последовательности предка кофермента с различными субстрат-специфическими доменами.[6]
Подсемейства
- Глюкоза / рибитолдегидрогеназа ИнтерПро: IPR002347
- Семейство алкогольдегидрогеназ насекомых ИнтерПро: IPR002424
- 2,3-дигидро-2,3-дигидроксибензоатдегидрогеназа ИнтерПро: IPR003560
Белки человека, содержащие этот домен
BDH1; BDH2; CBR1; CBR3; CBR4; DCXR; DECR1;DECR2; DHRS1; DHRS10; DHRS13; DHRS2; DHRS3; DHRS4; DHRS4L2;DHRS7; DHRS7B; DHRS8; DHRS9; DHRSX; FASN; FVT1; HADH2;HPGD; HSD11B1; HSD11B2; HSD17B1; HSD17B10; HSD17B12; HSD17B13; HSD17B2;HSD17B3; HSD17B4; HSD17B6; HSD17B7; HSD17B7P2; HSD17B8; HSDL1; HSDL2;PECR; QDPR; RDH10; RDH11; RDH12; RDH13; RDH14; RDH16;RDH5; RDH8; RDHE2; RDHS; SCDR10; SPR; WWOX;
Рекомендации
- ^ Гош Д., Эрман М., Вавжак З., Дуакс В. Л., Пангборн В. (октябрь 1994 г.). «Механизм ингибирования 3 альфа, 20 бета-гидроксистероид дегидрогеназы стероидным ингибитором солодкового корня». Структура. 2 (10): 973–80. Дои:10.1016 / S0969-2126 (94) 00099-9. PMID 7866748.
- ^ Перссон Б., Крук М., Атриан С., Гонсалес-Дуарте Р., Джеффри Дж., Гош Д., Йорнвалл Х. (1995). «Короткоцепочечные дегидрогеназы / редуктазы (SDR)». Биохимия. 34 (18): 6003–6013. Дои:10.1021 / bi00039a038. PMID 7742302.
- ^ Вильярроя А, Хуан Э, Эгестад Б, Йорнвалл Х (1989). «Первичная структура алкогольдегидрогеназы из Drosophila lebanonensis. Обширные вариации в пределах« короткоцепочечной »алкогольдегидрогеназы насекомых, лишенной цинка». Евро. J. Biochem. 180 (1): 191–197. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1989.tb14632.x. PMID 2707261.
- ^ Перссон Б., Крук М., Йорнвалл Х. (1991). «Характеристики короткоцепочечных алкогольдегидрогеназ и родственных ферментов». Евро. J. Biochem. 200 (2): 537–543. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1991.tb16215.x. PMID 1889416.
- ^ Хараяма С., Байрох А., Хартнетт С., Рекик М., Орнстон Л.Н., Нейдл Е. (1992). «Цис-диолдегидрогеназы, кодируемые геном xylL плазмиды TOL pWW0 и хромосомным геном benD Acinetobacter calcoaceticus, являются членами суперсемейства короткоцепочечных алкогольдегидрогеназ». Евро. J. Biochem. 204 (1): 113–120. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1992.tb16612.x. PMID 1740120.
- ^ а б Беняджати К., Место AR, Пауэрс Д.А., Софер В. (1981). «Ген алкогольдегидрогеназы Drosophila melanogaster: взаимосвязь промежуточных последовательностей с функциональными доменами в белке». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 78 (5): 2717–2721. Дои:10.1073 / pnas.78.5.2717. ЧВК 319428. PMID 6789320.