Sinorhizobium medicae - Википедия - Sinorhizobium medicae

Sinorhizobium medicae
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Alphaproteobacteria
Заказ:
Ризобиальные
Семья:
Rhizobiaceae
Род:
Sinorhizobium
Разновидность:
S. medicae
Биномиальное имя
Sinorhizobium medicae
Rome et al. 1996 г.

Sinorhiozbium medicae это разновидность грамотрицательный, азотфиксирующий, стержневидный бактерии. Они могут быть свободноживущими или симбионтами бобовые растения в корневые узелки. S.medicae был впервые выделен из корневых клубеньков растений рода Medicago.[1] Некоторые штаммы S.medicae, как и WSM419, являются аэробными. Они хемоорганотрофные мезофилы которые предпочитают температуру около 28 ° C. В дополнение к своему первичному геному, эти организмы также имеют три известные плазмиды размером 1 570 951 п.н., 1245 408 п.н. и 219 313 п.н.[2]

Колонии Sinorhiozbium medicae слизистые и кольцевидные, видны здесь.

Филогения / Таксономия

Род иногда называют Ensifer (более старый термин) вместо Sinorhizobium. Две основные подгруппы включают S.medicae штамм A321 и S. medicae штамм WSM419. это филогенетическое древо показывает родство с остальной частью Rhizobiaceae семейство на основе последовательностей гена 16s рРНК.

Экологическая роль и симбиоз с бобовыми

Эта бактерия часто участвует в мутуалистический отношения с бобовыми. Выполняет атмосферные азотфиксация для растений, а взамен он получает органический углерод в процессе ризодепозиции. Свободноживущие бактерии размещаются внутри специализированных корневых клеток в корневые узелки, который создает анаэробную микробиологическую среду, в которой может происходить эффективная азотфиксация. Этот мутуализм наблюдается у многих видов растений, в том числе Medicago polymorpha и Medicago truncatula растения со всего мира.[3] Степень взаимопонимания может зависеть от pH почвы, поскольку считалось, что кислотность может сдерживать Sinorhizobium medicae. В настоящее время полагают, что кислотная устойчивость, особенно у штамма WSM419, может передаваться на плазмиды.[4]

Значение для сельского хозяйства

Потому что S. medicae хорошо сочетается с растениями этого рода Medicago и увеличивает рост растений, посевные поля обычно заражаются бактериями в дополнение к синтетическим удобрениям или вместо них.[5]

Рекомендации

  1. ^ Чен, WX; Ян, GH; Ли, Дж. Л. (1988). «Численное таксономическое исследование быстрорастущих ризобий сои и предложение отнести Rhizobium fredii к Sinorhizobium gen. Nov». Международный журнал систематической бактериологии. 38: 392–397. Дои:10.1099/00207713-38-4-392.
  2. ^ Рив, Вт; Цепь, П; О'Хара, G; Ардли, Дж; Nandesena, K; Bräu, L; Tiwari, R; Малфатти, S; Поцелуй, H; Лапидус, А; Коупленд, А; Нолан, М; Земля, м; Хаузер, L; Чанг, YJ; Иванова, Н; Мавроматис, К; Марковиц, V; Кирпид, N; Голлахер, М; Йейтс, Р. Дилворт, М; Ховисон, Дж (2010). «Полная последовательность генома микросимбионта Medicago Ensifer (Sinorhizobium) medicae штамм WSM419». Стандарты геномных наук. 2: 77–86. Дои:10.4056 / сиг.43526. ЧВК  3035259. PMID  21304680.
  3. ^ Рим, S; Фернандес, член парламента; Брюнель, Б. Норманд, П; Cleyet-Marel, JC (1996). «Sinorhizobium medicae sp. Nov., Выделенный из однолетних видов Medicago». Международный журнал систематической бактериологии. 46: 972–980. Дои:10.1099/00207713-46-4-972. PMID  8863426.
  4. ^ "Sinorhizobium medicae WSM419". Портал генома JGI. Министерство энергетики США.
  5. ^ Ши, Руйхуа. «Секвенирование генома Sinorhizoibum, аннотации и фиксация азота». Университет Оклахомы.