TRAF3IP3 - TRAF3IP3

TRAF3IP3
Идентификаторы
ПсевдонимыTRAF3IP3, T3JAM, TRAF3 взаимодействующий белок 3
Внешние идентификаторыOMIM: 608255 MGI: 2441706 ГомолоГен: 11885 Генные карты: TRAF3IP3
Расположение гена (человек)
Хромосома 1 (человек)
Chr.Хромосома 1 (человек)[1]
Хромосома 1 (человек)
Геномное расположение TRAF3IP3
Геномное расположение TRAF3IP3
Группа1q32.2Начинать209,756,032 бп[1]
Конец209,782,320 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE TRAF3IP3 205804 s в формате fs.png

PBB GE TRAF3IP3 213888 s в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001287754
NM_025228
NM_001320143
NM_001320144

NM_153137

RefSeq (белок)

NP_001274683
NP_001307072
NP_001307073
NP_079504

NP_694777

Расположение (UCSC)Chr 1: 209.76 - 209.78 МбChr 1: 193.18 - 193,2 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

TRAF3-взаимодействующий JNK-активирующий модулятор это белок что у людей кодируется TRAF3IP3 ген.[5][6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции TRAF3IP3. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Traf3ip3tm1a (КОМП) Wtsi[12][13] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse Программа - проект мутагенеза с высокой пропускной способностью, направленный на создание и распространение животных моделей болезней среди заинтересованных ученых.[14][15][16]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[10][17] Было проведено 23 теста на гомозиготных мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[10] У мужчин наблюдалось снижение лейкоцит подсчет и самки имели повышенную восприимчивость к бактериальная инфекция.[10]

Взаимодействия

TRAF3IP3 был показан взаимодействовать с STRN,[18] MOBKL3,[18] STK24[18] и FAM40A.[18]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000009790 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037318 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Дадгостар Х., Дойл С.Е., Шахангиан А., Гарсия Д.Е., Ченг Дж. (Октябрь 2003 г.). «T3JAM, новый белок, который специфически взаимодействует с TRAF3 и способствует активации JNK (1)». Письма FEBS. 553 (3): 403–7. Дои:10.1016 / S0014-5793 (03) 01072-X. PMID  14572659.
  6. ^ "Ген Entrez: TRAF3IP3 TRAF3 взаимодействующий белок 3".
  7. ^ «Гематологические данные для Traf3ip3». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ "Сальмонелла данные о заражении Traf3ip3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ "Citrobacter данные о заражении Traf3ip3 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ а б c d Гердин, AK (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  11. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  12. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  13. ^ "Информатика генома мыши".
  14. ^ Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  15. ^ Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  16. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  17. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  18. ^ а б c d Гудро М., Д'Амброзио Л.М., Кин М.Дж., Маллин М.Дж., Ларсен Б.Г., Санчес А., Чаудри С., Чен Г.И., Сичери Ф., Несвижский А.И., Эберсолд Р., Рот Б., Гинграс А.С. (январь 2009 г.). «Сеть взаимодействия с высокой плотностью фосфатазы PP2A идентифицирует новый комплекс фосфатазы и киназы, взаимодействующий со стриатином, связанный с белком кавернозной мальформации 3 головного мозга (CCM3)». Молекулярная и клеточная протеомика. 8 (1): 157–71. Дои:10.1074 / mcp.M800266-MCP200. ЧВК  2621004. PMID  18782753.

дальнейшее чтение

  • Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
  • Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
  • Василеску Дж., Цвайциг Д. Р., Денис Н. Дж., Смит Дж. К., Этье М., Хейнс Д. С., Фигейз Д. (январь 2007 г.). «Протеомный реактор облегчает анализ аффинно очищенных белков с помощью масс-спектрометрии: приложение для идентификации убиквитинированных белков в клетках человека». Журнал протеомных исследований. 6 (1): 298–305. CiteSeerX  10.1.1.401.4220. Дои:10.1021 / pr060438j. PMID  17203973.
  • Чжан Ц., Се Л., Ченг Х, Ван И (февраль 2007 г.). «TRAF3 взаимодействует с Smac / DIABLO и усиливает проапоптотический эффект Smac / DIABLO в цитоплазме». Acta Biochimica et Biophysica Sinica. 39 (2): 108–16. Дои:10.1111 / j.1745-7270.2007.00259.x. PMID  17277885.
  • Ма Х, Ван Х, Гао Х, Ван Л., Лу И, Гао П, Дэн В., Ю П, Ма Дж, Го Дж, Ченг Х, Чжан Ц, Ши Т, Ма Д. (сентябрь 2007 г.). «Идентификация пяти новых генов человека, связанных с пролиферацией клеток, путем клеточного скрининга из экспрессированной библиотеки ORF кДНК». Науки о жизни. 81 (14): 1141–51. Дои:10.1016 / j.lfs.2007.08.006. PMID  17868742.