Тобамовирус - Tobamovirus
Тобамовирус | |
---|---|
Вирус табачной мозаики (TMV) диаграмма и электронная микрофотография вирионов | |
Классификация вирусов | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область: | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Kitrinoviricota |
Учебный класс: | Alsuviricetes |
Заказ: | Мартелливиралес |
Семья: | Virgaviridae |
Род: | Тобамовирус |
Типовой вид | |
Вирус табачной мозаики |
Тобамовирус это род вирусы с положительной цепью РНК в семье Virgaviridae.[2] Многие растения, в том числе табак, картофель, помидор, и давить, служат естественными хозяевами. Заболевания, связанные с этим родом, включают: некротические поражения на листьях.[2][3] Название Тобамовирус исходит от хозяина и симптомов первого обнаруженного вируса (Вирус табачной мозаики).[4]
Внутри этого рода есть четыре неформальные подгруппы: это тобамовирусы, которые инфицируют брассики, тыквенные,мальвовый, и пасленовый растения. Основные различия между этими группами заключаются в последовательностях генома и соответствующем диапазоне растений-хозяев.[нужна цитата ] В настоящее время этот род насчитывает 37 видов, включая типовые виды. Вирус табачной мозаики.[5]
Структура
Тобамовирусы не имеют оболочки, имеют спиральную геометрию стержня и спиральную симметрию. Диаметр около 18 нм, длина 300–310 нм. Геномы бывают линейными и несегментированными, длиной около 6,3–6,5 килобайт.[2][3]
Геном
Геном РНК кодирует не менее четырех полипептиды:[2] эти неструктурный белок и продукт считывания, который участвует в репликации вируса (РНК-зависимая РНК-полимераза, RdRp); в белок движения (MP), который необходим для перемещения вируса между клетками и белок оболочки (CP). Считываемая часть RdRp может быть экспрессирована в TMV как отдельный белок.[6] Вирус способен размножаться без движения или белков оболочки, но два других важны. Неструктурный белок имеет домены, предполагающие, что он участвует в кэппировании РНК, а продукт считывания имеет мотив РНК-полимеразы. Белки движения вырабатываются очень рано в инфекционном цикле и локализуются в плазмодесматы, они, вероятно, участвуют в специфичности хозяина, поскольку, как полагают, взаимодействуют с некоторыми факторами клетки-хозяина.[нужна цитата ]
Жизненный цикл
Репликация вируса происходит в цитоплазме. Вхождение в хозяйскую клетку достигается путем проникновения в хозяйскую клетку. Репликация следует модели репликации вируса с положительной цепью РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Перевод происходит путем подавления прекращения. Вирус покидает клетку-хозяина за счет одностороннего вирусного движения без канальцев. Растения служат естественным хозяином. Пути передачи механические.[2][3]
Пути заражения
Инфекция изначально локализована, но если вирус не будет поражен, он будет распространяться через сосудистую систему в системную инфекцию. Точный механизм передвижения вируса по растению неизвестен, но взаимодействие пектин метилэстераза, сотовый фермент важно для клеточная стенка метаболизм и развитие растений, с белком движения.[7]
Эволюция
Считается, что эти вирусы произошли от общего предка со своими хозяевами.[8] Существует по крайней мере 3 различных клада тобамовирусов, которые в некоторой степени соответствуют диапазону их хозяев: то есть одна заражающая пасленовый разновидность; второе заражение тыквенные и бобовые а третий заразил крестоцветные.[9]
Классификация
Разновидность
- Вирус мозаики болгарского перца (BPeMV)
- Вирус легкой крапчатости бругмансии
- Вирус легкой крапчатости кактуса (CMMoV)[10]
- Вирус желтой крапчатости клитории
- Вирус крапчатой мозаики плодов огурца
- Вирус зеленой крапчатой мозаики огурца (CGMMV)
- Вирус крапчатости огурца
- Вирус мозаики франжипани (FrMV)
- Скрытый вирус гибискуса Форт-Пирс (HLFPV)
- Латентный сингапурский вирус гибискуса (HLSV)
- Кюри вирус зеленой крапчатой мозаики
- Вирус мозаики маракуйя (MarMV)
- Вирус перца Обуда (ОбПВ)
- Вирус кольцевой пятнистости Odontoglossum (ORSV)
- Вирус хлоротичной кольцевой пятнистости опунции
- Вирус легкой крапчатости паприки
- Вирус мозаики маракуйи
- Вирус легкой крапчатости перца (PMMoV)
- Вирус мозаики плюмерии
- Вирус, связанный с некрозом кактуса Rattail (RCNaV)
- Вирус мозаики реманнии
- Вирус мозаики рибграсс (ВСР)
- Вирус опунции Саммонса (SOV)
- Вирус ломки цветков Streptocarpus
- Вирус мозаики сунн-конопли (ШМВ)
- Латентный вирус табака
- Вирус табачной мягкой зеленой мозаики
- Вирус плода коричневой морщинистости помидоров (ToBRFV)
- Вирус томатной мозаики (ToMV)
- Вирус табачной мозаики (T2MV) - тип Виды
- Вирус крапчатой мозаики томатов
- Вирус мозаики тропических содовых яблок
- Вирус, очищающий прожилки репы (TVCV)
- Вирус легкой крапчатости Ullucus
- Вирус крапчатости васаби (WMoV)
- Вирус легкой крапчатости желтого хвостового цветка
- Вирус мозаики Youcai (YoMV) он же вирус мозаики масличного рапса (ORMV)
- Вирус зеленой крапчатой мозаики цукини[11]
Предлагаемые члены
Предлагаемые, но в настоящее время неизвестные представители рода включают:[11]
- Вирус Chara corallina (CCV)
- Вирус мозаики Nicotiana velutina (NVMV)
Рекомендации
- ^ «Таксономия вирусов: выпуск 2018b». Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2019 г.. Получено 18 марта 2019.
- ^ а б c d е "Интернет-отчет ICTV Virgaviridae".
- ^ а б c «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
- ^ https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/Ratification_1975.pdf
- ^ ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.». Получено 15 июн 2015.
- ^ Creager AN, Scholthof KB, Citovsky V, Scholthof HB (март 1999). «Вирус табачной мозаики. Новаторские исследования за столетие». Растительная клетка. 11 (3): 301–8. Дои:10.1105 / tpc.11.3.301. ЧВК 1464663. PMID 10072391.
- ^ Чен М.Х., Цитовский В. (август 2003 г.). «Системное перемещение тобамовируса требует пектинметилэстеразы клетки-хозяина». Журнал растений. 35 (3): 386–92. Дои:10.1046 / j.1365-313X.2003.01818.x. PMID 12887589.
- ^ Стоббе А.Х., Мельчер У., Палмер М.В., Русинк М.Дж., Шен Дж. (Февраль 2012 г.). «Ко-дивергенция и смена хозяина в эволюции тобамовирусов». Журнал общей вирусологии. 93 (Pt 2): 408–18. Дои:10.1099 / vir.0.034280-0. PMID 22049092.
- ^ Lartey RT, Voss TC, Melcher U (декабрь 1996 г.). «Эволюция тобамовируса: перекрытия генов, рекомбинация и таксономические последствия» (PDF). Молекулярная биология и эволюция. 13 (10): 1327–38. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025579. PMID 8952077.
- ^ Мин Би, Чанг Б. Н., Ким М. Дж., Ха Дж Х, Ли Б., Рю К. Х. (январь 2006 г.). «Вирус легкой крапчатости кактусов - новый тобамовирус, поражающий кактусы». Архив вирусологии. 151 (1): 13–21. Дои:10.1007 / s00705-005-0617-7. PMID 16132178. S2CID 40760030.
- ^ а б «Описание вирусов растений: группа тобамовирусов». Ассоциация прикладных биологов (AAB).
дальнейшее чтение
- Хагивара Ю., Комода К., Яманака Т., Тамай А., Меши Т., Фунада Р., Цучия Т., Наито С., Исикава М. (январь 2003 г.). «Субклеточная локализация белков-хозяев и вирусных белков, связанных с репликацией РНК тобамовируса». Журнал EMBO. 22 (2): 344–53. Дои:10.1093 / emboj / cdg033. ЧВК 140108. PMID 12514140.