URA3 - URA3

Оротидин 5'-фосфатдекарбоксилаза
Идентификаторы
Организм	Saccharomyces cerevisiae
Символ	URA3
Альт. символы	YEL021W, ODCase
Entrez	856692
HomoloGene	136914
RefSeq (мРНК)	NM_001178836
RefSeq (Prot)	NP_010893
UniProt	P03962
Прочие данные
Номер ЕС	4.1.1.23
Хромосома	V: 0.12 - 0.12 Мб
Ищи Структуры Швейцарская модель Домены ИнтерПро

URA3 - это ген на хромосома V в Saccharomyces cerevisiae (дрожжи). Его систематическое название YEL021W. URA3 часто используется в исследованиях дрожжей в качестве «маркерного гена», то есть гена для маркировки хромосом или плазмиды. URA3 кодирует Оротидин 5'-фосфатдекарбоксилаза (ODCase), что является фермент который катализирует одну реакцию в синтезе пиримидин рибонуклеотиды (компонент РНК ).^[1]

Использование в исследовании дрожжей

Потеря активности ODCase приводит к отсутствию роста клеток, если только урацил или же уридин добавлен в СМИ. Присутствие гена URA3 в дрожжах восстанавливает активность ODCase, облегчая рост на средах, не содержащих урацил или уридин, тем самым делая возможным отбор дрожжей, несущих ген. Напротив, если 5-FOA (5-фтороротовая кислота) добавляется в среду, активная ODCase превращает 5-FOA в токсичное соединение ( ингибитор суицида ) 5-фторурацил вызывает гибель клеток, что позволяет проводить отбор против дрожжей, несущих ген.

Поскольку URA3 допускает как положительный, так и отрицательный отбор, он был разработан как генетический маркер для трансформации ДНК и других генетических методов у бактерий и многих видов грибов. Это один из самых важных генетических маркеров в дрожжи генетическая модификация. Хотя URA3 является мощным выбираемым маркером, он имеет высокий фон. Это связано с тем, что клетки, улавливающие мутации в URA3, также могут расти на 5-FOA. Колонии следует проверить с помощью второго анализа, такого как ПЦР, чтобы подтвердить, что нужный штамм был создан.

внешняя ссылка

База данных S. cerevisiae (2018) Ген URA3. https://www.yeastgenome.org/locus/S000000747

Рекомендации