VFDB - VFDB

База данных факторов вирулентности
Содержание
ОписаниеБаза данных, отслеживающая факторы вирулентности бактерий
Типы данных
захвачен
Патогенные бактерии
ОрганизмыБактерии
Контакт
Основное цитированиеPMID  15608208
Доступ
Интернет сайтwww.mgc.ac.cn/ VFs/главный.htm
Разное
Закладки
сущности
да

VFDB также известный как База данных факторов вирулентности это база данных что обеспечивает ученый быстрый доступ к факторы вирулентности в бактериальные патогены.[1] По нему можно перемещаться и просматривать с помощью род или слова. А ВЗРЫВ инструмент для поиска по известным факторы вирулентности.[2] VFDB содержит коллекцию из 16 важных бактериальные возбудители.[1] Скрипты Perl были использованы для извлечения положений и последовательностей VF из GenBank.[3] Кластеры ортологичных групп (COG) использовались для обновления неполных аннотаций.[1] Дополнительная информация была получена NCBI. VFDB был построен на Linux операционные системы на DELL PowerEdge 1600SC серверы.

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б c Чен, Л. (2004-12-17). «VFDB: справочная база данных по факторам вирулентности бактерий». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (Проблема с базой данных): D325 – D328. Дои:10.1093 / нар / gki008. ISSN  1362-4962. ЧВК  539962. PMID  15608208.
  2. ^ Альтчул, С. (01.09.1997). «Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска по базе данных белков». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (17): 3389–3402. Дои:10.1093 / nar / 25.17.3389. ISSN  1362-4962. ЧВК  146917. PMID  9254694.
  3. ^ Бенсон, Д. А .; Карш-Мизрахи, И .; Lipman, D. J .; Ostell, J .; Сэйерс, Э. У. (01.01.2009). «ГенБанк». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (База данных): D26 – D31. Дои:10.1093 / nar / gkn723. ISSN  0305-1048. ЧВК  2686462. PMID  18940867.