VFDB - VFDB
Содержание | |
---|---|
Описание | База данных, отслеживающая факторы вирулентности бактерий |
Типы данных захвачен | Патогенные бактерии |
Организмы | Бактерии |
Контакт | |
Основное цитирование | PMID 15608208 |
Доступ | |
Интернет сайт | www |
Разное | |
Закладки сущности | да |
VFDB также известный как База данных факторов вирулентности это база данных что обеспечивает ученый быстрый доступ к факторы вирулентности в бактериальные патогены.[1] По нему можно перемещаться и просматривать с помощью род или слова. А ВЗРЫВ инструмент для поиска по известным факторы вирулентности.[2] VFDB содержит коллекцию из 16 важных бактериальные возбудители.[1] Скрипты Perl были использованы для извлечения положений и последовательностей VF из GenBank.[3] Кластеры ортологичных групп (COG) использовались для обновления неполных аннотаций.[1] Дополнительная информация была получена NCBI. VFDB был построен на Linux операционные системы на DELL PowerEdge 1600SC серверы.
Смотрите также
Рекомендации
- ^ а б c Чен, Л. (2004-12-17). «VFDB: справочная база данных по факторам вирулентности бактерий». Исследования нуклеиновых кислот. 33 (Проблема с базой данных): D325 – D328. Дои:10.1093 / нар / gki008. ISSN 1362-4962. ЧВК 539962. PMID 15608208.
- ^ Альтчул, С. (01.09.1997). «Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска по базе данных белков». Исследования нуклеиновых кислот. 25 (17): 3389–3402. Дои:10.1093 / nar / 25.17.3389. ISSN 1362-4962. ЧВК 146917. PMID 9254694.
- ^ Бенсон, Д. А .; Карш-Мизрахи, И .; Lipman, D. J .; Ostell, J .; Сэйерс, Э. У. (01.01.2009). «ГенБанк». Исследования нуклеиновых кислот. 37 (База данных): D26 – D31. Дои:10.1093 / nar / gkn723. ISSN 0305-1048. ЧВК 2686462. PMID 18940867.
Этот Биологическая база данных -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |