VPS25 - VPS25

VPS25
Белок VPS25 PDB 2ZME.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыVPS25, DERP9, EAP20, FAP20, вакуумная сортировка белков 25 гомолог
Внешние идентификаторыOMIM: 610907 MGI: 106354 ГомолоГен: 6303 Генные карты: VPS25
Расположение гена (человек)
Хромосома 17 (человек)
Chr.Хромосома 17 (человек)[1]
Хромосома 17 (человек)
Геномное расположение для VPS25
Геномное расположение для VPS25
Группа17q21.2Начинать42,773,449 бп[1]
Конец42,779,599 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE VPS25 gnf1h00737 на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_032353

NM_001284411
NM_001284412
NM_001284414
NM_026776

RefSeq (белок)

NP_115729
NP_115729.1

NP_001271340
NP_001271341
NP_001271343
NP_081052

Расположение (UCSC)Chr 17: 42.77 - 42.78 МбChr 11: 101,25 - 101,26 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши
Субъединица комплекса ESCRT-II
PDB 1xb4 EBI.jpg
кристаллическая структура субъединицы vps25 эндосомального транспортного комплекса escrt-ii
Идентификаторы
СимволESCRT-II
PfamPF05871
ИнтерПроIPR008570

Вакуолярный белок, связанный с сортировкой белков 25 это белок что у людей кодируется VPS25 ген.[5][6]

Это компонент связанного с эндосомами сложный ESCRT-II (Эндосомальный Сортировочные комплексы, необходимые для транспортного белка II). Комплексы ESCRT (ESCRT-I, -II, -III) организуют эффективную сортировку убиквитинированный трансмембранные рецепторы к лизосомы через мультивезикулярные тела (MVB).[7] ESCRT-II задействует транспортные средства для сортировки белков в MVB.[8] В дополнение человек Было показано, что ESCRT-II образует комплекс с РНК-полимераза II коэффициент удлинения ELL чтобы оказать транскрипционный контрольная деятельность. ESCRT-II временно ассоциируется с эндосомальная мембрана и тем самым инициирует образование ESCRT-III, мембранно-ассоциированного белковый комплекс который функционирует непосредственно после ESCRT-II во время сортировки груза MVB. ESCRT-II, в свою очередь, функционирует ниже ESCRT-I, белкового комплекса, который связывается с убиквитинированным эндосомным грузом.[9]

ESCRT-II - это трехгранный комплекс, состоящий из двух копий vps25, одной копии vps22 и С-концевой области vps36. В Кристальная структура of vps25 выявил два домена с крылатой спиралью, N-концевой домен vps25, взаимодействующий с vps22 и vps36.[10]


Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131475 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000078656 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Йорикава К., Шибата Х, Вагури С., Хатта К., Хории М., Катох К., Кобаяши Т., Учияма Ю., Маки М. (март 2005 г.). «Человеческий CHMP6, миристоилированный белок ESCRT-III, непосредственно взаимодействует с компонентом EAP20 ESCRT-II и регулирует сортировку эндосомного груза». Biochem J. 387 (Пт 1): 17–26. Дои:10.1042 / BJ20041227. ЧВК  1134928. PMID  15511219.
  6. ^ "Ген Entrez: VPS25 вакуолярный белок сортировки 25 гомолог (S. cerevisiae)".
  7. ^ Джилл Диджей, Тео Х, Сан Дж., Перишич О., Вепринцев Д.Б., Эмр С.Д., Уильямс Р.Л. (январь 2007 г.). «Структурное понимание связи ESCRT-I / -II и ее роли в торговле MVB». EMBO J. 26 (2): 600–12. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601501. ЧВК  1783442. PMID  17215868.
  8. ^ Тео Х., Перишич О., Гонсалес Б., Уильямс Р.Л. (октябрь 2004 г.). «ESCRT-II, комплекс, связанный с эндосомами, необходимый для сортировки белков: кристаллическая структура и взаимодействия с ESCRT-III и мембранами». Dev. Клетка. 7 (4): 559–69. Дои:10.1016 / j.devcel.2004.09.003. PMID  15469844.
  9. ^ Бабст М., Кацманн Д. Д., Снайдер В. Б., Вендланд Б., Эмр С. Д. (август 2002 г.). «Связанный с эндосомами комплекс, ESCRT-II, задействует транспортные механизмы для сортировки белков в мультивезикулярном теле». Dev. Клетка. 3 (2): 283–9. Дои:10.1016 / S1534-5807 (02) 00219-8. PMID  12194858.
  10. ^ Вернимонт А.К., Вайссенхорн В. (декабрь 2004 г.). «Кристаллическая структура субъединицы VPS25 эндосомального транспортного комплекса ESCRT-II». BMC Struct. Биол. 4 (1): 10. Дои:10.1186/1472-6807-4-10. ЧВК  539351. PMID  15579210.

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR008570