МРНК Xanthomonas - Xanthomonas sRNA

В молекулярной биологии Ксантомонады мРНК находятся малые РНК которые были идентифицированы у различных видов бактерия Ксантомонады.

Анализ возбудитель растений Xanthomonas campestris pv. везикатория выявили экспрессию семи цис-кодированных антисмысловой РНК (asX1-asX7) и 15 межгенных мРНК (sX1 - sX15). Несколько мРНК также были идентифицированы в Xanthomonas campestris pathovar campestris. Что-нибудь из этого X. campestris мРНК встречаются только в Ксантомонады, некоторые также экспрессируются в других бактериях.[1][2] Некоторые из этих мРНК, по-видимому, способствуют вирулентность, включая sX12, sX13 и мРНК-Xcc1.[1][3][4]

Вычислительный анализ предсказывает 63 мРНК в Xanthomonas oryzae pathovar oryzae, экспрессия 8 из них подтверждена экспериментально. Выражение трех из них Hfq -зависимый.[5]

Смотрите также

Рекомендации

  1. ^ а б Schmidtke C, Findeiß S, Sharma CM, Kuhfuß J, Hoffmann S, Vogel J, et al. (2011). «Полногеномный анализ транскриптома растительного патогена Xanthomonas выявляет мРНК с предполагаемой функцией вирулентности». Нуклеиновые кислоты Res. 40 (5): 2020–31. Дои:10.1093 / nar / gkr904. ЧВК  3300014. PMID  22080557.
  2. ^ Цзян Р.П., Тан DJ, Чен XL, Хе YQ, Фэн Дж. Х, Цзян Б.Л. и др. (2010). «Идентификация четырех новых малых некодирующих РНК из Xanthomonas campestris pathovar campestris». BMC Genomics. 11: 316. Дои:10.1186/1471-2164-11-316. ЧВК  2996969. PMID  20482898.
  3. ^ Chen XL, Tang DJ, Jiang RP, He YQ, Jiang BL, Lu GT и др. (2011). «sRNA-Xcc1, транс-действующая sRNA, кодируемая интегроном и переносимая плазмидой, находится под положительным контролем ключевых регуляторов вирулентности HrpG и HrpX Xanthomonas campestris pathovar campestris». РНК Биол. 8 (6): 947–953. Дои:10.4161 / rna.8.6.16690. ЧВК  3256417. PMID  21941121.
  4. ^ Шмидтке, К; Abendroth, U; Брок, Дж; Серрания, Дж; Беккер, А; Бонас, Ю (сентябрь 2013 г.). «Малая РНК sX13: многогранный регулятор вирулентности в растительном патогене Xanthomonas». Патогены PLOS. 9 (9): e1003626. Дои:10.1371 / journal.ppat.1003626. ЧВК  3771888. PMID  24068933.
  5. ^ Лян Х, Чжао Ю.Т., Чжан Дж.К., Ван XJ, Фанг RX, Цзя Ю.Т. (2011). «Идентификация и функциональная характеристика малых некодирующих РНК в Xanthomonas oryzae pathovar oryzae». BMC Genomics. 12: 87. Дои:10.1186/1471-2164-12-87. ЧВК  3039613. PMID  21276262.