ABAT - Википедия - ABAT

ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ
Идентификаторы
ПсевдонимыЛЕТУЧАЯ МЫШЬ, Abat, 9630038C02Rik, AI255750, ENSMUSG00000051226, Gabaat, Gabat, Gm9851, I54, Laibat, X61497, GABA-AT, NPD009, 4-аминобутират аминотрансфераза
Внешние идентификаторыOMIM: 137150 MGI: 2443582 ГомолоГен: 542 Генные карты: ЛЕТУЧАЯ МЫШЬ
Номер ЕС2.6.1.22
Расположение гена (человек)
Хромосома 16 (человек)
Chr.Хромосома 16 (человек)[1]
Хромосома 16 (человек)
Геномное местоположение для ABAT
Геномное местоположение для ABAT
Группа16p13.2Начинать8,674,596 бп[1]
Конец8,784,575 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

18

268860

Ансамбль

ENSG00000183044

ENSMUSG00000057880

UniProt

P80404

P61922

RefSeq (мРНК)

NM_000663
NM_001127448
NM_020686

NM_001170978
NM_172961

RefSeq (белок)

NP_000654
NP_001120920
NP_065737

NP_001164449
NP_766549

Расположение (UCSC)Chr 16: 8.67 - 8.78 МбChr 16: 8.51 - 8.62 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

4-аминобутират аминотрансфераза это белок что у человека кодируется ABAT ген.[5] Этот ген расположен в хромосоме 16 в положении 13.2.[6] Этот ген также имеет другое название, например ГАМК, ГАБАТ, 4-аминобутират трансаминаза, NPD009 и т. Д.[6] Этот ген в основном и в большом количестве расположен в нейрональные ткани.[7] 4-Аминобутират аминотрансфераза относится к группе пиридоксаль-5-фосфат-зависимых ферментов, которые активируют большую часть, давая реакцию на аминокислоты.[8] ABAT состоит из двух мономеров ферментов, каждая субъединица которых имеет молекулярную массу 50 кДа.[9] Установлено, что почти ряд синапсов человека имеет ГАМК.[6] ГАМК это нейротрансмиттер который играет разные роли в разных областях центральной и периферической нервной системы. Его также можно найти в некоторых тканях, не имеющих нейронов.[6] Кроме того, GAD и ГАМК-АТ несут ответственность за регулирование концентрации ГАМК.[10]

Характеристика

Особенностью ГАМК является то, что он не флуоресцентный и не электроактивный, поэтому трудно определить реакцию ферментов, поскольку не было идентифицировано пероксидаза и дегидрогеназа.[11] Одной из характеристик ГАМК является низкий уровень липофильности, что затрудняет преодоление гематоэнцефалического барьера. Многие исследователи пытались открыть молекулы, обладающие высокой липофильностью.[10] Количественная оценка концентрации ГАМК во время клеточной активности должна иметь высокое пространственное и временное разрешение. Как и прежде, высокоэффективная жидкостная хроматография (ВЭЖХ ) был использован для количественного определения уровней концентрации ГАМК. В настоящее время анализируется ГАМК, измеряется в небольшом объеме за короткий период времени с использованием электрохемилюминесценции.[11] ГАМК действует как тропический фактор, который затем влияет на некоторую активность клеток, такую ​​как быстрое размножение клеток, гибель и дифференцировка клеток. Внутриклеточная коммуникация также является одной из многих функций ГАМК вне нервной системы.[11]

Функция

4-аминобутират аминотрансфераза (ABAT) отвечает за катаболизм из гамма-аминомасляная кислота (ГАМК), важный, в основном тормозящий нейротрансмиттер в Центральная нервная система, в янтарный полуальдегид. Активный фермент - это гомодимер субъединиц 50 кДа в комплексе с пиридоксаль-5-фосфат. Последовательность белка более чем на 95% аналогична белку свиньи. ABAT в печени и мозге контролируется двумя кодоминантными аллелями с частотой 0,56 и 0,44 в популяции европеоидной расы.[5] ГАМК действует как тропический фактор, который затем влияет на некоторую активность клеток, такую ​​как быстрое размножение клеток, гибель и дифференцировка клеток. Внутриклеточная коммуникация также является одной из многих функций ГАМК вне нервной системы.[11] Производство фермента ГАМК-трансаминазы осуществлялось под управлением гена ABAT. Основная функция ABAT - ингибирование (нейротрансмиттер), при котором он предотвращает перегрузку мозга из-за большого количества сигналов.[6]

ABAT активирует начало ухудшения ГАМК. Точно так же подавление ABAT приводит к истощению временной релаксации нижнего сфинктера пищевода (TLESR) и активности кислотного рефлюкса. Лечение ГЭРБ - это возможное средство подавления физиологии ABAT.[7]

ABAT Дефицит

Дефект ABAT - необычное заболевание. Признаки и симптомы этого дефицита наблюдались у голландской семьи, у двух братьев и сестер и у шестимесячного японского педиатра. У этих пациентов наблюдаются те же признаки и симптомы. Это включает низкий мышечный тонус или известный как синдром гибкого ребенка, чрезмерно отзывчивые рефлексы и задержка в развитии.[12] Фенотип дефицита ABAT включает психомоторную отсталость, гипотония, гиперрефлексия, вялость, рефрактерность припадки, и ЭЭГ аномалии. Для этого гена было обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих одну и ту же изоформу белка.[5] Аномальный ГАМК-трансаминаза Фермент приводит к энцефалопатии, которая наблюдается у педиатрических пациентов, и этот дефицит имеет ожидаемую продолжительность жизни менее 2 лет, а некоторые выживают дольше, чем данная ожидаемая продолжительность жизни. Аномальный белок, высвобождаемый из неконтролируемого количества ГАМК, будет влиять на рост человека (гормон роста).[6]

Снижение уровня концентрации ГАМК вызывает судороги.[13]

Лекарство

Вигабатрин это препарат, который непоправимо подавляет трансаминазу ГАМК, которая вызывает повышенное количество ГАМК в головном мозге.[14]

Открытие

В недавнем исследовании было обнаружено, что увеличение количества ГАМК остановит последствия наркозависимости.[15] Подавление ABAT, которое вызывает увеличение количества ГАМК, связано с детьми, страдающими двигательной инвалидностью.[12] Этот ген также является одной из генетических причин ГЭРБ.[7]

Было доказано, что ABAT важен для митохондриальных нуклеозидов.[13]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000183044 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000057880 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б c «Энтрез Ген: 4-аминобутират аминотрансфераза».
  6. ^ а б c d е ж Ватанабе М., Маэмура К., Канбара К., Тамаяма Т., Хаясаки Х (2002). «ГАМК- и ГАМК-рецепторы в центральной нервной системе и других органах». Международный обзор цитологии. Эльзевир. 213: 1–47. Дои:10.1016 / s0074-7696 (02) 13011-7. ISBN  9780123646170. PMID  11837891.
  7. ^ а б c Джирхольт Дж., Аслинг Б., Хаммонд П., Дэвидсон Дж., Кнутссон М., Валентинссон А., Йенсен Дж. М., Леманн А., Агреус Л., Лагерстрём-Фермер М. (апрель 2011 г.). «4-аминобутират аминотрансфераза (ABAT): генетические и фармакологические доказательства участия в гастроэзофагеальной рефлюксной болезни». PLOS ONE. 6 (4): e19095. Дои:10.1371 / journal.pone.0019095. ЧВК  3084265. PMID  21552517.
  8. ^ Маркова М., Пенефф С., Хьюлинс М.Дж., Ширмер Т., Джон Р.А. (октябрь 2005 г.). «Детерминанты субстратной специфичности омега-аминотрансфераз». Журнал биологической химии. 280 (43): 36409–16. Дои:10.1074 / jbc.m506977200. PMID  16096275.
  9. ^ Черчич JE (сентябрь 1982 г.). «4-Аминобутиратаминотрансфераза. Различная восприимчивость к ингибиторам, микроокружение сайта связывания кофактора и расстояние между каталитическими сайтами». Европейский журнал биохимии. 126 (3): 507–11. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1982.tb06809.x. PMID  7140743.
  10. ^ а б Товар-Гудиньо Э., Гевара-Салазар Дж. А., Бахена-Эррера Дж. Р., Трухильо-Феррара Дж. Г., Мартинес-Кампос З., Разо-Эрнандес Р. С., Сантьяго А., Пастор Н., Фернандес-Зертуче М. (май 2018 г.). «Pseudomonas fluorescens и In Silico Molecular Modeling». Молекулы. 23 (5): 1128. Дои:10.3390 / молекулы23051128. ЧВК  6099672. PMID  29747438.
  11. ^ а б c d Салазар-Санчес Дж. С., Моралес-Вильягран А., Лопес-Перес С. Дж., Пардо-Пенья К., Вильяльпандо-Варгас Ф, Медина-Сеха Л. (июнь 2018 г.). «Количественное определение γ-аминомасляной кислоты в биологических образцах небольшого объема посредством ферментативно индуцированной электрохемилюминесценции». Люминесценция. 33 (4): 722–730. Дои:10.1002 / bio.3469. PMID  29653023.
  12. ^ а б Nagappa M, Bindu PS, Chiplunkar S, Govindaraj P, Narayanappa G, Krishnan A, Bharath MM, Swaminathan A, Saini J, Arvinda HR, Sinha S, Mathuranath PS, Taly AB (февраль 2017 г.). «Гиперсонно-гиперкинетическое двигательное расстройство у ребенка с сложной гетерозиготной мутацией в гене 4-аминобутиратаминотрансферазы (ABAT)». Мозг и развитие. 39 (2): 161–165. Дои:10.1016 / j.braindev.2016.08.005. PMID  27596361. S2CID  6403837.
  13. ^ а б Рамирес А.К., Лайнс, доктор медицины, Шамси Ф., Сюэ Р., Ценг Й.Х., Кан Ч.Р., Касиф С., Дрейфус Дж. М. (декабрь 2017 г.). «Объединение измерений внеклеточного потока и моделирования в масштабе генома выявляет различия между коричневыми и белыми адипоцитами». Отчеты по ячейкам. 21 (11): 3040–3048. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.11.065. ЧВК  5841536. PMID  29241534.
  14. ^ Брехт Э. Дж., Барс К., Гросс Б., Уолтон Дж. П. (август 2017 г.). «Увеличение ГАМК обращает вспять возрастные изменения в возбуждающих рецептивных полях и кодировании интенсивности слуховых нейронов среднего мозга у старых мышей». Нейробиология старения. 56: 87–99. Дои:10.1016 / j.neurobiolaging.2017.04.003. ЧВК  6347026. PMID  28532644.
  15. ^ Чой С., Сторичи П., Ширмер Т., Сильверман РБ (февраль 2002 г.). «Дизайн конформационно ограниченного аналога противоэпилептического препарата Вигабатрин, который управляет его механизмом инактивации аминотрансферазы гамма-аминомасляной кислоты». Журнал Американского химического общества. 124 (8): 1620–4. Дои:10.1021 / ja011968d. PMID  11853435.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение

  • Медина-Кауве Л.К., Тобин А.Дж., Де Мейрлейр Л., Яекен Дж., Якобс К., Нихан В.Л., Гибсон К.М. (июнь 1999 г.). «Дефицит 4-амино-аминотрансферазы (ГАМК-трансаминазы)». Журнал наследственных метаболических заболеваний. 22 (4): 414–27. Дои:10.1023 / А: 1005500122231. PMID  10407778. S2CID  11874078.
  • Иеремия С., Пови С. (июль 1981 г.). «Биохимическая генетика трансаминазы гамма-аминомасляной кислоты человека». Анналы генетики человека. 45 (3): 231–6. Дои:10.1111 / j.1469-1809.1981.tb00334.x. PMID  7305280. S2CID  84674735.
  • Де Биасе Д., Барра Д., Симмако М., Джон Р.А., Босса Ф. (январь 1995 г.). «Первичная структура и тканевое распределение человеческой 4-аминобутират аминотрансферазы». Европейский журнал биохимии. 227 (1–2): 476–80. Дои:10.1111 / j.1432-1033.1995.tb20412.x. PMID  7851425.
  • Чакрабарти Б., Дадбридж Ф., Кент Л., Уилрайт С., Хилл-Коуторн Г., Эллисон С., Банерджи-Басу С., Барон-Коэн С. (июнь 2009 г.). «Гены, связанные с половыми стероидами, нервным ростом и социально-эмоциональным поведением, связаны с аутистическими чертами, эмпатией и синдромом Аспергера». Исследование аутизма. 2 (3): 157–77. Дои:10.1002 / авр.80. PMID  19598235. S2CID  18239947.
  • Джирхольт Дж., Аслинг Б., Хаммонд П., Дэвидсон Дж., Кнутссон М., Валентинссон А., Йенсен Дж. М., Леманн А., Агреус Л., Лагерстрём-Фермер М. (апрель 2011 г.). «4-аминобутират аминотрансфераза (ABAT): генетические и фармакологические доказательства участия в гастроэзофагеальной рефлюксной болезни». PLOS ONE. 6 (4): e19095. Дои:10.1371 / journal.pone.0019095. ЧВК  3084265. PMID  21552517.
  • Райнесало С., Сарансаари П., Пелтола Дж., Керанен Т. (март 2003 г.). «Поглощение ГАМК и активность ГАМК-трансаминазы в тромбоцитах от больных эпилепсией». Исследования эпилепсии. 53 (3): 233–9. Дои:10.1016 / s0920-1211 (03) 00030-5. PMID  12694932. S2CID  37556128.
  • Jaeken J, Casaer P, de Cock P, Corbeel L, Eeckels R, Eggermont E, Schechter PJ, Brucher JM (август 1984). «Дефицит трансаминазы гамма-аминомасляной кислоты: недавно признанная врожденная ошибка метаболизма нейромедиаторов». Нейропедиатрия. 15 (3): 165–9. Дои:10.1055 / с-2008-1052362. PMID  6148708.
  • Херл WG, Черчич JE (сентябрь 1984 г.). «Взаимодействие между 4-аминобутират аминотрансферазой и янтарной полуальдегиддегидрогеназой, двумя митохондриальными ферментами». Журнал биологической химии. 259 (18): 11459–63. PMID  6470007.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.