Амелогенин - Amelogenin

амелогенин, Х-связанный
Идентификаторы
СимволAMELX
Альт. символыAMG, AIH1
Ген NCBI265
HGNC461
OMIM300391
RefSeqNM_001142
UniProtQ99217
Прочие данные
LocusChr. Икс п22.3-п22.1
амелогенин, Y-связанный
Идентификаторы
СимволАМЕЛИ
Альт. символыAMGL
Ген NCBI266
HGNC462
OMIM410000
RefSeqNM_001143
UniProtQ99218
Прочие данные
LocusChr. Y p11

Амелогенины группа изоформы белка произведено альтернативное сращивание или же протеолиз от AMELX ген, на Х хромосома, а также АМЕЛИ ген у самцов, на Y-хромосома.[1] Они участвуют в амелогенез, развитие эмаль.[2] Амелогенины относятся к типу внеклеточный матрикс белок, который вместе с амелобластины, эмалины и туфтелины, направляют минерализацию эмали с образованием высокоорганизованной матрицы стержни, промежуточный кристалл и белки.

Хотя точная роль амелогенина (ов) в регуляции минерализация процесс неизвестен, известно, что амелогенины в большом количестве во время амелогенеза. В развивающейся эмали человека содержится около 70% белка, 90% которого составляют амелогенины.

Функция

Считается, что амелогенины участвуют в организации эмалевые стержни в течение развитие зубов. Последние исследования показывают, что эти белки регулируют инициирование и рост гидроксиапатит кристаллы при минерализации эмали. Кроме того, амелогенины помогают в развитии цемент направляя цементобласты к поверхности корня зуба.

Варианты

Амелогенин ген наиболее широко изучен на людях, где это единственная копия гена, расположенная на Икс и Y-хромосомы при Xp22.1-Xp22.3 и Yp 11.2 [5].[3] Расположение гена амелогенина на половых хромосомах влияет на вариабельность как между формой Х-хромосомы (AMELX ) и форма Y-хромосомы (АМЕЛИ ), а также между аллелями AMELY среди разных популяций. Это потому, что AMELY существует в не рекомбинирующий область хромосомы Y, эффективно изолировав ее от нормального давление отбора. Другие источники вариации амелогенина возникают из различных изоформы AMELX, полученного путем альтернативного сплайсинга транскриптов мРНК. Конкретные роли изоформ еще предстоит установить. Среди других организмов амелогенин хорошо сохраняется среди евтерийцы, и имеет гомологов в монотремы, рептилии и амфибии.

Применение в определении пола

Различия между Х хромосома и Y-хромосома версии гена амелогенина (AMELX и AMELY соответственно) позволяют использовать его для определения пола в неизвестных человеческих образцах. AMELX Интрон 1 содержит делецию из 6 пар оснований относительно интрон 1 из АМЕЛИ. Это можно обнаружить с небольшими затратами, используя полимеразной цепной реакции (ПЦР) интрона 1, за которым следует гель-электрофорез. Два группы ДНК, на 555 bps и 371 bps, разрешаются, если присутствуют обе версии гена AMELX и AMELY (т. е. образец взят от мужчины) или одна полоса ДНК, на 555 bps, если присутствует только версия AMELX (т.е. образец взят от женщины).[4]

Однако из-за АМЕЛИ различия между отдельными людьми и популяциями, этот метод определения пола не является точным на 100%. Мутация в областях интрона 1 AMELY, обычно используемых в качестве участки отжига праймеров может отключить амплификацию ПЦР. 6 бп вставка к интрону 1 AMELY дает ампликон, идентичный по длине AMELX. У некоторых мужчин AMELY может быть полностью удален. В любом из этих случаев во время гель-электрофореза продуктов ПЦР визуализируется только одна полоса, что приводит к ошибочной идентификации образца как женского.[4] Уровень ошибочной идентификации может варьироваться среди населения, но в целом кажется низким. В одном исследовании, проведенном в Испании, тест на определение пола амелогенином с использованием диапазонов AMELX (977 бит / с) и AMELY (790 бит / с) был проведен для 1224 человек известного пола с точностью 99,84% (1222/1224).[5] Другое исследование, проведенное в Индии, обнаружило, что 5 из 270 изученных мужчин (1,85%) обладали делецией AMELY, назвав их «самцы с удаленным амелогенином» (DAM). В ответ авторы предположили, что, хотя половой тест амелогенина может быть точным в целом, другие маркеры Y-хромосомы, такие как SRY, STR или 50f2 могут использоваться для менее неоднозначной гендерной идентификации.[6]

Клиническое значение

Мутации в AMELX могут вызывать несовершенный амелогенез, нарушение развития зубной эмали.[7]

Рекомендации

  1. ^ Бансал, Аджай Кумар; Шетти, Деви Чаран; Биндал, Ручьи; Патхак, Апарна (2012). «Амелогенин: новый белок с разнообразным применением в генетическом и молекулярном профилировании». Журнал оральной и челюстно-лицевой патологии. 16 (3): 395–399. Дои:10.4103 / 0973-029X.102495. ISSN  0973-029X. ЧВК  3519216. PMID  23248473.
  2. ^ Амелогенин в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)
  3. ^ Накахори Й., Такенака О, Накагоме Й. (1991). «Гомологичная область X-Y человека кодирует» амелогенин"". Геномика. 9 (2): 264–9. Дои:10.1016/0888-7543(91)90251-9. PMID  2004775.
  4. ^ а б Кашьяп В.К., Саху С., Ситалаксими Т., Триведи Р. (2006). «Делеции во фрагменте гена амелогенина, производного Y, в индийской популяции». BMC Med Genet. 7: 37. Дои:10.1186/1471-2350-7-37. ЧВК  1458324. PMID  16603093.
  5. ^ Франсес Ф., Портолес О, Гонсалес Дж. И., Колтелл О, Верду Ф., Кастельо А, Корелла Д. (2007). «Амелогениновый тест: от криминалистики до контроля качества в клинической и биохимической геномике». Clin Chim Acta. 386 (1–2): 53–6. Дои:10.1016 / j.cca.2007.07.020. PMID  17716640.
  6. ^ Тангарадж К., Редди А.Г., Сингх Л. (2002). «Является ли ген амелогенина надежным для определения пола в судебно-медицинской экспертизе и пренатальной диагностике?». Int J Legal Med. 116 (2): 121–3. Дои:10.1007 / s00414-001-0262-y. PMID  12056520.
  7. ^ Райт Дж. Т. (декабрь 2006 г.). «Молекулярные этиологии и связанные фенотипы несовершенного амелогенеза». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 140 (23): 2547–55. Дои:10.1002 / ajmg.a.31358. ЧВК  1847600. PMID  16838342.