DGCR8 - DGCR8

DGCR8
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1X47, 2YT4, 3LE4, 5B16
Идентификаторы
Псевдонимы	DGCR8, C22orf12, DGCRK6, Gy1, pasha, Pasha, субъединица микропроцессорного комплекса DGCR8, субъединица микропроцессорного комплекса
Внешние идентификаторы	OMIM: 609030 MGI: 2151114 ГомолоГен: 11223 Генные карты: DGCR8
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 22 (человек)
Конец	20,111,877 бп
Экспрессия РНК шаблон
	; ; ; ;
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• первичное связывание miRNA; • активность рибонуклеазы III; • связывание двухцепочечной РНК; • GO: 0001948 связывание с белками; • гемовое связывание; • активность гомодимеризации белков; • связывание ионов металлов; • Связывание РНК; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • микропроцессорный комплекс; • ядрышко; • ядро клетки; • нуклеоплазма; • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность;
Биологический процесс	• регулирование пролиферации стволовых клеток; • первичный процессинг miRNA; • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК, эндонуклеолитический; • Гидролиз фосфодиэфирной связи РНК; • miRNA метаболический процесс;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	54487
	94223
	ENSG00000128191
	ENSMUSG00000022718
	Q8WYQ5
	Q9EQM6
	NM_001190326; NM_022720
	NM_033324
	NP_001177255; NP_073557
	NP_201581
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

В DGCR8 подблок микропроцессорного комплекса (Синдром ДиДжорджи хромосомный [или критический] регион 8) это белок что у людей кодируется DGCR8 ген.^[4] У других животных, особенно у обычных модельные организмы Drosophila melanogaster и Caenorhabditis elegans, белок известен как Паша (партнер Дроша ).^[5] Это обязательный компонент РНК-интерференция путь.

Функция

DGCR8 локализован на ядро клетки и требуется для микроРНК (miRNA) процессинг. Он привязан к Дроша, РНКаза III фермент, чтобы сформировать Микропроцессорный комплекс который рассекает первичная стенограмма известная как при-миРНК к характеристике стебель-петля структура, известная как пре-миРНК, которая затем обрабатывается ферментом до фрагментов миРНК. Дайсер. DGCR8 содержит РНК -связывающий домен и, как полагают, связывает pri-miRNA, чтобы стабилизировать ее для процессинга Drosha.^[6]

DGCR8 также необходим для некоторых типов репарации ДНК. Удаление УФ-индуцированной ДНК фототовары, в течение эксцизионная репарация связанных с транскрипцией нуклеотидов (TC-NER), зависит от фосфорилирования JNK DGCR8 на серин 153.^[7] Хотя известно, что DGCR8 действует в биогенезе микроРНК, эта активность не требуется для DGCR8-зависимого удаления УФ-индуцированных фотопродуктов.^[7] Эксцизионная репарация нуклеотидов также необходим для восстановления окислительного повреждения ДНК из-за пероксид водорода (ЧАС₂О₂), а клетки, истощенные по DGCR8, чувствительны к ЧАС₂О₂.^[7]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128191 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ «Ген Энтреса: ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи DGCR8».
^ Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Природа. 432 (7014): 231–5. Дои:10.1038 / природа03049. PMID 15531879.
^ Еом К.Х., Ли Й., Хан Дж., Сух М.Р., Ким В.Н. (2006). "Характеристика DGCR8 / Pasha, важного кофактора Drosha в первичном процессинге miRNA". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (16): 4622–9. Дои:10.1093 / нар / gkl458. ЧВК 1636349. PMID 16963499.
^ ^а ^б ^c Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных ультрафиолетом, независимо от обработки РНК». Сотовый представитель. 19 (1): 162–174. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.03.021. ЧВК 5423785. PMID 28380355.

дальнейшее чтение

Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO отчеты. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК 1083732. PMID 11256614.
Шиохама А., Сасаки Т., Нода С., Миношима С., Симидзу Н. (апрель 2003 г.). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии нового гена DGCR8, расположенного в хромосомной области синдрома ДиДжорджи». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 304 (1): 184–90. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 00554-0. PMID 12705904.
Грегори Р.И., Ян К.П., Амутан Г., Чендримада Т., Доратотадж Б., Куч Н., Шихаттар Р. (ноябрь 2004 г.). «Микропроцессорный комплекс опосредует генезис микроРНК». Природа. 432 (7014): 235–40. Дои:10.1038 / природа03120. PMID 15531877.
Хан Дж, Ли Й, Еом К. Х., Ким Ю. К., Джин Х, Ким В. Н. (декабрь 2004 г.). «Комплекс Дроша-DGCR8 в процессинге первичной микроРНК». Гены и развитие. 18 (24): 3016–27. Дои:10.1101 / gad.1262504. ЧВК 535913. PMID 15574589.
Ландталер М., Ялчин А., Тушл Т. (декабрь 2004 г.). «Ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи человека и его гомолог D. melanogaster необходимы для биогенеза miRNA». Текущая биология. 14 (23): 2162–7. Дои:10.1016 / j.cub.2004.11.001. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-EB83-3. PMID 15589161.
Хан Дж, Ли Й, Йом К. Х., Нам Дж. У., Хео И, Ри Дж. К., Сон С.И., Чо Й, Чжан Б.Т., Ким В.Н. (июнь 2006 г.). «Молекулярная основа распознавания первичных микроРНК комплексом Drosha-DGCR8». Ячейка. 125 (5): 887–901. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.043. PMID 16751099.
Фаллер М., Мацунага М., Инь С., Лу Дж.А., Гуо Ф (январь 2007 г.). «Гем участвует в процессинге микроРНК». Структурная и молекулярная биология природы. 14 (1): 23–9. Дои:10.1038 / nsmb1182. PMID 17159994.
Sohn SY, Bae WJ, Kim JJ, Yeom KH, Kim VN, Cho Y (сентябрь 2007 г.). «Кристаллическая структура ядра DGCR8 человека». Структурная и молекулярная биология природы. 14 (9): 847–53. Дои:10.1038 / nsmb1294. PMID 17704815.

Эта статья о ген на хромосома человека 22 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000128191 - Ансамбль, Май 2017

[2] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[3] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-4] «Ген Энтреса: ген 8 критической области синдрома ДиДжорджи DGCR8».

[5] Denli AM, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК микропроцессорным комплексом». Природа. 432 (7014): 231–5. Дои:10.1038 / природа03049. PMID 15531879.

[6] Еом К.Х., Ли Й., Хан Дж., Сух М.Р., Ким В.Н. (2006). "Характеристика DGCR8 / Pasha, важного кофактора Drosha в первичном процессинге miRNA". Исследования нуклеиновых кислот. 34 (16): 4622–9. Дои:10.1093 / нар / gkl458. ЧВК 1636349. PMID 16963499.

[Calses-7] а ^б ^c Calses PC, Dhillon KK, Tucker N, Chi Y, Huang JW, Kawasumi M, Nghiem P, Wang Y, Clurman BE, Jacquemont C, Gafken PR, Sugasawa K, Saijo M, Taniguchi T (2017). «DGCR8 опосредует восстановление повреждений ДНК, вызванных ультрафиолетом, независимо от обработки РНК». Сотовый представитель. 19 (1): 162–174. Дои:10.1016 / j.celrep.2017.03.021. ЧВК 5423785. PMID 28380355.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]