Endozoicomonas gorgoniicola - Endozoicomonas gorgoniicola

Endozoicomonas gorgoniicola
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Гаммапротеобактерии
Заказ:
Океаноспириллы
Семья:
Hahellaceae
Род:
Эндозоикомонады
Разновидность:
E. gorgoniicola
Биномиальное имя
Endozoicomonas gorgoniicola
Пайк, Халтли и Керр, 2013 г.[1]
Тип штамма
PS125

Endozoicomonas gorgoniicola это Грамотрицательный и факультативный анаэробный бактерия из рода Эндозоикомонады. Отдельные клетки подвижны и стержневидный.[2][3] Бактерии этого рода симбионты кораллов.[2] E. gorgoniicola живем конкретно с мягкими кораллами (семья Gorgoniidae ) и первоначально были изолированы от вида Плексаура, октокоральный,[1] от побережья Бимини на Багамах. Присутствие этой бактерии в микробиоме кораллов связано со здоровьем кораллов.[4][5]

Морфология

Черное море удочка Plexaura homomalla (4675579531)

E. gorgoniicola это грамотрицательный клетка, характеризующаяся внешней и внутренней мембранами, которые покрывают тонкий слой пептидогликана.[6] Клетки обычно имеют форму палочек и имеют размер 1,7-2,5 мкм.мкм длинные (в среднем 2,0 мкм) и диаметром 0,4-0,9 мкм (в среднем 0,7 мкм).[1][2] E. gorgoniicola владеть жгутики что позволяет подвижность. Когда бактерия покрытый на морском агар колонии образуют кремово-белые круги диаметром 0,5-1 мм.[1]

Среда обитания

Как и большинство микроорганизмов, E. gorgoniicola населяет микроместа обитания по мелкомасштабным абиотическим градиентам внутри более крупного организма. Этот вид встречается у видов из рода Плексаура, мягкий коралл в форме стержня. Много Эндозоикомонады виды встречаются у нескольких кораллов-хозяев, но E. gorgoniicola был изолирован только в Плексаура. Связанные с кораллами бактерии обитают в экзоскелете, в тканях и в слизи, покрывающей поверхность коралловых полипов.[7][8][4] Слой слизи - уникальная и важная особенность коралла; он защищает полип от нежелательных патогенов и питательных веществ. Большинство антипатогенных свойств слизи обусловлено бактериями, в том числе Эндозоикомонады разновидность.[1] Внутренние микрогрохоты кораллов также населяют эндосимбиотический микроводоросль динофлагелляты в семье Симбиодиновые. Бактерии и эти клетки микроводорослей обитают в гастродерма и формируют симбиотические отношения за счет повторного использования питательных веществ.[4][7]

Метаболизм

Общий

В океане, E. gorgoniicola может расти в диапазоне температур от 15 до 30 ° C. Клетки будут расти, хотя и медленно, при концентрациях соли выше 4% и ниже 1%. Как эндосимбиотический организм, E. gorgoniicola использует питательные вещества, которые связанные с ними динофлагелляты микроводорослей производят из фотосинтез. E. gorgoniicola могут использовать фотосинтат в качестве источника энергии, но, что более важно, бактерии расщепляют вторичные соединения, которые кораллы и микроводоросли производят как отходы, такие как диметилсульфониопропионат (DMSP).[1] Без этого симбиоза токсичные отходы будут накапливаться внутри полипа.

Рост культуры

Оптимальный рост E. gorgoniicola происходит при 22-30 ° C и pH 8,0. Содержание соли должно быть 2-3% NaCl,[1] что чуть ниже солености океана - морская вода обычно составляет 3,5% NaCl или 35 частей на тысячу.[9] Рост происходит на морском агаре 2216. В культуре, E. gorgoniicola использует сахара, такие как лактоза, мальтоза, D-манноза, и глицерин как источник углерода анаэробное дыхание. Это факультативный аэробный организм и может переключиться на брожение при отсутствии кислорода.[1] Эти бактерии не способны восстанавливать нитраты, что является критически важной функцией для здоровья кораллов; тем не мение, E. gorgoniicola способствовать симбиозу за счет сульфатредукции.

Генетика

Участки 16S рРНК ДНК из чистого E. gorgoniicola колонии были секвенированы и оказались новыми штаммами Эндозоикомонады. ДНК может быть извлечена из этого вида с использованием праймеров для гена 16S рРНК эубактерий 27F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3 ') и 1525R (5'AAGGAGGTGATCCAGCC-3'). Он тесно связан с ранее названным E. elysicola, а также E. montiporae и E. numazuensis. Все они изолированы от горгониевых (мягких) кораллов.[1] По состоянию на 2018 год 1556 пар оснований рРНК были секвенированы из E. gorgoniicola геном.[10] Родственные виды E. montiporae имеет геном около 5,4 миллиона пар оснований,[11] и функционирует аналогично E. gorgoniicola, предполагая, что у них может быть геном аналогичного размера.

Рекомендации

  1. ^ а б c d е ж грамм час я Пайк, Ребекка Э .; Халти, Брэд; Керр, Рассел Г. (2013). «Описание Endozoicomonas euniceicola sp. Nov. И Endozoicomonas gorgoniicola sp. Nov., Бактерий, выделенных из октокоралов Eunicea fusca и Plexaura sp., И исправленное описание рода Endozoicomonas». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 63 (Pt 11): 4294–302. Дои:10.1099 / ijs.0.051490-0. PMID  23832969.
  2. ^ а б c "JGI GOLD | Метаданные организма". gold.jgi.doe.gov.
  3. ^ Подставка, Адам. "Endozoicomonas gorgoniicola PS125 | Типовой штамм | NCCB100438, CECT8353 | BacDiveID: 134024". bacdive.dsmz.de.
  4. ^ а б c Борн, Дэвид Дж .; Морроу, Кэтлин М .; Вебстер, Николь С. (2016). «Взгляд на микробиом кораллов: обеспечение здоровья и устойчивости экосистем рифов». Ежегодный обзор микробиологии. 70 (1): 317–340. Дои:10.1146 / annurev-micro-102215-095440. PMID  27482741.
  5. ^ Вецзулли, Луиджи; Пеццати, Элизабетта; Уэте-Штауфер, Карла; Пруццо, Карла; Серрано, Карло (26 июня 2013 г.). «Пиросеквенирование 16SrDNA средиземноморской горгонии Paramuricea clavata выявляет связь между изменениями у представителей бактериальных холобионтов, антропогенным влиянием и вспышками заболеваний». PLoS ONE. 8 (6): e67745. Bibcode:2013PLoSO ... 867745V. Дои:10.1371 / journal.pone.0067745. ISSN  1932-6203. ЧВК  3694090. PMID  23840768.
  6. ^ Браун, Лиза; Wolf, Julie M .; Прадос-Росалес, Рафаэль; Касадеваль, Артуро (1 сентября 2015 г.). «Через стенку: внеклеточные везикулы в грамположительных бактериях, микобактериях и грибах». Обзоры природы Микробиология. 13 (10): 620–630. Дои:10.1038 / nrmicro3480. ЧВК  4860279. PMID  26324094.
  7. ^ а б Розенберг, Юджин; Корен, Омри; Решеф, Лия; Эфроний, Ротем; Зильбер-Розенберг, Илана (май 2007 г.). «Роль микроорганизмов в здоровье, болезнях и эволюции кораллов». Отзывы о природе. 5 (5): 355–362. Дои:10.1038 / nrmicro1635. PMID  17384666.
  8. ^ Эйнсворт, Трейси Д .; Тербер, Ребекка Вега (2010). «Будущее коралловых рифов: микробная перспектива». Тенденции в экологии и эволюции. 25 (4): 233–240. Дои:10.1016 / j.tree.2009.11.001. PMID  20006405.
  9. ^ SMOS. «Чувство солености». Европейское космическое агентство.
  10. ^ "Endozoicomonas gorgoniicola - NCBI". www.ncbi.nlm.nih.gov.
  11. ^ Дин, Цзюнь-Янь; Шиу, Цзя-Хо; Чен, Вэнь-Мин; Чан, Инь-Ру; Тан, Сен-Лин (8 марта 2016 г.). «Геномное понимание взаимоотношений хозяина и эндосимбионта Endozoicomonas montiporae CL-33T с его коралловым хозяином». Границы микробиологии. 7: 251. Дои:10.3389 / fmicb.2016.00251. ЧВК  4781883. PMID  27014194.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка