Динофлагеллята - Dinoflagellate

Динофлагеллята
Временной диапазон: 240–0 Ма[1] Триасовый или раньше – Настоящее время
Ceratium hirundinella.jpg
Ceratium sp.
Научная классификация е
Clade:SAR
Infrakingdom:Альвеолаты
Тип:Myzozoa
Подтип:Динозоа
Суперкласс:Динофлагеллата
Bütschli 1885 [1880-1889] Sensu Гомес 2012[2][3][4]
Классы
Синонимы
  • Цилиофлагеллята Клапаред и Лахманн, 1868 г.
  • Динофита Диллон, 1963 год.
  • Dinophyceae Sensu Пашер, 1914 год
  • Pyrrophyta Pascher 1914
  • Pyrrhophycophyta Papenfuss 1946 г.
  • Arthrodelen Flagellaten Stein 1883 г.
  • Диномастигота Маргулис и Саган, 1985 г.
  • Dinophyta Dillon, 1963 год.

В динофлагелляты (Греческий δῖνος динозавры "кружение" и латинский жгутик "плеть, бич") одноклеточные эукариоты составляющий тип Динофлагеллата.[5] Обычно считается водоросли, динофлагелляты в основном морской планктон, но они также распространены в пресноводные среды обитания. Их популяции распределены в зависимости от температура поверхности моря, соленость, или глубина. Известно, что многие динофлагелляты фотосинтетический, но большая часть из них на самом деле миксотрофный, совмещая фотосинтез с поеданием добычи (фаготрофия и мизоцитоз ).[6][7]

По количеству видов динофлагелляты - одна из крупнейших групп морских эукариот, хотя эта группа существенно меньше, чем диатомеи.[8] Некоторые виды эндосимбионты морских животных и играют важную роль в биологии коралловые рифы. Другие динофлагелляты являются непигментированными хищниками других простейших, и некоторые формы являются паразитический (Например, Оодиниум и Пфиестерия ). Некоторые динофлагелляты вызывают стадии покоя, называемые цистами динофлагеллат или диноцисты, как часть их жизненного цикла, и известна по 84 из 350 описанных пресноводных видов и чуть более чем 10% известных морских видов.[9][10] Динофлагелляты - это альвеолиты имея два жгутики, наследственное состояние биконты.

В настоящее время описано около 1555 видов свободноживущих морских динофлагеллят.[11] По другой оценке, около 2 000 видов живых существ, из которых более 1 700 являются морскими (свободноживущими, а также бентическими) и около 220 обитают в пресной воде.[12] По последним оценкам, в общей сложности насчитывается 2 294 ныне живущих вида динофлагеллят, включая морских, пресноводных и паразитических динофлагеллят.[2]

Быстрое накопление определенных динофлагеллат может привести к видимому окрашиванию воды, в просторечии известному как Красная волна (вредный цветение водорослей ), что может вызвать отравление моллюсками если люди едят зараженных моллюсков. Некоторые динофлагелляты также проявляют биолюминесценция - излучает преимущественно сине-зеленый свет. Таким образом, некоторые части Индийского океана ночью подсвечиваются сине-зеленым светом.

История

В 1753 г. первые современные динофлагелляты были описаны А. Генри Бейкер как «Анималкулы, вызывающие искрящийся свет в морской воде»,[13] и назван Отто Фридрих Мюллер в 1773 г.[14] Термин происходит от греческого слова δῖνος (динозавры), что означает кружение, а на латыни жгутик, уменьшительное название кнута или плети.

В 1830-х годах немецкий микроскопист Кристиан Готфрид Эренберг исследовали множество образцов воды и планктона и предложили несколько родов динофлагеллят, которые все еще используются сегодня, включая Перидиний, Пророцентрум, и Динофиз.[15]

Эти же динофлагелляты впервые были определены Отто Бютчли в 1885 году как жгутик заказать Динофлагеллиды.[16] Ботаники относились к ним как к отделу водорослей, названному Pyrrophyta или Pyrrhophyta («огненные водоросли»; греч. пирр (h) os, огонь) после биолюминесцентных форм, или Динофита. В разное время криптомонады, эбрииды, и эллобиопсиды были включены сюда, но только последние теперь считаются близкими родственниками. Динофлагелляты обладают известной способностью трансформироваться от некистообразующих к цистообразующим стратегиям, что чрезвычайно затрудняет воссоздание их эволюционной истории.

Морфология

Жгутик продольный (l.f.) и поперечный (t.f.); мешок pusule (s.p.); ядро (п).
Анатомия динофлагеллат

Динофлагелляты одноклеточные и обладают двумя непохожими жгутиками, отходящими от вентральной стороны клетки (жгутик диноконта). У них есть ленточный поперечный жгутик с множественными волнами, бьющимися слева от клетки, и более традиционный, продольный жгутик, бьющийся назад.[17][18][19] Поперечный жгутик представляет собой волнистую ленту, у которой только внешний край волнистый от основания до кончика из-за действия аксонемы, которая проходит вдоль него. Край аксонемы покрыт простыми волосками разной длины. Движение жгутиков производит поступательное движение, а также вращающую силу. Продольный жгутик имеет относительно обычный вид, с небольшим количеством волосков или без них. Он бьет с одним или двумя периодами до своей волны. Жгутики лежат в поверхностных бороздках: поперечной в поясной части и продольной в борозде, хотя его дистальная часть свободно выступает за клеткой. У видов динофлагеллят с жгутиками десмоконта (например, Prorocentrum) два жгутика дифференцированы, как у диноконтов, но не связаны с бороздками.

Динофлагелляты имеют сложное клеточное покрытие, называемое амфиэма или кора, состоящая из серии оболочек, уплощенных пузырьки называемые альвеолами (= амфьесмальные пузырьки) и родственными структурами.[20][21] В бронированных динофлагеллатах эти опоры перекрывают друг друга. целлюлоза пластины для создания своего рода брони, называемой тека или лорика, в отличие от атекатных динофлагеллят. Они бывают различной формы и расположения, в зависимости от вида, а иногда и от стадии динофлагелляты. Обычно термин «табуляция» используется для обозначения такого расположения текальные пластины. Конфигурация пластины может быть обозначена формулой пластины или формулой таблицы. Волокнистый экструзомы также встречаются во многих формах. Вместе с различными другими структурными и генетическими деталями эта организация указывает на тесную связь между динофлагеллятами, Apicomplexa, и инфузории, вместе именуемые альвеолиты.[22]

Таблицы по динофлагеллятам можно разделить на шесть «типов таблиц»: гимнодиноид, Suessoid, гоньяулакоид –перидиниоид, нанноцератопсиоид, динофизиоид, и пророцентроид.[нужна цитата ]

В хлоропласты у большинства фотосинтетических динофлагеллят связаны тремя мембраны, предполагая, что они, вероятно, были получен из некоторых проглоченных водорослей. Большинство фотосинтезирующих видов содержат хлорофиллы а и c2, каротиноид бета-каротин и группа ксантофиллов, которая, по-видимому, уникальна для динофлагеллят, обычно перидинин, диноксантин и диадиноксантин. Эти пигменты придают многим динофлагеллятам характерный золотисто-коричневый цвет. Однако динофлагелляты Карения Бревис, Карения микимотои, и Карлодиниум микрум приобрели другие пигменты в результате эндосимбиоза, в том числе фукоксантин.[23] Это говорит о том, что их хлоропласты были включены в несколько эндосимбиотических событий с участием уже окрашенных или вторично бесцветных форм. Открытие пластид в Apicomplexa привело некоторых к предположению, что они унаследованы от предка, общего для этих двух групп, но ни одна из более базальных линий не имеет их. Тем не менее, клетка динофлагеллат состоит из более общих органелл, таких как грубая и гладкая эндоплазматическая сеть, аппарат Гольджи, митохондрии, липидные и крахмальные зерна и пищевые вакуоли. У некоторых даже были обнаружены светочувствительные органеллы, глазное пятно или стигма или более крупное ядро, содержащее заметное ядрышко. Динофлагеллята Эритропсидий имеет самый маленький из известных глаз.[24]

Некоторые виды атекат имеют внутренний скелет, состоящий из двух звездчатых кремнистых элементов, функция которых неизвестна, и их можно найти как микрофоссилий. Таппан[25] дал обзор динофлагеллят с внутренним скелетом. Это включало первое подробное описание пентастеры в Актиниск пентастериас, основанный на растровой электронной микроскопии. Они помещаются в отряд Gymnodiniales, подотряд Actiniscineae.[5]

Строение и формирование тека

Формирование текальных пластинок подробно изучено с помощью ультраструктурных исследований.[21]

Ядро динофлагеллят: динокарион

Основная статья: Динокарион

'Core dinoflagellates' (динокариоты ) имеют своеобразную форму ядро, называется динокарион, в которой хромосомы прикреплены к ядерной мембране. Они несут уменьшенное количество гистоны. Вместо гистонов ядра динофлагеллят содержат новое доминирующее семейство ядерных белков, которые, по-видимому, имеют вирусное происхождение, поэтому называются динофлагеллятами / вирусными нуклеопротеидами (DVNP), которые являются высокоосновными, связывают ДНК со сходным сродством к гистонам и встречаются в множественные посттрансляционно модифицированные формы.[26] Ядра динофлагеллат остаются конденсированными на протяжении всей интерфазы, а не только во время митоз, который является закрытым и включает однозначно внеядерный митотическое веретено.[27] Ядро такого типа когда-то считалось промежуточным звеном между нуклеоидной областью прокариоты и истинные ядра эукариоты, поэтому были названы мезокариотическими, но теперь считаются производными, а не примитивными признаками (то есть предки динофлагеллят имели типичные эукариотические ядра). Помимо динокариот, ДВНП можно найти в группе базальных динофлагеллят (известных как морские Альвеоляты, «MALV»), которая является сестрой динокариот (Syndiniales ).[28]

Классификация

Дальнейшая информация: Викивиды: Dinoflagellata
1. Орнитоцерк; 2. диаграмма; 3. Exuviaeella; 4. Prorocentrum; 5, 6. Ceratium; 7. Пушетия; 8. Citharistes; 9. Поликрикос

Динофлагелляты - это простейшие, которые были классифицированы с использованием как Международный кодекс ботанической номенклатуры (ICBN, теперь переименованный в ICN) и Международный кодекс зоологической номенклатуры (МКЗН). Около половины современных видов динофлагеллят - автотрофы, обладающие хлоропластами, а половина - нефотосинтезирующие гетеротрофы.

Динофлагелляты перидинина, названные в честь их пластид перидинина, по-видимому, являются предками линии происхождения динофлагеллат. Почти половина всех известных видов имеет хлоропласты, которые являются либо исходными пластидами перидинина, либо новыми пластидами, полученными от других линий одноклеточных водорослей посредством эндосимбиоза. Остальные виды утратили фотосинтетические способности и адаптировались к гетеротрофным, паразитарным или клептопластический Стиль жизни.[29][30]

Большинство (но не все) динофлагеллят имеют динокарион, описанный ниже (см .: Жизненный цикл ниже). Динофлагелляты с динокарионом классифицируются как Dinokaryota, а динофлагелляты без динокариона классифицируются как Syndiniales.

Хотя классифицируется как эукариоты, ядра динофлагеллят не являются характерными для эукариот, поскольку некоторые из них не имеют гистоны и нуклеосомы, и поддерживать постоянно конденсированные хромосомы во время митоз. Ядро динофлагеллят было названо Доджем (1966) «мезокариотическим»,[31] из-за обладания промежуточными характеристиками между участками спиральной ДНК прокариотических бактерий и четко определенным ядром эукариот. Однако эта группа содержит типично эукариотические органеллы, например тельца Гольджи, митохондрии и хлоропласты.[32]

Якоб Шиллер (1931–1937) дал описание всех видов, как морских, так и пресноводных, известных в то время.[33] Позже Ален Сурния (1973, 1978, 1982, 1990, 1993) перечислил новые таксономические статьи, опубликованные после Шиллера (1931–1937).[34][35][36][37][38] Сурния (1986) дал описания и иллюстрации морских родов динофлагеллят, исключая информацию на уровне видов.[39] Последний указатель написан Гомесом.[2]

Идентификация

Таксономические монографии на английском языке, охватывающие большое количество видов, издаются для Мексиканского залива,[40] Индийский океан[41] британские острова,[42] средиземноморский[43] и Северное море.[44]

Основным источником для идентификации пресноводных динофлагеллят являются Зюссвассер Флора.[45]

Калькофтор-белый может использоваться для окрашивания текальных пластинок в армированных динофлагеллятах.[46]

Экология и физиология

Среды обитания

Динофлагелляты могут встречаться во всех водных средах: морской, солоноватой и пресной, в том числе в снегу или льду. Они также обычны в придонной среде и морском льду.

Эндосимбионты

Все Зооксантеллы являются динофлагеллятами и большинство из них входят в состав Symbiodiniaceae (например, род Симбиодиниум ).[47] Связь между Симбиодиниум и строительство рифов кораллы широко известен. Однако эндосимбионтный Зооксантеллы населяют множество других беспозвоночных и простейших, например многие морские анемоны, медуза, голожаберники, гигантский моллюск Тридакна, и несколько видов радиолярии и фораминиферы.[48] Многие современные динофлагелляты паразиты (здесь определены как организмы, которые поедают свою добычу изнутри, т.е. эндопаразиты, или которые остаются привязанными к своей добыче в течение более длительных периодов времени, то есть эктопаразиты). Они могут паразитировать на животных или простейших хозяевах. Протоодиниум, Крепидодиниум, Писциноудиниум, и Бластодиниум сохраняют свои пластиды, питаясь зоопланктоном или рыбами-хозяевами. У большинства паразитических динофлагеллят инфекционная стадия напоминает типичную подвижную клетку динофлагеллят.

Стратегии питания

У динофлагеллят наблюдаются три стратегии питания: фототрофия, миксотрофия, и гетеротрофия. Фототрофы могут быть фотоавтотрофы или ауксотрофы. Миксотрофные динофлагелляты фотосинтетически активны, но также гетеротрофны. Факультативные миксотрофы, у которых для питания достаточно автотрофии или гетеротрофии, классифицируются как амфитрофные. Если требуются обе формы, организмы миксотрофны. Sensu stricto. Некоторые свободноживущие динофлагелляты не имеют хлоропластов, но содержат фототрофный эндосимбионт. Некоторые динофлагелляты могут использовать чужеродные хлоропласты (клептохлоропласты), полученные с пищей (клептопластика ). Некоторые динофлагелляты могут питаться другими организмами в качестве хищников или паразитов.[49]

Пищевые включения содержат бактерии, сине-зеленые водоросли, мелкие динофлагелляты, диатомовые водоросли, инфузории и другие динофлагелляты.[50][51][52][53][54][55][56]

Механизмы захвата и проглатывания динофлагеллят довольно разнообразны. Несколько динофлагеллят, обе текатные (например, Ceratium hirundinella,[55] Peridinium globulus[53]) и нетекатные (например, Oxyrrhis марина,[51] Гимнодиниум sp.[57] и Кофоидиниум виды[58]), притягивают добычу к бороздовой области клетки (либо посредством потоков воды, создаваемых жгутиками, либо через псевдоподиальные отростки) и заглатывают добычу через борозду. В нескольких Протоперидиний виды, например P. conicum, большая кормовая вуаль - псевдопод, называемый паллием - выдавливается для захвата добычи, которая впоследствии переваривается внеклеточно (= кормление паллием).[59][60] Облеа, Зыгабикодиниум, и Диплопсалис - единственные известные роды динофлагеллят, использующие именно этот механизм питания.[60][61][62]Katodinium (Gymnodinium) грибовидный, обычно обнаруживаемый в качестве загрязнителя в культурах водорослей или инфузорий, питается, прикрепляясь к своей добыче и заглатывая цитоплазму жертвы через расширяющийся стебель.[63] Два родственных вида, polykrikos kofoidii и neatodinium, выстреливают гарпуноподобную органеллу для захвата добычи.[64] Механизмы питания океанических динофлагеллят остаются неизвестными, хотя псевдоподиальные расширения наблюдались в Подолампы бипы.[65]

Цветет

Цветение динофлагеллат обычно непредсказуемо, непродолжительно, с низким видовым разнообразием и небольшой сменой видов.[66] Низкое видовое разнообразие может быть связано с множеством факторов. Один из способов возникновения недостатка разнообразия в цветении - это сокращение хищничества и снижение конкуренции. Первое может быть достигнуто за счет того, что хищники отвергают динофлагеллату, например, уменьшая количество пищи, которую они могут съесть. Это дополнительно помогает предотвратить увеличение давления хищников в будущем из-за того, что хищникам, которые отвергают его, не хватает энергии для размножения. Затем вид может сдерживать рост своих конкурентов, достигая таким образом доминирования.[67]

Вредное цветение водорослей

Динофлагелляты иногда цветут в концентрации более миллиона клеток на миллилитр. При таких обстоятельствах они могут производить токсины (обычно называемые динотоксины ) в количествах, способных убивать рыбу и накапливаться в фильтраторах, таких как моллюски, которые, в свою очередь, могут передаваться людям, которые их едят. Это явление называется Красная волна, по цвету, который цвет придает воде. Некоторые бесцветные динофлагелляты также могут образовывать токсичные налеты, например Пфиестерия. Некоторые соцветия динофлагеллят не опасны. Голубоватые мерцания, видимые в океанской воде ночью, часто возникают из-за цветения биолюминесцентный динофлагелляты, которые при потревожении излучают короткие вспышки света.

Цветение водорослей (Акасио) от Noctiluca виды в Нагасаки

Тот же самый красный прилив, упомянутый выше, более конкретно возникает, когда динофлагелляты способны быстро и обильно размножаться из-за обилия питательных веществ в воде. Хотя образующиеся красные волны представляют собой необычное зрелище, они содержат токсины это влияет не только на всю морскую жизнь в океане, но и на людей, которые их потребляют.[68] Конкретный перевозчик моллюски. Это может вызвать как нефатальные, так и смертельные заболевания. Один из таких ядов - это сакситоксин, мощный паралитический нейротоксин. Человеческий вклад фосфат дальнейшее поощрение этих красных приливов, поэтому существует большой интерес к изучению динофлагеллятов как с медицинской, так и с экономической точки зрения. Известно, что динофлагелляты особенно способны поглощать растворенный органический фосфор для P-питательного вещества; было обнаружено, что несколько видов HAS очень универсальны и механически разнообразны в использовании различных типов DOP.[69] [70] [71] Экология вредоносного цветения водорослей широко изучается.[72]

Биолюминесценция

Изображение биолюминесценции с длинной выдержкой N. scintillans в яхтенном порту Зебрюгге, Бельгия
Каякинг в Биолюминесцентный залив, Вьекес, Пуэрто-Рико

Ночью вода может иметь вид сверкающего света из-за биолюминесценции динофлагеллят.[73][74] Более 18 родов динофлагеллят являются биолюминесцентными,[75] и большинство из них излучают сине-зеленый свет.[76] Эти виды содержат сцинтиллоны отдельные цитоплазматические тельца (около 0,5 мкм в диаметре), распределенные в основном в корковой области клетки, выходящих из основной клеточной вакуоли. Они содержат динофлагеллят люцифераза, главный фермент, участвующий в биолюминесценции динофлагеллат, и люциферин, тетрапиррольное кольцо, производное хлорофилла, которое действует как субстрат для реакции образования света. Свечение происходит в виде короткой (0,1 с) синей вспышки (макс. 476 нм) при стимуляции, обычно в результате механического воздействия. Поэтому при механической стимуляции - например, лодкой, плаванием или волнами - можно увидеть синий искрящийся свет, исходящий от поверхности моря.[77]

Биолюминесценция динофлагеллат контролируется циркадными часами и происходит только ночью.[78] Люминесцентные и нелюминесцентные штаммы могут встречаться у одного и того же вида. Количество сцинтиллонов больше ночью, чем днем, и разрушаются в конце ночи, во время максимальной биолюминесценции.[79]

Люциферин-люциферазная реакция, отвечающая за биолюминесценцию, чувствительна к pH.[77] Когда pH падает, люцифераза меняет свою форму, позволяя связывать люциферин, а точнее тетрапиррол.[77] Динофлагелляты могут использовать биолюминесценцию в качестве защитного механизма. Они могут напугать своих хищников мигающим светом или отпугнуть потенциальных хищников с помощью косвенного эффекта, такого как «охранная сигнализация». Биолюминесценция привлекает внимание к динофлагелляте и ее атакующему, делая хищника более уязвимым для хищников с более высоких трофических уровней.[77]

Бухты биолюминесцентной экосистемы динофлагеллат относятся к числу самых редких и уязвимых.[80] Самыми известными из них являются Биолюминесцентный залив в Ла Паргера, Лахас, Пуэрто-Рико; Москито Бэй в Вьекес, Пуэрто-Рико; и Лас-Кабесас-де-Сан-Хуан-Резерва Натурал Фахардо, Пуэрто-Рико. Кроме того, биолюминесцентная лагуна находится недалеко от залива Монтего, Ямайка, а биолюминесцентные гавани окружают Кастин, штат Мэн.[81] В Соединенных Штатах Центральная Флорида является домом для Индийская речная лагуна который богат динофлагеллятами летом и биолюминесцентным гребневиком зимой.[82]

Производство липидов и стеролов

Динофлагеллаты производят характерные липиды и стерины.[83] Один из этих стеринов типичен для динофлагеллят и называется диностерол.

Транспорт

Динофлагеллята CA может быстро опуститься на морское дно в морской снег.[84]

Жизненный цикл

Жизненный цикл динофлагеллат: 1-митоз, 2-половое размножение, 3-планозигота, 4-гипнозигота, 5-планомейоцит.

Динофлагелляты обладают гаплонтический жизненный цикл, за возможным исключением Noctiluca и его родственники.[5] Жизненный цикл обычно включает бесполое размножение посредством митоза, либо через десмошизис или элеутерошизис. Происходят более сложные жизненные циклы, особенно у паразитических динофлагеллят. Половое размножение тоже происходит,[85] хотя этот способ размножения известен только у небольшого процента динофлагеллят.[86] Это происходит путем слияния двух людей с образованием зигота, которые могут оставаться подвижными в типичном для динофлагеллят образе и тогда называются планозиготами. Эта зигота может позже сформировать стадию покоя или гипнозигота, который называется киста динофлагеллята или диноциста. После (или до) прорастания кисты вылупившийся птенец подвергается мейоз производить новые гаплоидные клетки. Динофлагелляты, по-видимому, способны выполнять несколько Ремонт ДНК процессы, которые могут иметь дело с различными типами Повреждение ДНК[87]

Геномика

Одна из их самых ярких особенностей - большое количество клеточной ДНК, содержащейся в динофлагеллятах. Большинство эукариотических водорослей содержат в среднем около 0,54 пг ДНК на клетку, тогда как оценки содержания ДНК динофлагеллятов колеблются от 3 до 250 пг на клетку,[27] соответствует примерно 3000–215 000 МБ (для сравнения, гаплоидный геном человека составляет 3180 МБ, а гексаплоидный Тритикум пшеница - 16 000 МБ). Полиплоидия или политения может объяснить это большое содержание клеточной ДНК,[88] но более ранние исследования кинетики реассоциации ДНК и недавний анализ генома не подтверждают эту гипотезу.[89] Скорее, это было приписано, гипотетически, безудержной ретропозиции, обнаруженной в геномах динофлагеллат.[90] [91]

Помимо непропорционально больших геномов, ядра динофлагеллят уникальны по своей морфологии, регуляции и составу. Их ДНК настолько плотно упакована, что до сих пор неизвестно, сколько именно хромосом у них есть.[92]

Динофлагелляты имеют необычную организацию митохондриального генома со своими родственниками, Apicomplexa.[93] Обе группы имеют очень редкие митохондриальные геномы (около 6 килобаз (кб) в Apicomplexa против ~ 16 килобаз для митохондрий человека). Один вид, Amoebophrya ceratii, полностью утратил свой митохондриальный геном, но все еще имеет функциональные митохондрии.[94] Гены в геномах динофлагеллат претерпели ряд реорганизаций, включая массивную амплификацию и рекомбинацию генома, в результате чего несколько копий каждого гена и фрагментов гена были связаны в многочисленные комбинации. Произошла потеря стандартных стоп-кодонов, транс-сплайсинг мРНК для мРНК cox3 и обширное редактирование РНК, перекодирование большинства генов.[95] [96] Причины этого преобразования неизвестны. В небольшой группе динофлагеллят, называемых «динотомами» (Durinskia и Kryptoperidinium), эндосимбионты (диатомовые водоросли) все еще имеют митохондрии, что делает их единственными организмами с двумя эволюционно разными митохондриями.[97]

У большинства видов пластидный геном состоит всего из 14 генов.[98]

ДНК пластиды в перидининсодержащих динофлагеллатах заключена в серию маленьких кружков.[99] Каждый кружок содержит один или два полипептидных гена. Гены этих полипептидов специфичны для хлоропластов, поскольку их гомологи от других фотосинтезирующих эукариот кодируются исключительно в геноме хлоропластов. Внутри каждого круга есть различимая «сердцевина». Гены всегда находятся в одной ориентации по отношению к этой основной области.

С точки зрения Штрих-кодирование ДНК, ITS-последовательности можно использовать для идентификации видов,[100] где генетическое расстояние p≥0,04 может использоваться для определения границ видов,[101] который успешно применялся для разрешения давней таксономической путаницы, например, в случае разделения комплекса Alexandrium tamarense на пять видов.[102] Недавнее исследование[103] выявили значительную часть генов динофлагеллат, кодирующих неизвестные функции, и что эти гены могут быть консервативными и специфичными для клонов.

Эволюционная история

Динофлагелляты в основном представлены ископаемыми остатками. диноцисты, которые имеют длительную геологическую историю с наименьшими проявлениями в серединеТриасовый,[104] в то время как геохимические маркеры предполагают присутствие в раннем кембрии.[105]

Некоторые данные указывают на то, что диностероиды используются во многих Палеозой и Докембрийский горные породы могли быть продуктом предковых динофлагеллят (протодинофлагеллят).[106][107]

Молекулярная филогенетика показывает, что динофлагелляты группируются с инфузории и апикомплекс (= Sporozoa) в хорошо поддерживаемой кладе, альвеолиты. Ближайшими родственниками динокариотических динофлагеллят являются апикомплекс, Perkinsus, Parvilucifera, синдианцы и Oxyrrhis.[108] Молекулярные филогении похожи на филогении, основанные на морфологии.[109]

На самых ранних стадиях эволюции динофлагеллат, по-видимому, доминируют паразитические линии, такие как перкинсиды и синдины (например, Амебофрия и Гематодиниум).[110][111][112][113]

Все динофлагелляты содержат пластиды красных водорослей или остаточные (нефотосинтетические) органеллы происхождения красных водорослей.[114] Паразитическая динофлагеллята Гематодиниум однако пластида полностью отсутствует.[115] Некоторые группы, утратившие фотосинтетические свойства своих первоначальных пластид красных водорослей, получили новые фотосинтетические пластиды (хлоропласты) в результате так называемого серийного эндосимбиоза, как вторичного, так и третичного. Как и их исходные пластиды, новые хлоропласты в этих группах можно проследить до красных водорослей, за исключением тех, которые принадлежат к представителям рода Lepidodinium, которые обладают пластидами, полученными из зеленых водорослей, возможно Trebouxiophyceae или Ulvophyceae.[116][117] Линии с третичным эндосимбиозом - это Dinophysis, с пластидами от криптомонада,[118] Карения, Карлодиниум и Такаяма, которые обладают пластидами гаптофит происхождения, а также Peridiniaceae, Durinskia и Kryptoperidinium, пластиды которых происходят из диатомеи[119][120] Некоторые виды также выполняют клептопластика.[121]

Эволюция динофлагеллат была разделена на пять основных организационных типов: пророцентроид, динофизоид, гоньяулакоид, перидиниоид и гимнодиноид.[122]Переход морских видов в пресную воду был нечастым событием во время диверсификации динофлагеллят и в большинстве случаев не происходил в последнее время, возможно, даже позже. Меловой.[123]

В последнее время «живое ископаемое» Dapsilidinium pastielsii был найден населяющим Индо-тихоокеанский теплый бассейн, который служил рефугиум для термофильных динофлагеллят.[124]

Примеры

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Парфри Л.В., Лар DJ, Knoll AH, Кац Л.А. (август 2011 г.). «Оценка сроков ранней диверсификации эукариот с помощью мультигенных молекулярных часов». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 108 (33): 13624–9. Bibcode:2011ПНАС..10813624П. Дои:10.1073 / pnas.1110633108. ЧВК  3158185. PMID  21810989.
  2. ^ а б c Гомес Ф (2012). «Контрольный список и классификация живых динофлагеллят (Dinoflagellata, Alveolata)» (PDF). CICIMAR Océanides. 27 (1): 65–140. Архивировано из оригинал (PDF) 27 ноября 2013 г.
  3. ^ Руджеро; и другие. (2015), «Классификация всех живых организмов высшего уровня», PLOS ONE, 10 (4): e0119248, Bibcode:2015PLoSO..1019248R, Дои:10.1371 / journal.pone.0119248, ЧВК  4418965, PMID  25923521
  4. ^ Силар, Филипп (2016), "Protistes Eucaryotes: Origine, Evolution et Biologie des Microbes Eucaryotes", HAL Архивы-обзоры: 1–462
  5. ^ а б c Фенсом Р.А., Тейлор Р.Дж., Норрис Дж., Сарджант В.А., Уортон Д.И., Уильямс Г.Л. (1993). Классификация живых и ископаемых динофлагеллят. Специальное издание микропалеонтологии. 7. Ганновер PA: Sheridan Press. OCLC  263894965.
  6. ^ Стокер Д.К. (1999). «Миксотрофия среди динофлагеллят». Журнал эукариотической микробиологии. 46 (4): 397–401. Дои:10.1111 / j.1550-7408.1999.tb04619.x. S2CID  83885629.
  7. ^ Эссер К., Люттге Ю., Бейшлаг В., Мурата Дж. (06.12.2012). Успехи ботаники: генетика, физиология, систематика, экология.. ISBN  9783642188190.
  8. ^ Guiry MD (октябрь 2012 г.). «Сколько существует видов водорослей?». Журнал психологии. 48 (5): 1057–63. Дои:10.1111 / j.1529-8817.2012.01222.x. PMID  27011267. S2CID  30911529.
  9. ^ Мертенс К.Н., Ренгефорс К., Моэструп Ø, Эллегаард М. (2012). «Обзор последних пресноводных цист динофлагеллат: систематика, филогения, экология и палеокология». Phycologia. 51 (6): 612–619. Дои:10.2216/11-89.1. S2CID  86845462.
  10. ^ Браво I, Фигероа Р.И. (январь 2014 г.). «К экологическому пониманию функций кисты динофлагеллат». Микроорганизмы. 2 (1): 11–32. Дои:10.3390 / микроорганизмы2010011. ЧВК  5029505. PMID  27694774.
  11. ^ GÓMEZ F (2005). «Список свободноживущих видов динофлагеллят в Мировом океане». Acta Botanica Croatica. 64 (1): 129–212.
  12. ^ Тейлор FR, Хоппенрат М., Салдарриага Дж. Ф. (февраль 2008 г.). «Разнообразие и распространение динофлагеллят». Биодайверы. Консервировать. 17 (2): 407–418. Дои:10.1007 / s10531-007-9258-3. S2CID  9810504.
  13. ^ Бейкер, М., 1753. Работа для микроскопа. Додсли, Лондон, 403 стр.
  14. ^ Мюллер, О.Ф. 1773. Vermium terrestrium et fluviatilium, seu Animalium Infusoriorum, Helmithicorum et Testaceorum, non marinorum, succincta Historia, vol. 1. Pars prima. п. 34, 135. Faber, Havniae, et Lipsiae 1773.
  15. ^ Эренберг К.Г. (1832) Beiträge zur Kenntnis der Organization der Infusorien und ihrer geographischer Verbreitung, находится в Сибири. - Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin. Aus dem Jahre 1830. Physikalische Abhandlungen 1830: 1-88, Pls 1-8.
  16. ^ Bütschli O. (1885) 3. Unterabtheilung (Ordnung) Dinoflagellata. - В: Klassen und Ordnungen des Thier-Reichs, wissenschaftlich dargestellt in Wort und Bild доктора Х.Г. Бронна. Erster Band Protozoa. - К.Ф. Winter'sche Verlagshandlung, Лейпциг и Гейдельберг. Стр. 906-1029; Pl.
  17. ^ Тейлор FJR (март 1975 г.). «Неспиральные поперечные жгутики динофлагеллят». Phycologia. 14: 45–7. Дои:10.2216 / i0031-8884-14-1-45.1.
  18. ^ Leblond PH, Taylor FJ (апрель 1976 г.). «Пересмотрен движущий механизм поперечного жгутика динофлагеллат». Биосистемы. 8 (1): 33–9. Дои:10.1016/0303-2647(76)90005-8. PMID  986199.
  19. ^ Gaines G, Taylor FJ (май 1985 г.). «Форма и функция поперечного жгутика динофлагеллат». J. Protozool. 32 (2): 290–6. Дои:10.1111 / j.1550-7408.1985.tb03053.x.
  20. ^ Morrill LC, Loeblich AR (1983). Ультраструктура амфиесмы динофлагеллат. Международный обзор цитологии. 82. С. 151–80. Дои:10.1016 / s0074-7696 (08) 60825-6. ISBN  9780123644824. PMID  6684652.
  21. ^ а б Нетцель Х., Дюрр Г. (2012-12-02). Гл. 3: Динофлагеллятная клеточная кора. С. 43–106. ISBN  9780323138130. В Спектор 1984
  22. ^ Кавальер-Смит Т. (1991). «Диверсификация клеток у гетеротрофных жгутиконосцев». В Паттерсон Д., Ларсен Дж. (Ред.). Биология свободноживущих гетеротрофных жгутиконосцев. Публикации Ассоциации Систематики. 45. Кларендон Пресс. С. 113–131. ISBN  978-0198577478.
  23. ^ Хакетт Дж. Д., Андерсон Д. М., Эрднер Д. Л., Бхаттачарья Д. (октябрь 2004 г.). «Динофлагелляты: замечательный эволюционный эксперимент». Американский журнал ботаники. 91 (10): 1523–34. Дои:10.3732 / ajb.91.10.1523. PMID  21652307.
  24. ^ Schwab IR (сентябрь 2004 г.). "Ты то, что ты ешь". Британский журнал офтальмологии. 88 (9): 1113. Дои:10.1136 / bjo.2004.049510. ЧВК  1772300. PMID  15352316.
  25. ^ Таппан Х (1980). Палеобиология протистов растений. Геология. W.H. Фримен. ISBN  978-0716711094.
  26. ^ Горник С.Г., Форд К.Л., Малхерн Т.Д., Бачич А., Макфадден Г.И., Валлер РФ (декабрь 2012 г.). «Нарушение конденсации нуклеосомной ДНК совпадает с появлением нового ядерного белка у динофлагеллятов». Текущая биология. 22 (24): 2303–12. Дои:10.1016 / j.cub.2012.10.036. PMID  23159597.
  27. ^ а б Спектор Д. (2012-12-02). Ядра динофлагеллат. С. 107–147. ISBN  9780323138130. В Спектор 1984
  28. ^ Штрассерт Дж. Ф., Карнковска А., Хехенбергер Е., Дель Кампо Дж., Колиско М., Окамото Н., Бурки Ф., Яноушковец Дж., Пуарье С., Леонард Дж., Халлам С. Дж., Ричардс Т. А., Уорден А. З., Санторо А. Е., Килинг П. Джей (январь 2018 г.). «Геномика единичных клеток некультивируемых морских альвеол показывает парафилию базальных динофлагеллят». Журнал ISME (Представлена ​​рукопись). 12 (1): 304–308. Дои:10.1038 / ismej.2017.167. ЧВК  5739020. PMID  28994824.
  29. ^ Эволюция генома третичной динофлагеллатной пластиды - PLOS
  30. ^ Бодел, Анджей; Мощинский, Кшиштоф (2006). «Перидининовые пластиды развились в результате третичного эндосимбиоза? Гипотеза». Европейский журнал психологии. 41 (4): 435–448. Дои:10.1080/09670260600961080.
  31. ^ Додж (1966). Цитируется, но не упоминается в Штайдингер К.А., Джанген К. (1997). «Динофлагелляты». В Tomas C (ред.). Определение морского фитопланктона. Академическая пресса. С. 387–584. ISBN  978-0-08-053442-8.
  32. ^ Штайдингер К.А., Джанген К. (1997). «Динофлагелляты». В Томасе CR (ред.). Определение морского фитопланктона. Академическая пресса. С. 387–584. ISBN  978-0-08-053442-8.
  33. ^ Schiller, J., 1931–1937: Dinoflagellatae (Peridinineae) в monographischer Behandlung. В: RABENHORST, L. (ed.), Kryptogamen-Flora von Deutschland, Österreichs und der Schweiz. Акад. Verlag., Лейпциг. Vol. 10 (3): часть 1 (1–3) (1931–1933): часть 2 (1–4) (1935–1937).
  34. ^ Сурния А (1973). "Каталог espèces et taxons infraspécifiques de dinoflagellés marins actels publiés depuis la révision de J. Schiller. I. Dinoflagellés libres". Бейх. Nova Hedwigia. 48: 1–92.
  35. ^ Сурния А (1978). "Каталог espèces et taxons infraspécifiques de dinoflagellésmarins publiés depuis la révision de J. Schiller. III (Complément)". Преподобный Алгол. 13: 3–40 + опечатка 13, 186.
  36. ^ Сурния А (1982). "Каталог espèces et taxons infraspécifiques de dinoflagellésmarins actels publiés depuis la révision de J. Schiller. IV. (Complément)". Arch. Protistenkd. 126 (2): 151–168. Дои:10.1016 / S0003-9365 (82) 80046-8.
  37. ^ Сурния А (1990). "Каталог espèces et taxons infraspécifiques de dinoflagellésmarins actels publiés depuis la révision de J. Schiller. V. (Complément)". Acta Protozool. 29: 321–346. ISSN  0065-1583.
  38. ^ Сурния А (1993). "Каталог espèces et taxons infraspécifiques de dinoflagellésmarins publiés depuis la révision de J. Schiller. VI. (Complément)". Cryptog. Алгол. 14: 133–144. ISSN  0181-1568.
  39. ^ СОУРНИЯ, А., 1986: Атлас дю Фитопланктон Марин. Vol. I: Введение, Cyanophycées, Dictyochophycées, Dinophycées et Raphidophycées. Editions du CNRS, Париж.
  40. ^ Штайдингер К.А., Уильямс Дж. (1970). Динофлагелляты. Воспоминания о круизах «Песочные часы». 2. Флорида: Лаборатория морских исследований. OCLC  6206528.
  41. ^ Тейлор Ф (1976). Динофлагелляты из Международной экспедиции в Индийский океан: отчет о материалах, собранных Р.В. «Антон Бруун» 1963–1964 гг.. Biblioteca Botanica. 132. Э. Швейцербарт. ISBN  978-3510480036. OCLC  3026853.
  42. ^ Додж, Дж. Д. 1982. Морские динофлагелляты Британских островов. Канцелярия Ее Величества в Лондоне.
  43. ^ Гомес Ф (апрель 2003 г.). «Контрольный список средиземноморских свободноживущих динофлагеллят». Ботаника Марина. 46 (3): 215–242. Дои:10.1515 / BOT.2003.021. S2CID  84744638.
  44. ^ Хоппенрат М., Эльбрехтер М., Дребес Г. (2009). Морской фитопланктон: отдельные виды микрофитопланктона из Северного моря вокруг Гельголанда и Зильта.. Штутгарт: E. Schweizerbart'sche Verlagsbuchhandlung (Nägele und Obermiller). ISBN  978-3-510-61392-2.
  45. ^ Поповский Я., Пфистер Л.А. (1990). Dinophyceae (Динофлагеллиды). Süßwasserflora von Mitteleuropa. 6. Фишер. ISBN  978-3334002476.
  46. ^ Фриц Л., Тример Р. (декабрь 1985 г.). «Быстрая простая техника с использованием калькофлюорового белого M2R для визуализации текальных пластин динофлагеллят». Дж. Фикол. 21 (4): 662–4. Дои:10.1111 / j.0022-3646.1985.00662.x. S2CID  85004940.
  47. ^ Freudenthal et al. 2007 г.
  48. ^ Тренч R (1997). «Разнообразие симбиотических динофлагеллят и эволюция симбиозов микроводорослей и беспозвоночных». В Lessios H, MacIntyre I (ред.). Материалы восьмого Международного симпозиума по коралловым рифам, Панама, 24–29 июня 1996 г.. 2. Бальбоа, Панама: Смитсоновский институт тропических исследований. С. 1275–86. OCLC  833272061.
  49. ^ Schnepf E, Elbrächter M (февраль 1992 г.). «Стратегии питания динофлагеллят: обзор с акцентом на биологические аспекты клетки». Европейский журнал протистологии. 28 (1): 3–24. Дои:10.1016 / S0932-4739 (11) 80315-9. PMID  23194978.
  50. ^ Кофоид CA, Свези О. (1921). «Свободноживущая небронированная динофлагеллата». Всего лишь. Univ. Калифорния. 5: 1–538. Дои:10.5962 / bhl.title.24995.
  51. ^ а б Баркер Х.А. (1935). «Культура и физиология морских динофлагеллят». Arch. Микробиол. 6 (1–5): 157–181. Дои:10.1007 / BF00407285. S2CID  44657010.
  52. ^ Бихелер Б (1952). "Recherches sur les Peridiniens". Бык. Биол. Пт. Бельг. 36 (Прил.): 1–149.
  53. ^ а б Бурса А.С. (1961). «Годовой океанографический цикл в Иглулике в канадской Арктике. II. Фитопланктон». J. Fish. Res. Bd Can. 18 (4): 563–615. Дои:10.1139 / f61-046.
  54. ^ Норрис Д.Р. (1969). "Возможное фаготрофное питание в Ceratium lunula Шимпер " (PDF). Лимнол. Oceanogr. 14 (3): 448–9. Bibcode:1969LimOc..14..448N. Дои:10.4319 / lo.1969.14.3.0448. Архивировано из оригинал (PDF) на 2014-05-14. Получено 2014-05-13.
  55. ^ а б Dodge JD, Кроуфорд RM (июнь 1970 г.). «Морфология и тонкая структура Ceratium hirundinella (Dinophyceae) ". Дж. Фикол. 6 (2): 137–149. Дои:10.1111 / j.1529-8817.1970.tb02372.x. S2CID  84034844.
  56. ^ Эльбрахтер М (1979). «О таксономии небронированных динофитов (Dinophyta) из региона апвеллинга Северо-Западной Африки». Meteor Forschungsergebnisse. 30: 1–22.
  57. ^ Frey LC, Stoermer EF (1980). «Фаготрофия динофлагеллат в верховьях Великих озер». Пер. Am. Microsc. Soc. 99 (4): 439–444. Дои:10.2307/3225654. JSTOR  3225654.
  58. ^ Качон П.Дж., Качон М. "Система стоматофарингенов Kofoidinium Pavillard. Сравнение различных видов Peridiniens волокон и паразитов". Protistologica. 10: 217–222.
  59. ^ Гейнс Г., Тейлор Ф.Дж. (1984). «Внеклеточное пищеварение у морских динофлагеллят». J. Plankton Res. 6 (6): 1057–61. Дои:10.1093 / планкт / 6.6.1057.
  60. ^ а б Якобсон Д.М., Андерсон Д.М. (сентябрь 1986 г.). «Текатные гетеротрофные динофлагелляты: пищевое поведение и механизмы». Дж. Фикол. 22 (3): 249–258. Дои:10.1111 / j.1529-8817.1986.tb00021.x. S2CID  84321400.
  61. ^ Стром С.Л., Баскей Э.Дж. (1993). "Питание, рост и поведение текат гетеротрофной динофлагелляты. Облеа ротонда" (PDF). Лимнол. Oceanogr. 38 (5): 965–977. Bibcode:1993LimOc..38..965S. Дои:10.4319 / lo.1993.38.5.0965. Архивировано из оригинал (PDF) на 2015-09-23. Получено 2014-05-13.
  62. ^ Наустволл ЖЖ (январь 1998 г.). «Рост и поедание текатных гетеротрофных динофлагеллат. Diplopsalis lenticula (Diplopsalidaceae, Dinophyceae) ". Phycologia. 37 (1): 1–9. Дои:10.2216 / i0031-8884-37-1-1.1.
  63. ^ Сперо HJ (сентябрь 1982 г.). «Фаготрофия в Гимнодиниум грибовидный (Pyrrophyta): цветоножка как органелла пищеварения ». Дж. Фикол. 18 (3): 356–360. Дои:10.1111 / j.1529-8817.1982.tb03196.x. S2CID  85988790.
  64. ^ Исследователи зафиксировали динофлагеллату на видео, стреляя гарпунами в жертву
  65. ^ Schütt F (1895). "2. Teil, Studien iiber die Zellen der Peridineen". Die Peridineen der Plankton-Expedition. Ergebnisse der Plankton-Expedition der Humboldt-Stiftung. Allgemeiner Theil. С. 1–170. OCLC  69377189.
  66. ^ Смайда, Теодор Дж. (2002). «Адаптивная экология, стратегии роста и глобальное распространение цветения динофлагеллят». Журнал океанографии. 58 (2): 281–294. Дои:10.1023 / А: 1015861725470. ISSN  0916-8370. S2CID  55024118.
  67. ^ Хантли М., Сайкс П., Рохан С., Марин В. (1986). "Химически опосредованное отторжение копепод от добычи динофлагеллат Calanus pacificus и Паракаланус парвус: механизм, возникновение и значение ». Серия "Прогресс морской экологии". 28: 105–120. Bibcode:1986MEPS ... 28..105H. Дои:10.3354 / meps028105.
  68. ^ Фауст М., Галледж Р.А. (2002). Выявление вредных морских динофлагеллят. Вклады Национального гербария США. 42. Вашингтон, округ Колумбия: Отдел систематической биологии, ботаники, Национальный музей естественной истории. ISSN  0097-1618. Архивировано из оригинал на 2007-04-30. Получено 2007-05-18.
  69. ^ Lin, S .; Litaker, R.W .; Зунда, В. (2016). «Физиологическая экология фосфора и молекулярные механизмы в морском фитопланктоне». Журнал психологии. 52. С. 10–36.
  70. ^ Zhang, C .; Luo, H .; Huang, L .; Лин, С. (2017). «Молекулярный механизм утилизации глюкозо-6-фосфата в динофлагелляте Karenia mikimotoi». Вредные водоросли. 67. С. 74–84.
  71. ^ Luo, H .; Lin, X .; Li, L .; Zhang, C .; Lin, L .; Лин, С. (2017). «Транскриптомный и физиологический анализы динофлагелляты Karenia mikimotoi выявили молекулярный механизм утилизации АТФ на основе нещелочной фосфатазы». Экологическая микробиология. 19. С. 4506–4518.
  72. ^ Гранели Э, Тернер Дж. Т. (2007). Экология вредных водорослей. Экологические исследования: анализ и синтез. Экологические исследования. 189. Springer. ISBN  978-3-540-74009-4. ISSN  0070-8356.
  73. ^ Кастро П., Хубер ME (2010). Морская биология (8-е изд.). Макгроу Хилл. п. 95. ISBN  978-0071113021.
  74. ^ Гастингс Дж. В. (1996). «Химия и цвета биолюминесцентных реакций: обзор». Ген. 173 (1 Спецификация): 5–11. Дои:10.1016/0378-1119(95)00676-1. PMID  8707056.
  75. ^ Попен, Дж., А.-С. Куссатлегра и П. Гейстдёрфер. 1999. Биолюминесцентный Plancton marin. Rapport scientifique du Laboratoire d'Océanographie de l'École Navale LOEN, Брест, Франция, 83 стр.
  76. ^ Суини, Б. Биолюминесценция и циркадные ритмы. В: Тейлор 1987, стр. 269–281
  77. ^ а б c d Пикша С.Х., Молин М.А., Дело JF (1 октября 2009 г.). «Биолюминесценция в море». Ежегодный обзор морской науки. 2: 443–93. Bibcode:2010 ОРУЖИЕ .... 2..443H. Дои:10.1146 / annurev-marine-120308-081028. PMID  21141672. S2CID  3872860.
  78. ^ Кнауст Р., Урбиг Т., Ли Л., Тейлор В., Гастингс Дж. В. (февраль 1998 г.). «Циркадный ритм биолюминесценции у Pyrocystis не связан с различиями в количестве люциферазы: сравнительное исследование трех биолюминесцентных морских динофлагеллят». Дж. Фикол. 34 (1): 167–172. Дои:10.1046 / j.1529-8817.1998.340167.x. S2CID  84990824.
  79. ^ Фриц Л., Морс Д., Гастингс Дж. У. (февраль 1990 г.). «Циркадный ритм биолюминесценции гоньяулакса связан с суточными колебаниями количества светоизлучающих органелл». Журнал клеточной науки. 95 (Pt 2): 321–8. PMID  2196272.
  80. ^ Дыбас ЦЛ (май 2012 г.). «Яркие микробы - ученые открывают новые ключи к разгадке биолюминесценции». Scientific American. 360 (5): 19. Bibcode:2012SciAm.306e..19D. Дои:10.1038 / scientificamerican0512-19.
  81. ^ Castine Kayak (2015). «Ночная экскурсия на байдарках по биолюминесцентной бухте Castine Kayak». visitmaine.com. Получено 1 июля 2015.
  82. ^ Кеннеди Дакетт, Мэриеллен (10 февраля 2015 г.). «Флорида у воды: испытайте биолюминесценцию». Получено 31 июля 2018.
  83. ^ Холка, Н. Динофлагеллят стеролы. В: Тейлор 1987, стр. 316–359
  84. ^ Аллдридж А.Л., Пассов Ю., Пикша С.Х. (1998). «Характеристики и содержание прозрачных экзополимерных частиц (ТЭП) в морском снеге, образованном из текат-динофлагеллат». J. Plankton Res. 20 (3): 393–406. Дои:10.1093 / планкт / 20.3.393.
  85. ^ фон Штош HA (1973). «Наблюдения за вегетативным воспроизводством и половыми жизненными циклами двух пресноводных динофлагеллят, Gymnodinium pseudopalustre Шиллер и Woloszynskia apiculata sp. ноя ". Британский психологический журнал. 8 (2): 105–34. Дои:10.1080/00071617300650141.
  86. ^ Пфистер, Андерсон (1987). "Глава 14". В Тейлор Ф (ред.). Биология динофлагеллят. Ботанические монографии. 21. Blackwell Scientific. ISBN  978-0632009152.
  87. ^ Ли С., Вонг Дж. Т. (июль 2019 г.). «Пути реакции на повреждение ДНК у динофлагеллятов». Микроорганизмы. 7 (7): 191. Дои:10.3390 / микроорганизмы7070191. ЧВК  6680887. PMID  31284474.
  88. ^ Луч CA, Himes M (2012-12-02). Гл. 8: Генетика динофлагеллят. С. 263–298. ISBN  9780323138130. В Спектор 1984
  89. ^ Лин С., Ченг С., Сонг Б. и др. (2015). «Геном Symbiodinium kawagutii освещает экспрессию гена динофлагеллат и коралловый симбиоз». Наука. 350 (6261): 691–694. Дои:10.1126 / science.aad0408. PMID  26542574.
  90. ^ Песня B, Морс D, Песня Y и др. (2017). «Сравнительная геномика выявляет два основных периода ретропозиции генов, совпадающих с решающими периодами эволюции симбиодиниума». Геномная биология и эволюция. 9 (8): 2037–2047. Дои:10.1093 / gbe / evx144. ЧВК  5585692. PMID  28903461.
  91. ^ Hou Y, Ji N, Zhang H и др. (2018). «Зависимое от размера генома число копий гена PCNA в динофлагеллятах и ​​молекулярные доказательства ретропозиции как основного эволюционного механизма». Журнал психологии. 55 (1): 37–46. Дои:10.1111 / jpy.12815. PMID  30468510.
  92. ^ «Понимание разрыва отношений для защиты рифа». ScienceDaily. Получено 16 мая 2019.
  93. ^ Джексон CJ, Горник С.Г., Валлер РФ (2012). «Митохондриальный геном и транскриптом базальной динофлагелляты Hematodinium sp: эволюция характера в высоко производных митохондриальных геномах динофлагеллят». Геномная биология и эволюция. 4 (1): 59–72. Дои:10.1093 / gbe / evr122. ЧВК  3268668. PMID  22113794.
  94. ^ Джон, Уве; Лу, Ямэн; Вольраб, Силке; Грот, Марко; Яноушковец, Ян; Kohli, Gurjeet S .; Марк, Феликс С .; Бикмейер, Ульф; Фархат, Сара (апрель 2019 г.). «Аэробный эукариотический паразит с функциональными митохондриями, у которого, вероятно, отсутствует митохондриальный геном». Достижения науки. 5 (4): eaav1110. Bibcode:2019SciA .... 5.1110J. Дои:10.1126 / sciadv.aav1110. ISSN  2375-2548. ЧВК  6482013. PMID  31032404.
  95. ^ Лин С., Чжан Х, Спенсер Д., Норман Дж., Грей М. (2002). «Широкое и обширное редактирование митохондриальных мРНК динофлагеллят». Журнал молекулярной биологии. 320 (4): 727–739. Дои:10.1016 / S0022-2836 (02) 00468-0. PMID  12095251.
  96. ^ Лин С., Чжан Х, Грей М.В. (2018). Редактирование РНК у динофлагеллят и его значение для эволюционной истории редактирующего механизма. В: Сммит H (редактор) РНК и редактирование ДНК: молекулярные механизмы и их интеграция в биологические системы. John Wiley & Sons Inc., стр. 280–309.
  97. ^ Эндосимбиотическое происхождение, разнообразие и судьба пластид - NCBI
  98. ^ Дас, Биплаб (2019). «Морской паразит выживает без ключевых генов». Природа Ближнего Востока. Дои:10.1038 / nmiddleeast.2019.63.
  99. ^ Лаач Т., Заунер С., Штобе-Майер Б., Коваллик К.В., Майер Ю.Г. (июль 2004 г.). «Полученные из пластид миникольца одиночного гена динофлагеллаты Ceratium horridum локализованы в ядре». Молекулярная биология и эволюция. 21 (7): 1318–22. Дои:10.1093 / молбев / мш127. PMID  15034134.
  100. ^ Стерн Р.Ф., Андерсен Р.А., Джеймсон I, Кюппер ФК, Коффрот Массачусетс, Вауло Д., Ле Галл Ф., Верон Б., Брэнд Дж.Дж., Скелтон Х., Касаи Ф., Лилли Э.Л., Килинг П.Дж. (2012). «Оценка рибосомного внутреннего транскрибируемого спейсера (ITS) в качестве кандидата на маркер штрих-кода динофлагеллат». PLOS ONE. 7 (8): e42780. Bibcode:2012PLoSO ... 742780S. Дои:10.1371 / journal.pone.0042780. ЧВК  3420951. PMID  22916158.
  101. ^ Литакер Р.В., Вандерси М.В., Киблер С.Р., Рис К.С., Стокс Н.А., Лутцони Ф.М., Йониш Б.А., Западный Массачусетс, Блэк Миннесота, Тестер ПА (апрель 2007 г.). «Распознавание видов динофлагеллат с использованием последовательностей ITS рДНК». Дж. Фикол. 43 (2): 344–355. Дои:10.1111 / j.1529-8817.2007.00320.x. S2CID  85929661.
  102. ^ Ван, Лу; Чжуан, Юньюнь; Чжан, Хуань; Линь, Синь; Линь, Сенджи (2014). «Виды, кодирующие штрих-кодирование ДНК в комплексе Alexandrium tamarense, с использованием ИТС и предложением обозначения пяти видов». Вредные водоросли. 31: 100–113. Дои:10.1016 / j.hal.2013.10.013. PMID  28040099.
  103. ^ Стивенс, Тимоти Дж .; Раган, Массачусетс; Бхаттачарья, D; Чан, CX (21 ноября 2018 г.). «Основные гены в различных линиях динофлагеллат включают множество консервативных темных генов с неизвестными функциями». Научные отчеты. 8 (1): 17175. Bibcode:2018НатСР ... 817175S. Дои:10.1038 / s41598-018-35620-z. ЧВК  6249206. PMID  30464192.
  104. ^ MacRae RA, Fensome RA, Williams GL (1996). «Разнообразие ископаемых динофлагеллят, происхождение и исчезновение, а также их значение». Мочь. Дж. Бот. 74 (11): 1687–94. Дои:10.1139 / b96-205. ISSN  0008-4026.
  105. ^ Молдован Ж.М., Талызина Н.М. (август 1998 г.). «Биогеохимические свидетельства предков динофлагеллят в раннем кембрии». Наука. 281 (5380): 1168–70. Bibcode:1998Научный ... 281.1168M. Дои:10.1126 / science.281.5380.1168. PMID  9712575.
  106. ^ Moldowan JM, Dahl JE, Jacobson SR, Huizinga BJ, Fago FJ, Shetty R, Watt DS, Peters KE (февраль 1996 г.). «Хемостратиграфическая реконструкция биофаций: молекулярные доказательства связи цистообразующих динофлагеллят с предтриасовыми предками». Геология. 24 (2): 159–162. Bibcode:1996Гео .... 24..159M. Дои:10.1130 / 0091-7613 (1996) 024 <0159: CROBME> 2.3.CO; 2.
  107. ^ Талызина Н.М., Молдован Дж. М., Йоханниссон А., Фаго Ф. Дж. (Январь 2000 г.). «Сродство ранних кембрийских акритархов изучено с помощью микроскопии, флуоресцентной проточной цитометрии и биомаркеров». Преподобный Палеобот. Палинол. 108 (1–2): 37–53. Дои:10.1016 / S0034-6667 (99) 00032-9.
  108. ^ Saldarriaga J; Тейлор MFJR; Кавалер-Смит Т; Menden-Deuer S; Килинг П.Дж. (2004). «Молекулярные данные и эволюционная история динофлагеллят». Eur J Protistol. 40 (1): 85–111. Дои:10.1016 / j.ejop.2003.11.003. HDL:2429/16056.
  109. ^ Fensome RA, Saldarriaga JF, Taylor FJ (1999). «Пересмотр филогении динофлагеллат: совмещение морфологической и молекулярной филогении». Grana. 38 (2–3): 66–80. Дои:10.1080/00173139908559216.
  110. ^ Gunderson JH, Goss SH, Coats DW (1999). «Филогенетическое положение Amoebophrya sp., Заражающего Gymnodinium sanguineum». Журнал эукариотической микробиологии. 46 (2): 194–7. Дои:10.1111 / j.1550-7408.1999.tb04603.x. PMID  10361739. S2CID  7836479.
    Гундерсон Дж. Х., Джон С. А., Боман В. К., Coats DW (2002). «Множественные штаммы паразитической динофлагелляты Amoebophrya существуют в Чесапикском заливе». Журнал эукариотической микробиологии. 49 (6): 469–74. Дои:10.1111 / j.1550-7408.2002.tb00230.x. PMID  12503682. S2CID  30051291.
  111. ^ Лопес-Гарсия П., Родригес-Валера Ф., Педрос-Алио С., Морейра Д. (февраль 2001 г.). «Неожиданное разнообразие мелких эукариот в глубоководном антарктическом планктоне». Природа. 409 (6820): 603–7. Bibcode:2001Натура.409..603л. Дои:10.1038/35054537. PMID  11214316. S2CID  11550698.
  112. ^ Moon-van der Staay SY, De Wachter R, Vaulot D (февраль 2001 г.). «Океанические последовательности 18S рДНК из пикопланктона обнаруживают неожиданное эукариотическое разнообразие». Природа. 409 (6820): 607–10. Bibcode:2001Натура.409..607М. Дои:10.1038/35054541. PMID  11214317. S2CID  4362835.
  113. ^ Салдарриага Дж. Ф., Тейлор Ф. Дж., Килинг П. Дж., Кавальер-Смит Т. (сентябрь 2001 г.). «Филогения рРНК SSU ядер динофлагеллат предполагает множественные потери и замены пластид». Журнал молекулярной эволюции. 53 (3): 204–13. Bibcode:2001JMolE..53..204S. Дои:10.1007 / s002390010210. PMID  11523007. S2CID  28522930.
  114. ^ Яноусковец Дж., Хорак А., Оборник М., Лукес Дж., Килинг П. Дж. (Июнь 2010 г.). «Распространенное красное водорослевое происхождение апикомплексана, динофлагеллята и гетероконта пластид». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 107 (24): 10949–54. Bibcode:2010PNAS..10710949J. Дои:10.1073 / pnas.1003335107. ЧВК  2890776. PMID  20534454.
  115. ^ Горник С.Г., Кассин А.М., Макрей Д.И., Рамапрасад А., Рчиад З., МакКонвилл М.Дж., Бачич А., Макфадден Г.И., Пейн А., Валлер Р.Ф. (май 2015 г.). «Эндосимбиоз устраняется постепенным удалением пластиды в паразитической динофлагелляте». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (18): 5767–72. Bibcode:2015ПНАС..112.5767Г. Дои:10.1073 / pnas.1423400112. ЧВК  4426444. PMID  25902514.
  116. ^ Dorrell, R.G .; Хау, К. Дж. (2015). «Интеграция пластид с их хозяевами: уроки, извлеченные из динофлагеллят». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 112 (33): 10247–10254. Bibcode:2015ПНАС..11210247D. Дои:10.1073 / pnas.1421380112. ЧВК  4547248. PMID  25995366.
  117. ^ Торресен, Оле Кристиан (2010). «Изучение замены пластид в зеленой динофлагелляте Lepidodinium chlorophorum». HDL:10852/11559. Цитировать журнал требует | журнал = (Помогите)
  118. ^ Токсичный динофлагеллат Dinophysis acuminata содержит постоянные хлоропласты криптомонадного происхождения, а не клептохлоропласты.
  119. ^ Klinger, C.M .; Paoli, L .; Newby, R.J .; Wang, M. Y .; Carroll, H.D .; Leblond, J.D .; Howe, C.J .; Dacks, J. B .; Bowler, C .; Cahoon, A. B .; Dorrell, R.G .; Ричардсон, Э. (2018). «Редактирование пластидных транскриптов в линиях происхождения динофлагеллат демонстрирует применение в конкретных линиях, но сохраняет тенденции». Геномная биология и эволюция. 10 (4): 1019–1038. Дои:10.1093 / gbe / evy057. ЧВК  5888634. PMID  29617800.
  120. ^ Иманян, Б .; Килинг, П. Дж. (2007). «Динофлагелляты Durinskia baltica и Kryptoperidinium foliaceum сохраняют функционально перекрывающиеся митохондрии двух эволюционно различных линий». BMC Эволюционная биология. 7: 172. Дои:10.1186/1471-2148-7-172. ЧВК  2096628. PMID  17892581.
  121. ^ Gast, R.J .; Moran, D. M .; Dennett, M. R .; Карон, Д. А. (2007). «Клептопластика у антарктической динофлагелляты: в процессе эволюционного перехода?». Экологическая микробиология. 9 (1): 39–45. Дои:10.1111 / j.1462-2920.2006.01109.x. PMID  17227410.
  122. ^ Тейлор Ф.Дж. (1980). «Об эволюции динофлагеллят». Биосистемы. 13 (1–2): 65–108. Дои:10.1016/0303-2647(80)90006-4. PMID  7002229.
  123. ^ Логарес Р., Шалчиан-Тебризи К., Болтовской А., Ренгефорс К. (декабрь 2007 г.). «Обширная филогения динофлагеллат указывает на нечастые переходы от морской к пресной воде». Молекулярная филогенетика и эволюция. 45 (3): 887–903. Дои:10.1016 / j.ympev.2007.08.005. PMID  17928239.
  124. ^ Мертенс К.Н., Такано Ю., руководитель М.Дж., Мацуока К. (2014). «Живые окаменелости в теплом бассейне Индо-Тихоокеанского региона: убежище для теплолюбивых динофлагеллят во время оледенений». Геология. 42 (6): 531–534. Bibcode:2014Гео .... 42..531M. Дои:10.1130 / G35456.1.

Список используемой литературы

внешние ссылки