Гемматимонадетес - Gemmatimonadetes

Гемматимонадеты (или Гемматимонадота) являются филюм из бактерии создан в 2003 г. Тип включает два класса Gemmatimonadetes и Longimicrobia.

Разновидность

Типовой вид Gemmatimonas aurantiaca штамм Т-27^Т был изолирован от активного ила в системе очистки сточных вод в 2003 году.^[1] Это грамотрицательная бактерия, способная расти как за счет аэробного, так и анаэробного дыхания.^[2]

Второй культивируемый вид был Gemmatirosa kalamazoonensis ген. nov., sp. ноя штамм KBS708, который был выделен из органически обработанной сельскохозяйственной почвы в Мичигане, США.^[3]

Третий культивируемый вид Gemmatimonas phototrophica штамм AP64^Т был изолирован из мелководного пресноводного пустынного озера Tiān é hú (Лебединое озеро) в Северном Китае.^[4] Уникальной особенностью этого организма является наличие реакционных центров бактериального фотосинтеза. Вероятно, он приобрел гены аноксигенного фотосинтеза через горизонтальный перенос генов. G. phototrophica - факультативный фотогетеротрофный организм. Для роста ему требуется органический субстрат, но он может получать дополнительную энергию для своего метаболизма от света.^[5]

Longimicrobium terrae Штамм CB-286315T был выделен из образца почвы типичной средиземноморской лесной экосистемы, расположенной в Гранаде, Испания. Из-за этого большого филогенетического расстояния от других культивируемых гемматимонад он основал новый класс под названием Longimicrobia.^[6]

Распределение в окружающей среде

Данные независимых от культуры исследований показывают, что Gemmatimonadetes широко распространены во многих естественных средах обитания. Они составляют около 2% почвенных бактериальных сообществ и были определены как один из девяти основных типов, встречающихся в почвах; тем не менее, в настоящее время существует только шесть культивированных изолятов.^[7] Gemmatimonadetes были обнаружены в различных засушливых почвах, таких как луга, прерии и пастбища, а также в эвтрофных озерных отложениях и альпийских почвах. Этот широкий спектр сред, в которых были обнаружены Gemmatimonadetes, предполагает адаптацию к низкой влажности почвы.^[8] Проведенное исследование показало, что распределение Gemmatimonadetes в почве, как правило, больше зависит от наличия влаги, чем от агрегации, укрепляя убеждение в том, что представители этого типа предпочитают более сухие почвы.^[9] Меньшие количества были также обнаружены в различных водных средах, таких как пресные воды и отложения.

Таксономия

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛСПН),^[10] Национальный центр биотехнологической информации^[11] и Проект "Живое дерево всех видов".^[12]

• Тип Гемматимонадетес Zhang et al. 2003 г. [Gemmatimonadota Whitman et al. 2018]
  • Учебный класс Лонгимикробия Паскуаль и др. 2016 г.
    • Заказ Longimicrobiales Паскуаль и др. 2016 г.
      • Семья Longimicrobiaceae Паскуаль и др. 2016 г.
        • Род Лонгимикробий Паскуаль и др. 2016 г.
          • Разновидность Longimicrobium terrae Паскуаль и др. 2016 г.
  • Учебный класс Гемматимонадетес Zhang et al. 2003 г.
    • Заказ Gemmatimonadales Zhang et al. 2003 г.
      • Семья Gemmatimonadaceae Zhang et al. 2003 г.
        • Род Гемматироса DeBruyn et al. 2013
          • Разновидность Gemmatirosa kalamazoonesis DeBruyn et al. 2013
        • Род Гемматимонас Zhang et al. 2003 исправление. Zeng et al. 2015 г.
          • Разновидность G. phototrophica Zeng et al. 2015 г.
          • Разновидность G. aurantiaca Zhang et al. 2003 исправление. Zeng et al. 2015 г.

Смотрите также

• Список бактериальных заказов

Рекомендации

внешняя ссылка

• Краткая систематика
• Фаваз, М. Н. (2013). Выявление экологической роли Gemmatimonadetes посредством культивирования и молекулярного анализа сельскохозяйственных почв. 44-60. Краткий обзор филума.

Этот бактерии -связанная статья является заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.