Halanaerobiales - Halanaerobiales

Halanaerobiales
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Фирмикуты
Учебный класс:
Clostridia Рейни 2010
Заказ:
Halanaerobiales Рейни и Жилина 1995
Семьи и роды

В Halanaerobiales являются порядок из бактерии помещенный в учебный класс Clostridia, и охватывая две семьи, Halanaerobiaceae и Halobacteroidaceae. Первоначально помещенный в высоко полифилетический учебный класс Clostridia, согласно NCBI и LPSN, теперь считается, что он находится вне Фирмикуты. Halanaerobiales - это галофильный облигатные анаэробы с ферментативным или гомоацетогенным метаболизмом.[1]

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)[2] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)[3]а филогения основана на высвобождении LTP на основе 16S рРНК 106 посредством Проект "Живое дерево всех видов".[4]

 
  Halanaerobiaceae
 

Halarsenatibacter silvermanii Switzer Blum et al. 2010 г.

 
 
 

Halothermothrix orenii Cayol et al. 1994 г.

 
 
 

Halocella cellulosilytica Симанкова и др. 1994 г.

 
  Галанаэробиум
 

?H. alcaliphilum Tsai et al. 1995 г.

 
 

?H. Hydrogeniformans ♠ Brown et al. 2011 г.

 
 

H. salsuginis Bhupathiraju et al. 1994 г.

 
 
 
 

Х. ферментанс Кобаяши и др. 2000 г.

 
 

H. lacusrosei Cayol et al. 1995 г.

 
 
 
 

H. acetethylicum (Rengpipat et al. 1989) Rainey et al. 1995 г.

 
 

H. sehlinense Abdeljabbar et al. 2013

 
 
 

Х. кушнери Bhupathiraju et al. 1999 г.

 
 
 

H. praevalens Zeikus et al. 1984

 
 
 

H. congolense Ravot et al. 1998 г.

 
 

H. saccharolyticum saccharolyticum (Жилина и др., 1992) Рейни и др. 1995 г.

 
 

H. saccharolyticum senegalense (Cayol et al. 1994) Rainey et al. 1995 г.

 
 
 
 
 
 
 
 
 
 
  Halobacteroidaceae
 

?Sporohalobacter lortetii (Орен 1984) Орен и др. 1988 г.

 
 
 

Acetohalobium arabaticum Жилина и Заварзин 1990

 
 

Selenihalanaerobacter shriftii Switzer Blum et al. 2001 г.

 
 
 
  Натрониелла
 

N. acetigena Жилина и др. 1996 г.

 
 

Н. сульфидигена Сорокин и др. 2011 г.

 
 
 
 
  Орения
 

О. Марисмортуи (Орен и др., 1988) Рейни и др. 1995 г.

 
 

О. салинария Mouné et al. 2000 г.

 
 
 
 

Орения сивашенсис Жилина и др. 2000 г.

 
 

Halonatronum saccharophilum Жилина и др. 2001 г.

 
 
 
 
 
 

Halanaerobaculum tunisiense Hedi et al. 2009 г.

 
 

Halobacteroides halobius Орен и др. 1984 [Тип SP.]

 
 
  Halanaerobacter
 

?Х. хитиноворанс Лиау и Мах 1996

 
 

H. salinarius Mouné et al. 1999 г.

 
 
 

H. lacunarum (Жилина и др., 1992) Рейни и др. 1995 г.

 
 

Halobacteroides elegans Жилина и др. 1997 г.

 
 
 
 
 
 
 
 

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛСПН).

Рекомендации

  1. ^ Сингх О.В. (2012). Экстремофилы: устойчивые ресурсы и биотехнологические последствия. Джон Вили и сыновья. С. 76–79. ISBN  978-1-118-10300-5.
  2. ^ J.P. Euzéby. «Халанаэробиалес». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛПСН). Архивировано из оригинал на 2013-01-27. Получено 2011-11-17.
  3. ^ Сэйерс; и другие. «Халанаэробиалес». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2011-06-05.
  4. ^ Проект "Живое дерево всех видов".«Выпуск 106 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2011-11-17.

дальнейшее чтение

Бардавид, Рахель Элеви; Орен, Аарон (2012). «Аминокислотный состав белков анаэробных галофильных бактерий отряда Halanaerobiales». Экстремофилов. 16 (3): 567–572. Дои:10.1007 / s00792-012-0455-y.