Дельтапротеобактерии - Википедия - Deltaproteobacteria

Дельтапротеобактерии
Микрофотография Двулгариса.JPG
Desulfovibrio vulgaris
Научная классификация
Домен:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Учебный класс:
Дельтапротеобактерии
Заказы

В Дельтапротеобактерии являются классом Протеобактерии.[1] Все разновидность этой группы, как и все Протеобактерии, Грамотрицательный.

В Дельтапротеобактерии составляют ветвь преимущественно аэробных родов, формирующих плодовое тело Миксобактерии какой выпуск миксоспоры в неблагоприятных условиях окружающей среды, и ветвь строго анаэробных родов, которая содержит большинство известных сульфат- (Десульфовибрио, Десульфобактер, Десульфококк, Десульфонемаи т. д.) и сероредуцирующие бактерии (например. Десульфуромонады spp.) наряду с несколькими другими анаэробными бактериями с другой физиологией (например, восстанавливающие трехвалентное железо Геобактер виды и синтрофический Пелобактер и Syntrophus виды).

Недавно была выявлена ​​патогенная внутриклеточная дельтапротеобактерия.[2]

Было предложено, чтобы Дельтапротеобактерии быть разделенным на четыре новых типа: Desulfobacterota, Myxococcota, Бделловибрионотаи SAR324 (имя-заполнитель, ожидающее описания типа материала).[3]

Филогения

В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN) [4] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI)[5]и филогения основана на высвобождении 111 LTP на основе 16S рРНК Проект "Все виды живого дерева" [6]

Тиобактерии
 

?Альгидимарина пропионика ♠ Кендалл и др. 2005 г.

 
 

?Candidatus Entotheonella palauensis ' Haygood et al. 1999 г.

 
 

?Candidatus Magnetoglobus multicellularis ' Abreu et al. 2007 г.

 
 

?Deferrisoma camini Слободкина и др. 2012 г.

 
 

?Десульфокалдус терранеус ♠ Thevenieau et al. 2004 г.

 
 

?Desulfostipes sapovorans ♠ Myhr et al. 2000 г.

 
 

?Nitrospina gracilis ♦ Уотсон и Уотербери, 1971 г.

 
 

?Spirobacillus cienkowskii ♠ Мечников 1889

 
 
 

Десульфовибрионалес

 
 
 

Desulfurellaceae

 
Эпсилонпротеобактерии
 

Геоспириллий ♠

 
 

Тиомикроспира ♠

 
 

Nautiliaceae

 
 
 

Nitratiruptor tergarcus

 
 

Campylobacterales

 
 
 
 
 
 
 

Syntrophorhabdus aromaticivorans

 
 
 

Myxococcales (Плодоносящие планирующие бактерии)

 
 
 

Desulfuromonadales

 
 
 
 

Бактериоворакс [вкл. Peredibacter starrii ]

 
 

Desulfobulbaceae

 
 
 
 
 

Десульфомонил

 
 
 
 

Desulfobacterium anilini

 
 

Desulfarculus baarsii

 
 
 
 

Desulfobacca acetoxidans

 
 

Syntrophobacteraceae

 
 
 
 
 
 
 

Bdellovibrio bacteriovorus

 
 

Syntrophaceae

 
 
 

Desulfobacteraceae

 
 
 
 
 
 
 
 

Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LSPN)
♣ Международный журнал систематической бактериологии или же Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии (IJSB / IJSEM) опубликованные виды, которые находятся в печати.

Рекомендации

  1. ^ "www.ncbi.nlm.nih.gov". Получено 2009-03-19.
  2. ^ Schmitz-Esser S, Haferkamp I, Knab S и др. (Сентябрь 2008 г.). «Lawsonia intracellularis содержит ген, кодирующий функциональную транслоказу АТФ / АДФ, подобную риккетсии, для использования хозяином». J. Bacteriol. 190 (17): 5746–52. Дои:10.1128 / JB.00391-08. ЧВК  2519521. PMID  18606736.
  3. ^ Уэйт Д.В., Чувочина М., Пеликан С., Паркс Д.Х., Йилмаз П., Вагнер М., Лой А., Наганума Т., Накаи Р., Уитман В.Б., Хан М.В., Куевер Дж., Хугенгольц П. (2020). "Предложение о реклассификации классов протеобактерий Дельтапротеобактерии и Олигофлексия, и тип Термодесульфобактерии на четыре типа, отражающих основные функциональные возможности ». Int J Syst Evol Microbiol. 70 (11): 5972–6016. Дои:10.1099 / ijsem.0.004213. PMID  33151140.CS1 maint: использует параметр авторов (связь)
  4. ^ J.P. Euzéby. «Дельтапротеобактерии». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛПСН). Архивировано из оригинал на 2011-10-07. Получено 2013-03-20.
  5. ^ Сэйерс; и другие. «Дельтапротеобактерии». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2013-03-20.
  6. ^ Проект "Все виды живого дерева".«Выпуск 111 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)» (PDF). Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2013-03-20.

внешняя ссылка