Chloroflexi (тип) - Википедия - Chloroflexi (phylum)
| Хлорофлекси | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| (без рейтинга): | |
| Тип: | Хлорофлекси (Гаррити и Холт, 2002 г.) Гугенгольц и Стакебрандт, 2004 г. |
| Классы | |
| Синонимы | |
| |
В Хлорофлекси или же Хлоробактерии площадь филюм из бактерии содержащие изоляты с разнообразием фенотипов, включая членов, которые аэробный термофилы, которые используют кислород и хорошо растут при высоких температурах; аноксигенный фототрофы, которые используют свет для фотосинтез (зеленые несернистые бактерии ); и анаэробный сияющие, в котором используются галогенированные органические вещества (например, токсичный хлорированный этены и полихлорированные бифенилы ) как акцепторы электронов.
Большинство бактерий с точки зрения разнообразия diderms и пятно грамотрицательный, примечательными исключениями являются Фирмикуты (низкий G + C грамположительные), Актинобактерии (грамположительные с высоким содержанием G + C) и Дейнококк – Термус группа (грамположительные дидермы с густым пептидогликаном). Напротив, представители филума Chloroflexi монодермы, но окрашивают в основном грамотрицательные.[1]
История
Название таксона было создано в 2001 г. в томе 1 Руководство Берджи по систематической бактериологии и это латинское множественное число имени Хлорофлексус, имя тип род типа, a обычная практика.[2]
В 1987 г. Карл Вёзе, считающийся предвестником революции молекулярной филогении, разделил эубактерии на 11 подразделений на основе 16S рибосомная РНК (SSU) и сгруппировали роды Хлорофлексус, Герпетосифон и Термомикробий в «зеленые несернистые бактерии и их родственники»,[3][4] который был временно переименован в «Chloroflexi» в первом томе Руководства Берджи по систематической бактериологии.[5]
Chloroflexi - это глубоко разветвленный тип (см. Бактериальный тип ), в первом томе Руководства по систематической бактериологии Берджи было рассмотрено включение одного класса с тем же именем - класса Chloroflexi.[5] Однако с 2001 года были созданы новые классы благодаря недавно обнаруженным видам, и теперь тип Chloroflexi разделен следующим образом:[6]
- Хлорофлекси Gupta et al. 2012 г.
- Термомикробия Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г.
- "Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt, 2004 г.
- Anaerolineae Ямада и др., 2006 г.
- Caldilineae Ямада и др., 2006 г.
- Ктедонобактерии Cavaletti et al., 2007 исправление. Ябе и др., 2010 г.
"Dehalococcoidetes "- это имя-заполнитель, данное Hugenholtz & Stackebrandt, 2004,[7] после "Dehalococcoides ethenogenes"вид, частично описанный в 1997 году.[8] Первый полностью описанный вид был Dehalogenimonas lykanthroporepellens, автор Moe et al. 2009 г.,[9] но в описании этого вида класс не был объявлен официальным, а также не были указаны семейства или порядки, поскольку эти два вида разделяют только 90% 16S рибосомная РНК идентичность, что означает, что они могут попасть в разные семьи или даже отряды.[9]
Недавний филогенетический анализ Chloroflexi обнаружил очень слабую поддержку группировки различных классов, которые в настоящее время являются частью этого типа.[10] Шесть классов, составляющих тип, не всегда образовывали хорошо обоснованную кладу в филогенетических деревьях, основанных на конкатенированных последовательностях для больших наборов данных белков, и нет сохраненные индели подписи были идентифицированы, которые были уникально общими для всего филума.[10] Однако было обнаружено, что классы Chloroflexi и Thermomicrobia последовательно группируются как с помощью обычных филогенетических средств, так и с помощью идентификации общих консервативных сигнатурных инделей в 50S рибосомном белке L19 и ферменте UDP-глюкозо-4-эпимераза.[10] Было высказано предположение, что тип Chloroflexi Sensu stricto должны включать только классы Chloroflexi и Thermomicrobia, а остальные четыре класса («Dehalococcoidetes», Anaerolineae, Caldilineae и Ktedonobacteria) могут представлять один или несколько независимых типов ветвления по соседству с Chloroflexi.[10]
Филогения
В настоящее время принятая таксономия основана на Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN)[11] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI).[12] Филогения основана на высвобождении 132 LTP на основе 16S рРНК Проект "Живое дерево всех видов"[13]
Примечания:
♠ Штаммы, обнаруженные на Национальный центр биотехнологической информации (NCBI), но не указаны в Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (ЛСПН).
♪ Прокариоты, у которых чистые (аксенические) культуры не изолированы или недоступны; то есть они не культивируются или не могут поддерживаться в культуре более чем на несколько последовательных пассажей.
Таксономия
Род »Candidatus Хлоротрикс " Клаппенбах и Пирсон 2004[17]
- Разновидность "Candidatus Chlorothrix halophila " Клаппенбах и Пирсон 2004
Учебный класс Термофлексия Додсворт и др. 2014 г.
- Заказ Термофлексалес Додсворт и др. 2014 г.
- Семья Thermoflexaceae Додсворт и др. 2014 г.
- Род Термофлексус Додсворт и др. 2014 г.
- Разновидность Thermoflexus hugenholtzii Додсворт и др. 2014 г.
- Род Термофлексус Додсворт и др. 2014 г.
- Семья Thermoflexaceae Додсворт и др. 2014 г.
Учебный класс Дегалококкоидия Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoidetes" Hugenholtz & Stackebrandt 2004]
- Заказ Dehalococcoidales Löffler et al. 2013
- Семья Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013
- Род Dehalococcoides Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoides" Maymo-Gatell et al. 1997 г.]
- Разновидность Dehalococcoides mccartyi Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoides ethenogenes" Maymo-Gatell et al. 1997 г.]
- Род Дегалогенимонас Moe et al. 2009 г.
- Разновидность D. alkenigignens Bowmann et al. 2013
- Разновидность D. formicexedens Key et al. 2017 г.
- Разновидность D. lykanthroporepellens Moe et al. 2009 г. (тип sp.)
- Род Dehalococcoides Löffler et al. 2013 ["Dehalococcoides" Maymo-Gatell et al. 1997 г.]
- Семья Dehalococcoidaceae Löffler et al. 2013
Учебный класс Anaerolineae Ямада и др. 2006 г.
- Заказ Anaerolineales Ямада и др. 2006 г.
- Семья Анаэролиновые Ямада и др. 2006 г.
- Род »Терманаэротрикс " ♠ Gregoire et al. 2011 г.[18]
- Разновидность "Thermanaerothrix daxensis " ♠ Gregoire et al. 2011 г.
- Род »Brevefilum " ♠ Макилрой и др. 2017 г.
- Разновидность "Brevefilum fermentans " ♠ Макилрой и др. 2017 г.
- Род »Candidatus Roseilinea " ♠ Thiel et al. 2016 г.
- Разновидность "Candidatus Roseilinea gracile " ♠ Thiel et al. 2016 г.
- Род Thermomarinilinea Nunoura et al. 2013
- Разновидность Thermomarinilinea lacunifontana Nunoura et al. 2013
- Род Анаеролина Sekiguchi et al. 2003 исправление. Ямада и др. 2006 г.
- Разновидность A. thermolimosa Ямада и др. 2006 г.[14]
- Разновидность A. thermophila Sekiguchi et al. 2003 г.[15] (тип sp.)
- Род Bellilinea Ямада и др. 2007 г.[16]
- Разновидность Bellilinea caldifistulae Ямада и др. 2007 г.[16]
- Род Flexilinea Sun et al. 2015 г.
- Разновидность Flexilinea flocculi Sun et al. 2015 г.
- Род Левилинея Ямада и др. 2006 г.[14]
- Разновидность Levilinea saccharolytica Ямада и др. 2006 г.
- Род Leptolinea Ямада и др. 2006 г.[14]
- Разновидность Leptolinea tardivitalis Ямада и др. 2006 г.
- Род Longilinea Ямада и др. 2007 г.[16]
- Разновидность Longilinea arvoryzae Ямада и др. 2007 г.
- Род Орнатилина Подосокорская и др. 2013
- Разновидность Ornatilinea apprima Подосокорская и др. 2013
- Род Пелолинея Imachi et al. 2014 г.
- Разновидность Подводная лодка Pelolinea Imachi et al. 2014 г.
- Род »Терманаэротрикс " ♠ Gregoire et al. 2011 г.[18]
- Семья Анаэролиновые Ямада и др. 2006 г.
Учебный класс Ardenticatenia Kawaichi et al. 2013
- Заказ Ardenticatenales Kawaichi et al. 2013
- Семья Ardenticatenaceae Kawaichi et al. 2013
- Род »Candidatus Проминеофилум " ♠ Макилрой и др. 2016 г.
- Разновидность "Candidatus Проминеофилум бреве " ♠ Макилрой и др. 2016 г.
- Род Ардентикатена Kawaichi et al. 2013
- Разновидность Ardenticatena maritima Kawaichi et al. 2013
- Род »Candidatus Проминеофилум " ♠ Макилрой и др. 2016 г.
- Семья Ardenticatenaceae Kawaichi et al. 2013
Учебный класс Caldilineae Ямада и др. 2006 г.
- Заказ Caldilineales Ямада и др. 2006 г.
- Семья Caldilineaceae Ямада и др. 2006 г.
- Род Litorilinea Kale et al. 2013
- Разновидность Litorilinea aerophila Kale et al. 2013
- Род Caldilinea Sekiguchi et al. 2003 г.
- Разновидность C. aerophila Sekiguchi et al. 2003 г.[15] (тип sp.)
- Разновидность C. tarbellica Grégoire et al. 2011 г.[19]
- Род Litorilinea Kale et al. 2013
- Семья Caldilineaceae Ямада и др. 2006 г.
Учебный класс Ктедонобактерии Cavaletti et al. 2007 исправление. Yabe et al. 2010 г. [«Ктедобактерии» (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
- Заказ Thermogemmatisporales Yabe et al. 2011 г.
- Семья Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011 г.
- Род Термогемматиспора Yabe et al. 2011 г.[20]
- Разновидность T. foliorum Yabe et al. 2011 г.[20]
- Разновидность T. carboxidivorans Король и король 2014
- Разновидность Т. onikobensis Yabe et al. 2011 г.[20] (тип sp.)
- Род Термогемматиспора Yabe et al. 2011 г.[20]
- Семья Thermogemmatisporaceae Yabe et al. 2011 г.
- Заказ Ktedonobacterales Cavaletti et al. 2007 г. ["Ktedobacterales" (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
- Семья Ktedonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 г. ["Ktedobacteraceae" (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
- Род Диктиобактер Yabe et al. 2017 г.
- Разновидность Dictyobacter aurantiacus Yabe et al. 2017 г.
- Род Ктедонобактер корриг. Cavaletti et al. 2007 г. ["Ктедобактер"(так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
- Разновидность Ktedonobacter racemifer корриг. Cavaletti et al. 2007 г.[21] ["Ктедобактер (так в оригинале) гонщик" Cavaletti et al. 2006 г.]
- Род Диктиобактер Yabe et al. 2017 г.
- Семья Thermosporotrichaceae Yabe et al. 2010 г.
- Род Термоспоротрикс Yabe et al. 2010 г.[22]
- Разновидность Т. hazakensis Yabe et al. 2010 г.
- Разновидность Т. наруконенсис Ябэ, Сакаи и Ёкота 2016
- Род Термоспоротрикс Yabe et al. 2010 г.[22]
- Семья Ktedonobacteriaceae Cavaletti et al. 2007 г. ["Ktedobacteraceae" (так в оригинале) Cavaletti et al. 2006 г.]
Учебный класс Термомикробия Гаррити и Холт 2002 исправляют. Гугенгольц и Стакебрандт 2004 г.
- Род »Термобакулюм " ♠ Ботеро и др. 2004 г.[23]
- Разновидность "Thermobaculum terrenum " ♠ Ботеро и др. 2004 г.
- Заказ Sphaerobacterales Stackebrandt et al. 1997 г.
- Семья Sphaerobacteraceae Stackebrandt et al. 1997 г.
- Род Нитроланцеа Сорокин и др. 2014 г. ["Нитроланцетус" Сорокин и др. 2012 г.]
- Разновидность Nitrolancea hollandica Сорокин и др. 2014 г. ["Nitrolancetus hollandicus" Сорокин и др. 2012 г.]
- Род Sphaerobacter Demharter et al. 1989 г.
- Разновидность Sphaerobacter thermophilus Demharter et al. 1989 г.[24]
- Род Нитроланцеа Сорокин и др. 2014 г. ["Нитроланцетус" Сорокин и др. 2012 г.]
- Семья Sphaerobacteraceae Stackebrandt et al. 1997 г.
- Заказ Thermomicrobiales Гаррити и Холт 2002
- Семья Thermomicrobiaceae Гаррити и Холт 2002
- Род Терморудис Король и король 2014
- Разновидность T. Pharmacophila Houghton et al. 2015 г.
- Разновидность Т. peleae Король и король 2014
- Род Термомикробий Джексон и др. 1973 г.[25]
- Разновидность Т. карбоксидум Король и король 2014
- Разновидность T. roseum Джексон и др. 1973 г.
- Род Терморудис Король и король 2014
- Семья Thermomicrobiaceae Гаррити и Холт 2002
Учебный класс Хлорофлексия Gupta et al. 2013
- Заказ Каллотенуалес Cole et al. 2013
- Семья Kallotenuaceae Cole et al. 2013
- Род Kallotenue Cole et al. 2013
- Разновидность Kallotenue papyrolyticum Cole et al. 2013
- Род Kallotenue Cole et al. 2013
- Семья Kallotenuaceae Cole et al. 2013
- Заказ Herpetosiphonales Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonales" Кастенхольц 2001]
- Семья Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonaceae" Кастенхольц 2001]
- Род Герпетосифон Холт и Левин 1968
- Разновидность H. aurantiacus Холт и Левин 1968[26] ["Герпетосифон гигантский"]
- Разновидность H. geysericola Левин 1970[27][28] ["Левинелла гейзерикола"не"Phormidium geysericola" Коупленд 1936; "Herpetosiphon geysericolus" (sic) Левин 1970]
- Род Герпетосифон Холт и Левин 1968
- Семья Herpetosiphonaceae Gupta et al. 2013 ["Herpetosiphonaceae" Кастенхольц 2001]
- Заказ Хлорофлексалес Gupta et al. 2013
- Род »Дегалобиум " ♠ Wu et al. 2002 г.[29]
- Разновидность "Dehalobium chlorocoercia " ♠ Wu et al. 2002 г.
- Подотряд Roseiflexineae Gupta et al. 2013
- Семья Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
- Род »Kouleothrix " ♠ Kohno et al. 2002 г.
- Разновидность "Kouleothrix aurantiaca " ♠ Kohno et al. 2002 г.
- Род Гелиотрикс ♦ Пирсон и др. 1986 г.
- Разновидность Гелиотрикс орегоненсис ♦ Пирсон и др. 1986 г.[30]
- Род Розеифлексус Hanada et al. 2002 г.
- Разновидность Roseiflexus castenholzii Hanada et al. 2002 г.[31]
- Род »Kouleothrix " ♠ Kohno et al. 2002 г.
- Семья Roseiflexaceae Gupta et al. 2013
- Подотряд Chloroflexineae Gupta et al. 2013
- Семья Chloroflexaceae Gupta et al. 2013
- Род Candidatus Хлоранаэрофилум Thiel et al. 2016 г.
- Разновидность Candidatus Хлоранаэрофилум корпорозум Thiel et al. 2016 г.
- Род Хлорофлексус Пирсон и Кастенхольц 1974
- Разновидность C. aggregans Hanada et al. 1995 г.[32]
- Разновидность C. aurantiacus Пирсон и Кастенхольц 1974[33] (тип sp.)
- Разновидность C. islandicus Gaisin et al. 2017 г.
- Род Candidatus Хлоранаэрофилум Thiel et al. 2016 г.
- Семья Oscillochloridaceae Gupta et al. 2013
- Род Candidatus Хлороплока Горленко и др. 2014 г.
- Разновидность Candidatus Chloroploca asiatica Горленко и др. 2014 г.
- Род Хлоронема ♪ Дубинина и Горленко 1975
- Разновидность Chloronema giganteum ♪ Дубинина и Горленко 1975
- Род Осциллохлорис Горленко и Пивоварова 1989 исправление. Keppen et al. 2000 г.
- Разновидность О. chrysea ♪ Горленко и Пивоварова 1989(тип sp.)
- Разновидность О. trichoides ♦ (ex Szafer) Горленко и Коротков 1989 исправление. Keppen et al. 2000 г. ["Oscillatoria trichoides" (Шафер) Лаутерборн 1915]
- Род Candidatus Хлороплока Горленко и др. 2014 г.
- Семья Chloroflexaceae Gupta et al. 2013
- Род »Дегалобиум " ♠ Wu et al. 2002 г.[29]
Этимология
Название Хлорофлекси именительный падеж мужского рода множественного числа неолатинского Хлорофлексус - название первого описанного рода. Существительное - комбинация греческого прилагательного. хлорос, -а, на (χλωρός, -ά, -όν),[34] означает "зеленовато-желтый", а латинское пассивное причастие мужского рода - совершенное флексус (из флекто),[35] что означает «согнутый».[5] Этимология не имеет отношения к хлор, элемент, открытый в 1810 г. Сэр Хэмфри Дэви и назван в честь его бледно-зеленого цвета. Другой тип с тем же корнем - Хлороби, в то время как Цианобактерии имеет корень цианос (κύανος), что означает «сине-зеленый».[36]
В отличие от некоторых других типов, в названии родов Chloroflexi нет тематического корня, и фактически у многих родов, начинающихся с "Хлор-"или заканчивающийся на "-хлорис" являются цианобактериями или хлоробактериями.
Рекомендации
- ^ Сатклифф, И. К. (2010). "Перспектива уровня филума на архитектуре оболочки бактериальной клетки". Тенденции в микробиологии. 18 (10): 464–470. Дои:10.1016 / j.tim.2010.06.005. PMID 20637628.
- ^ Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вступительные эссе. Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ISBN 978-0-387-24143-2. Британская библиотека № GBA561951.
- ^ Холланд Л. (22 мая 1990 г.). «Везе, Карл в авангарде революции бактериальной эволюции». Ученый. 4 (10).
- ^ Woese, C. R. (1987). «Бактериальная эволюция». Микробиологические обзоры. 51 (2): 221–271. Дои:10.1128 / MMBR.51.2.221-271.1987. ЧВК 373105. PMID 2439888.
- ^ а б c Дон Дж. Бреннер; Ноэль Р. Криг; Джеймс Т. Стейли (26 июля 2005 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Вступительные эссе. Руководство Берджи по систематической бактериологии. 2А (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. п. 304. ISBN 978-0-387-24143-2. Британская библиотека № GBA561951.
- ^ Запись о классификации бактерий в LPSN; Euzéby, J.P. (1997). «Список названий бактерий с позиции в номенклатуре: папка, доступная в Интернете». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 47 (2): 590–2. Дои:10.1099/00207713-47-2-590. PMID 9103655.
- ^ Hugenholtz, P .; Штакебрандт, Э. (2004). «Реклассификация Sphaerobacter thermophilus из подкласса Sphaerobacteridae в типе Actinobacteria в класс Thermomicrobia (измененное описание) в типе Chloroflexi (измененное описание)». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 54 (6): 2049–2051. Дои:10.1099 / ijs.0.03028-0. PMID 15545432.
- ^ Maymo-Gatell, X .; Chien, Y .; Gossett, J.M .; Зиндер, С. Х. (1997). «Выделение бактерии, которая восстанавливает дехлорирование тетрахлорэтилена до этена». Наука. 276 (5318): 1568–1571. Дои:10.1126 / science.276.5318.1568. PMID 9171062.
- ^ а б Moe, W. M .; Yan, J .; Nobre, M. F .; Да Коста, М. С .; Рейни, Ф.А. (2009). «Dehalogenimonas lykanthroporepellens gen. Nov., sp. Nov., восстанавливающая дегалогенирующая бактерия, выделенная из грунтовых вод, загрязненных хлорированным растворителем». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 59 (11): 2692–2697. Дои:10.1099 / ijs.0.011502-0. PMID 19625421.
- ^ а б c d Gupta, R. S .; Chander, P .; Джордж, С. (2012). "Филогенетическая основа и молекулярные сигнатуры для класса Chloroflexi и его различных клад; предложение о разделении класса класса Chloroflexi. Ноябрь. В подотряд Chloroflexineae subord. Nov., состоящий из исправленного семейства Oscillochloridaceae и семейства Chloroflexaceae fam. Nov., и подотряд Roseiflexineae subord. Nov., содержащий семейство Roseiflexaceae fam. Nov ". Антони ван Левенгук. 103 (1): 99–119. Дои:10.1007 / s10482-012-9790-3. PMID 22903492.
- ^ J.P. Euzéby. «Хлорофлекси». Список названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). Получено 2018-07-20.
- ^ Сэйерс; и другие. «Хлорофлекси». Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) база данных таксономии. Получено 2014-03-20.
- ^ «Выпуск 132 LTP на основе 16S рРНК (полное дерево)». Проект "Живое дерево всех видов". Комплексная база данных рибосомных РНК Silva. Получено 2018-07-20.
- ^ а б c d е ж Yamada, T .; Sekiguchi, Y .; Hanada, S .; Imachi, H .; Охаши, А .; Harada, H .; Камагата, Ю. (2006). "Anaerolinea thermolimosa sp. ноя., Levilinea saccharolytica ген. nov., sp. ноя И Leptolinea tardivitalis ген. nov., sp. nov., новые нитчатые анаэробы и описание новых классов Anaerolineae classis nov. И Caldilineae classis nov. В бактериальном типе Chloroflexi ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 56 (6): 1331–1340. Дои:10.1099 / ijs.0.64169-0. PMID 16738111.
- ^ а б c Sekiguchi, Y .; Yamada, T .; Hanada, S .; Охаши, А .; Harada, H .; Камагата Ю. (2003). "Anaerolinea thermophila ген. nov., sp. ноя И Caldilinea aerophila ген. nov., sp. nov., новые нитчатые термофилы, которые представляют ранее некультивируемую линию доменных бактерий на уровне подтипа ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 53 (6): 1843–1851. Дои:10.1099 / ijs.0.02699-0. PMID 14657113.
- ^ а б c d Yamada, T .; Imachi, H .; Охаши, А .; Harada, H .; Hanada, S .; Kamagata, Y .; Секигучи, Ю. (2007). "Bellilinea caldifistulae ген. nov., sp. ноя И Longilinea arvoryzae ген. nov., sp. nov., строго анаэробные нитчатые бактерии типа Chloroflexi, выделенные из консорциумов, разрушающих метаногенный пропионат ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 57 (10): 2299–2306. Дои:10.1099 / ijs.0.65098-0. PMID 17911301.
- ^ Klappenbach, J. A .; Пирсон, Б. К. (2004). «Филогенетическая и физиологическая характеристика нитчатых аноксигенных фотоавтотрофных бактерий. 'Candidatus Chlorothrix halophila' Gen. Nov., sp. Нояб., Восстановлено из гиперсоленых микробных матов ». Архив микробиологии. 181 (1): 17–25. Дои:10.1007 / s00203-003-0615-7. PMID 14655000.
- ^ Grégoire, P .; Fardeau, M. L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Hamaide, F .; Biasutti, S .; Михотей, В. Р .; Bonin, P .; Оливье, Б. (2011). "Выделение и характеристика Thermanaerothrix daxensis ген. nov., sp. nov., термофильная анаэробная бактерия, относящаяся к типу «Chloroflexi», выделенная из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании ». Систематическая и прикладная микробиология. 34 (7): 494–497. Дои:10.1016 / j.syapm.2011.02.004. PMID 21621938.
- ^ Gregoire, P .; Bohli, M .; Cayol, J. -L .; Joseph, M .; Guasco, S .; Dubourg, K .; Cambar, J .; Михотей, В .; Bonin, P .; Фардо, М. -Л .; Оливье, Б. (2010). "Caldilinea tarbellica sp. nov., нитчатая термофильная анаэробная бактерия, выделенная из глубокого горячего водоносного горизонта в бассейне Аквитании ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (6): 1436–1441. Дои:10.1099 / ijs.0.025676-0. PMID 20584812.
- ^ а б c Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Йокота, А. (2010). "Термогемматиспора оникобенсис ген. nov., sp. ноя И Thermogemmatispora foliorum sp. nov., выделенный из опавших листьев на геотермальных почвах, и описание Thermogemmatisporaceae fam. Ноябрь и Thermogemmatisporales ord. Ноябрь В классе Ktedonobacteria ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 61 (4): 903–910. Дои:10.1099 / ijs.0.024877-0. PMID 20495028.
- ^ Cavaletti, L .; Monciardini, P .; Bamonte, R .; Schumann, P .; Rohde, M .; Сосио, М .; Донадио, С. (2006). «Новая линия нитчатых, спорообразующих, грамположительных бактерий из почвы». Прикладная и экологическая микробиология. 72 (6): 4360–4369. Дои:10.1128 / AEM.00132-06. ЧВК 1489649. PMID 16751552.
- ^ Yabe, S .; Aiba, Y .; Sakai, Y .; Hazaka, M .; Йокота, А. (2009). "Thermosporothrix hazakensis ген. nov., sp. nov., выделенный из компоста, описание Thermosporotrichaceae fam. Ноябрь. Внутри класса Ktedonobacteria Cavaletti et al. 2007 г. и исправленное описание класса Ktedonobacteria ». Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 60 (8): 1794–1801. Дои:10.1099 / ijs.0.018069-0. PMID 19767365.
- ^ Botero, L.M .; Brown, K. B .; Brumefield, S .; Burr, M .; Castenholz, R.W .; Янг, М .; Макдермотт, Т. Р. (2004). "Thermobaculum terrenum ген. nov., sp. nov: нефотрофный грамположительный термофил, представляющий группу экологических клонов, связанных с Chloroflexi (зелеными несерными бактериями) и Thermomicrobia ». Архив микробиологии. 181 (4): 269–277. Дои:10.1007 / s00203-004-0647-7. PMID 14745485.
- ^ Demharter, W .; Hensel, R .; Smida, J .; Штакебрандт, Э. (1989). "Sphaerobacter thermophilus ген. nov., sp. ноя Глубоко укоренившийся член подразделения актиномицетов, выделенный из термофильно обработанного осадка сточных вод ». Систематическая и прикладная микробиология. 11 (3): 261–266. Дои:10.1016 / S0723-2020 (89) 80023-2.
- ^ Джексон, Т. Дж .; Ramaley, R. F .; Майншайн, В. Г. (1973). «Термомикробий, новый род чрезвычайно термофильных бактерий». Международный журнал систематической бактериологии. 23: 28–36. Дои:10.1099/00207713-23-1-28.
- ^ Holt, J. G .; Левин, Р. А. (1968). "Herpetosiphon aurantiacus gen. Et sp. N., новый нитчатый скользящий организм". Журнал бактериологии. 95 (6): 2407–2408. Дои:10.1128 / JB.95.6.2407-2408.1968. ЧВК 315177. PMID 5669912.
- ^ Коупленд, Дж. Дж. (1936). «Йеллоустонские термальные миксофисы». Летопись Нью-Йоркской академии наук. 36: 4–223. Дои:10.1111 / j.1749-6632.1936.tb56976.x.
- ^ Левин, Р. А. (1970). «Новые виды Herpetosiphon (Flexibacterales)». Канадский журнал микробиологии. 16 (6): 517–520. Дои:10.1139 / м70-087. PMID 5423287.
- ^ Wu, Q .; Watts, J. E. M .; Сауэрс, К. Р .; Мэй, Х. Д. (2002). «Идентификация бактерии, которая специально катализирует восстановительное дехлорирование полихлорированных дифенилов с помощью двухфланцевых хлоринов». Прикладная и экологическая микробиология. 68 (2): 807–812. Дои:10.1128 / AEM.68.2.807-812.2002. ЧВК 126686. PMID 11823222.
- ^ Pierson, B.K .; Giovannoni, S.J .; Stahl, D. A .; Кастенхольц, Р. В. (1985). "Heliothrix oregonensis, gen. Nov., sp. Nov., фототрофная нитевидная скользящая бактерия, содержащая бактериохлорофилл а". Архив микробиологии. 142 (2): 164–167. Дои:10.1007 / BF00447061. PMID 2412519.
- ^ Hanada, S .; Takaichi, S .; Мацуура, К .; Накамура, К. (2002). "Roseiflexus castenholzii ген. nov., sp. nov., термофильная, нитчатая фотосинтезирующая бактерия, у которой отсутствуют хлоросомы ". Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии. 52 (Pt 1): 187–193. Дои:10.1099/00207713-52-1-187. PMID 11837302.
- ^ Hanada, S .; Hiraishi, A .; Shimada, K .; Мацуура, К. (1995). "Chloroflexus агрегатный sp. nov., нитчатая фототрофная бактерия, которая образует плотные клеточные агрегаты за счет активного скользящего движения ". Международный журнал систематической бактериологии. 45 (4): 676–681. Дои:10.1099/00207713-45-4-676. PMID 7547286.
- ^ Pierson, B.K .; Кастенхольц, Р. В. (1974). «Фототрофная скользящая нитчатая бактерия горячих источников, Chloroflexus aurantiacus, gen. And sp. Nov». Архив микробиологии. 100 (1): 5–24. Дои:10.1007 / BF00446302. PMID 4374148.
- ^ χλωρός. Лидделл, Генри Джордж; Скотт, Роберт; Греко-английский лексикон на Проект Персей
- ^ Льюис и Шорт ...
- ^ κύανος. Лидделл, Генри Джордж; Скотт, Роберт; Греко-английский лексикон на Проект Персей