Гаплогруппа D-M15 - Haplogroup D-M15

Гаплогруппа D-M15
Предок	D1a1
Определение мутаций	M15

Маршрут миграции гаплогруппы D считается наиболее вероятным Haber et al. 2019 г.

Его филогенетически ближайшие родственники встречаются у народов Япония, Центральная Азия, а Андаманские острова в Бенгальский залив. Это более отдаленно связано с Гаплогруппа E-M96, подклассы которых распространены повсюду Африка, Западная Азия, и Европа.

Распределение

Гаплогруппа D-M15 широко распространена среди населения, проживающего на северо-западе, севере, северо-востоке, востоке и юго-востоке от Гималаи. Не встречается среди популяций Индия на юг и юго-запад. Распространение гаплогруппы D1 в Юго-Восточной Азии также очень ограничено, поскольку она встречается там редко и только среди населения, говорящего Тибето-бирманский или Хмонг-мяо языки, у которых есть родовые связи с севером.

Распределение гаплогруппы D-M15 гораздо более регулярное на севере, так как она встречается почти среди всех популяций Центральной Азии и Северо-Восточной Азии к югу от русский граница, хотя обычно с низкой частотой 2% или меньше. Резкий скачок частоты гаплогруппы D-M15 происходит по мере приближения к Цинхай-Тибетское плато западных Китай: среди местного населения в Цинхай, было обнаружено, что оно достигает 100%. Его частота постепенно снижается по мере продвижения на юг через территорию Тибетские народы, так как Гаплогруппа O3, которая является наиболее распространенной гаплогруппой среди хмонг-мяо, а также обычно встречается среди Юго восточный азиат популяции, становится доминирующей. Гаплогруппа D-M15 продолжает встречаться с очень низкой частотой среди ханьцев на востоке; однако есть некоторые признаки того, что частота D-M15 среди ханьцев может значительно варьироваться в зависимости от местности. Вторичный, незначительный всплеск частоты гаплогруппы D-M15 снова происходит в Корея, где он может достигать 5–8%; это несколько повышенная частота простирается в Японию, что может подтвердить исторические отчеты об иммиграции из страны Цинь на крайнем западе древнего Китая в страну Джинхан, который, как полагают, находился где-то в южной половине Корейского полуострова. Что касается окончательного происхождения гаплогруппы D-M15, можно только предполагать, что у нее может быть недавний общий предок с другими членами большой линии D-M174, которые не тестировались как часть другой ветви. Такие редко встречаются среди современных популяций Центральная Азия.

Филогенетика

Филогенетическая история

До 2002 года в академической литературе было по крайней мере семь систем именования Филогенетического дерева Y-хромосомы. Это привело к значительной путанице. В 2002 году основные исследовательские группы объединились и сформировали Консорциум Y-хромосомы (YCC). Они опубликовали совместный документ, в котором было создано единое новое дерево, которое все согласились использовать. Позже группа гражданских ученых, интересующихся популяционной генетикой и генетической генеалогией, сформировала рабочую группу для создания любительского дерева, стремясь быть, прежде всего, своевременным. В приведенной ниже таблице собраны все эти работы на основе знакового Дерева YCC 2002 года. Это позволяет исследователю, просматривающему ранее опубликованную литературу, быстро перемещаться между номенклатурами.

YCC 2002/2008 (стенография)	(α)	(β)	(γ)	(δ)	(е)	(ζ)	(η)	YCC 2002 (от руки)	YCC 2005 (от руки)	YCC 2008 (от руки)	YCC 2010r (от руки)	ISOGG 2006	ISOGG 2007	ISOGG 2008	ISOGG 2009	ISOGG 2010	ISOGG 2011	ISOGG 2012
D-M174	*	*	*	*	*	*	*	*	D	D	D	D	D	D	D	D	D	D
D-M15	4	IV	3G	12	Eu5	H3	B	D1	D1	D1	D1	D1	D1	D1	D1	D1	D1	D1
D-M55	*	*	*	*	*	*	*	*	D2	D2	D2	D2	D2	D2	D2	D2	D2	D2
D-P12	4	IV	3G	11	Eu5	H2	B	D2a	D2a	D2a1a1	D2a1a1	D2	D2	D2a1a1	D2a1a1	D2a1a1	удалено	удалено
D-M116.1	4	IV	3G	11	Eu5	H2	B	D2b *	D2a	D2a	D2a	D2a	D2a	D2a	D2a	D2a	удалено	удалено
D-M125	4	IV	3G	11	Eu5	H2	B	D2b1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1	D2a1
D-M151	4	IV	3G	11	Eu5	H2	B	D2b2	D2a1	D2a2	D2a2	D2a2	D2a2	D2a2	D2a2	D2a2	D2a2	D2a2

Публикации исследований

Следующие исследовательские группы в соответствии с их публикациями были представлены в создании дерева YCC.

α Джоблинг и Тайлер-Смит 2000 и Каладжиева 2001
β Андерхилл 2000
γ Молот 2001
δ Карафет 2001
ε Семино 2000
ζ Вс 1999
η Капелли 2001

Филогенетические деревья

По дереву ISOGG (Версия: 14.151).^[1]

DE (ЯП)
- D (CTS3946)
  - D1 (M174 / страница 30, IMS-JST021355, Гаплогруппа D-M174 )
    - D1a (CTS11577)
      - D1a1 (F6251 / Z27276)
        D1a1a (M15)Тибет
        D1a1b (P99)Тибет, Монгол, Центральная Азия
      - D1a2 (M64.1 / Страница 44.1, M55) Япония （Люди Ямато 、Народ рюкюань 、Айны ）
      - D1a3 (Y34637)Андаманские острова （Онге люди 、Люди Джарава ）
    - D1b (L1378) Филиппины^[2]
  - D2 (A5580.2)Нигерия 、Саудовская Аравия 、Сирия

Смотрите также

Генетика

Y-ДНК D субклады

Основное дерево Y-ДНК

Филогенетическое древо человека Гаплогруппы ДНК Y-хромосомы ^{[χ 1]}^{[χ 2]}

"Y-хромосомный Адам "

A0-T ^{[χ 3]}

A1 ^{[χ 4]}

F2

F3

GHIJK

я

J

LT ^{[χ 5]}

K2 ^{[χ 6]}

L

Т

K2a ^{[χ 7]}

K2b ^{[χ 8]}

K2c

K2d

K2e ^{[χ 9]}

K-M2313 ^{[χ 10]}

K2b1 ^{[χ 11]}

п ^{[χ 12]}

Нет

S ^{[χ 13]}

M ^{[χ 14]}

P1

P2

Сноски

^ Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.
^ Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)
^ Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).
^ Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.
^ Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.
^ С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.
^ Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».
^ Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.
^ Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).
^ K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)
^ Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.
^ Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.
^ Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)
^ Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

использованная литература

[vanOven2014-3] Ван Овен М., Ван Гейстелен А., Кайзер М., Декорте Р., Larmuseau HD (2014). «Видеть лес за деревьями: минимальная эталонная филогения Y-хромосомы человека». Человеческая мутация. 35 (2): 187–91. Дои:10.1002 / humu.22468. PMID 24166809.

[ISOGG2015-4] Международное общество генетической генеалогии (ISOGG; 2015), Дерево гаплогруппы Y-ДНК 2015. (Дата обращения: 1 февраля 2015 г.)

[A0-T-5] Гаплогруппа A0-T также известна как A-L1085 (а ранее как A0'1'2'3'4).

[A1-6] Гаплогруппа A1 также известна как A1'2'3'4.

[LT-7] Гаплогруппа LT (L298 / P326) также известна как гаплогруппа K1.

[K2-8] С 2002 по 2008 гг. Гаплогруппа T-M184 была известна как «Гаплогруппа К2». С тех пор это имя было изменено на K-M526, брат Haplogroup LT.

[K2a-9] Гаплогруппа K2a (M2308) и ее первичный субклад K-M2313 были отделены от гаплогруппы NO (F549) в 2016 году (это последовало за публикацией: Позник Г.Д., Сюэ У., Мендес Ф.Л. и др. (2016). «Прерывистые всплески в демографии мужчин-мужчин на основе 1244 всемирных последовательностей Y-хромосомы». Природа Генетика. 48 (6): 593–9. Дои:10,1038 / нг.3559. ЧВК 4884158. PMID 27111036. В прошлом другие гаплогруппы, включая NO (M214) и K2e, также были идентифицированы с именем «K2a».

[K2b-10] Гаплогруппа K2b (M1221 / P331 / PF5911) также известна как MPS гаплогруппы.

[K2e-11] Гаплогруппа K2e (K-M147) ранее была известна как «гаплогруппа X» и «K2a» (но является дочерней субкладой нынешней K2a).

[K-M2313-12] K-M2313 *, у которого пока нет филогенетического названия, был зарегистрирован у двух живых людей, имеющих этнические связи с Индией и Юго-Восточной Азией. Кроме того, K-Y28299, который, по-видимому, является основной ветвью K-M2313, был обнаружен у трех живых людей из Индии. См .: Позник op. соч.; YFull YTree v5.08, 2017, «К-М2335», и; Филодерево, 2017, «Детали маркеров Y-SNP, включенных в минимальное дерево Y» (Дата доступа к этим страницам: 9 декабря 2017 г.)

[K2b1-13] Гаплогруппа K2b1 (P397 / P399) также известна как гаплогруппа MS, но имеет более широкую и сложную внутреннюю структуру.

[P-14] Гаплогруппа P (P295) также известна как K2b2.

[S-15] Гаплогруппа S с 2017 года также известна как K2b1a. (Ранее имя Гаплогруппа S было присвоено K2b1a4.)

[M-16] Гаплогруппа M, по состоянию на 2017 год, также известна как K2b1b. (Ранее имя Гаплогруппа M было присвоено K2b1d.)

[1] [1]

[ISOGG2014-2] Y-ДНК Гаплогруппа D и ее субклады - 2014

[1]

[2]

[χ 1]

[χ 2]

[χ 3]

[χ 4]

[χ 5]

[χ 6]

[χ 7]

[χ 8]

[χ 9]

[χ 10]

[χ 11]

[χ 12]

[χ 13]

[χ 14]