KPNB1 - Википедия - KPNB1
Импортин субъединица бета-1 это белок что у людей кодируется КПНБ1 ген.[5][6]
Функция
Нуклеоцитоплазматический транспорт, процесс, зависящий от сигнала и энергии, происходит через комплексы ядерных пор, встроенных в ядерную оболочку. Импорт белков, содержащих классический сигнал ядерной локализации (NLS) требует рецептора импорта NLS, гетеродимера альфа- и бета-субъединиц импортина. Каждый из этих субъединиц является частью кариоферин семейство белков. Импортин альфа связывает NLS-содержащий груз в цитоплазма и importin beta стыкуется с комплексом на цитоплазматической стороне комплекса ядерных пор. В присутствии нуклеозидтрифосфатов и небольшого GTP-связывающего белка Ran комплекс перемещается в комплекс ядерных пор и субъединицы импортина диссоциируют. Импортин альфа входит в нуклеоплазма с его белком-пассажиром и бета-импортином остается в поре. Взаимодействия между importin beta и FG-повторами нуклеопоринов важны для транслокации через поровый комплекс. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства importin beta.[7]
Взаимодействия
KPNB1 был показан взаимодействовать с:
- KPNA3,[8][9]
- Кариоферин альфа 1,[8][10]
- Кариоферин альфа 2,[8][11][12]
- Матери против декапентаплегического гомолога 3,[13]
- NUP153[14][15][16]
- NUP50,[17]
- NUP98,[18][19]
- Нуклеопорин 62,[10][14]
- P53,[20]
- Белок, связанный с паратироидным гормоном,[21][22]
- РАНБП1,[23][24]
- РАНБП2,[14][23][25]
- Ран (биология),[10][24][26] и
- SMN1.[27]
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000108424 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001440 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Чи NC, Адам EJ, Адам С.А. (август 1995 г.). «Последовательность и характеристика фактора импорта цитоплазматического ядерного белка p97». J. Cell Biol. 130 (2): 265–74. Дои:10.1083 / jcb.130.2.265. ЧВК 2199936. PMID 7615630.
- ^ Гёрлих Д., Костка С., Крафт Р., Дингуолл С., Ласки Р.А., Хартманн Э., Прен С. (сентябрь 1995 г.). «Две разные субъединицы importin сотрудничают, чтобы распознавать сигналы ядерной локализации и связывать их с ядерной оболочкой». Curr. Биол. 5 (4): 383–92. Дои:10.1016 / S0960-9822 (95) 00079-0. HDL:11858 / 00-001M-0000-002D-1CBD-2. PMID 7627554. S2CID 6055941.
- ^ «Ген Entrez: KPNB1 кариоферин (импортин) бета 1».
- ^ а б c Köhler M, Speck C, Christiansen M, Bischoff FR, Prehn S, Haller H, Görlich D, Hartmann E (ноябрь 1999 г.). «Доказательства различных субстратных специфичностей членов семейства импортина альфа в импорте ядерного белка». Мол. Клетка. Биол. 19 (11): 7782–91. Дои:10.1128 / mcb.19.11.7782. ЧВК 84838. PMID 10523667.
- ^ Начуры М.В., Райдер Ю.В., Ламонд А.И., Вайс К. (январь 1998 г.). «Клонирование и характеристика hSRP1 гамма, тканеспецифического фактора ядерного транспорта». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (2): 582–7. Дои:10.1073 / пнас.95.2.582. ЧВК 18463. PMID 9435235.
- ^ а б c Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (март 1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID 9102465.
- ^ Нагоши Э., Йонеда Й. (апрель 2001 г.). «Димеризация белка 2, связывающего регуляторный элемент стерола, через домен спираль-петля-спираль-лейциновая застежка-молния является предпосылкой для его ядерной локализации, опосредованной импортином бета». Мол. Клетка. Биол. 21 (8): 2779–89. Дои:10.1128 / MCB.21.8.2779-2789.2001. ЧВК 86908. PMID 11283257.
- ^ Ульман К.С., Пауэрс М.А., Forbes DJ (сентябрь 1997 г.). «Ядерные рецепторы экспорта: от импортина к экспортину». Клетка. 90 (6): 967–70. Дои:10.1016 / s0092-8674 (00) 80361-x. PMID 9323123. S2CID 577884.
- ^ Сяо З, Лю Х, Лодиш Х.Ф. (август 2000 г.). «Импортин бета опосредует ядерную транслокацию Smad 3». J. Biol. Chem. 275 (31): 23425–8. Дои:10.1074 / jbc.C000345200. PMID 10846168.
- ^ а б c Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК 2199621. PMID 11266456.
- ^ Накельный С., Шейх С., Берк Б., Дрейфус Г. (апрель 1999 г.). «Nup153 представляет собой M9-содержащий мобильный нуклеопорин с новым Ran-связывающим доменом». EMBO J. 18 (7): 1982–95. Дои:10.1093 / emboj / 18.7.1982. ЧВК 1171283. PMID 10202161.
- ^ Келенбах Р.Х., Джерас Л. (июнь 2000 г.). «Фосфорилирование ядерного транспортного механизма снижает импорт ядерного белка in vitro». J. Biol. Chem. 275 (23): 17848–56. Дои:10.1074 / jbc.M001455200. PMID 10749866.
- ^ Линдси М.Э., Плафкер К., Смит А.Е., Клерман Б.Е., Макара И.Г. (август 2002 г.). «Npap60 / Nup50 - это тристабильный переключатель, который стимулирует импорт ядерного белка, опосредованный импортин-альфа: бета». Клетка. 110 (3): 349–60. Дои:10.1016 / с0092-8674 (02) 00836-х. PMID 12176322. S2CID 15515037.
- ^ Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (сентябрь 1997 г.). «RanGTP-опосредованный ядерный экспорт кариоферина альфа включает его взаимодействие с нуклеопорином Nup153». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (18): 9699–704. Дои:10.1073 / пнас.94.18.9699. ЧВК 23253. PMID 9275187.
- ^ Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (май 1997 г.). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК 24630. PMID 9144189.
- ^ Акакура С., Йошида М., Йонеда Ю., Хориноути С. (май 2001 г.). «Роль Hsc70 в регуляции ядерно-цитоплазматического транспорта чувствительного к температуре p53 (p53Val-135)». J. Biol. Chem. 276 (18): 14649–57. Дои:10.1074 / jbc.M100200200. PMID 11297531.
- ^ Cingolani G, Bednenko J, Gillespie MT, Gerace L (декабрь 2002 г.). «Молекулярная основа для распознавания неклассического сигнала ядерной локализации импортином бета». Мол. Клетка. 10 (6): 1345–53. Дои:10.1016 / с1097-2765 (02) 00727-х. PMID 12504010.
- ^ Лам М.Х., Ху В., Сяо С.Ю., Гиллеспи М.Т., Янс Д.А. (март 2001 г.). «Молекулярное рассечение узнаваемого импортином бета1 сигнала ядерного нацеливания белка, связанного с паратироидным гормоном». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 282 (2): 629–34. Дои:10.1006 / bbrc.2001.4607. PMID 11401507.
- ^ а б Ясин Н.Р., Блобель Г. (сентябрь 1999 г.). «Гидролиз GTP связывает инициацию и прекращение ядерного импорта на нуклеопорине nup358». J. Biol. Chem. 274 (37): 26493–502. Дои:10.1074 / jbc.274.37.26493. PMID 10473610.
- ^ а б Плафкер К., Макара И.Г. (май 2000 г.). «Облегчение ядерно-цитоплазматического перемещения Ran-связывающего белка RanBP1». Мол. Клетка. Биол. 20 (10): 3510–21. Дои:10.1128 / mcb.20.10.3510-3521.2000. ЧВК 85643. PMID 10779340.
- ^ Дельфин С., Гуан Т., Мельхиор Ф, Джерас Л. (декабрь 1997 г.). «RanGTP нацелен на p97 на RanBP2, нитчатый белок, локализованный на цитоплазматической периферии комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 8 (12): 2379–90. Дои:10.1091 / mbc.8.12.2379. ЧВК 25714. PMID 9398662.
- ^ Кутай У., Изаурральде Э., Бишофф Ф. Р., Маттай И. В., Гёрлих Д. (март 1997 г.). «Доминантно-отрицательные мутанты импортина-бета блокируют множественные пути импорта и экспорта через комплекс ядерных пор». EMBO J. 16 (6): 1153–63. Дои:10.1093 / emboj / 16.6.1153. ЧВК 1169714. PMID 9135132.
- ^ Нараянан У., Оспина Дж.К., Фрей М.Р., Хеберт М.Д., Матера АГ (июль 2002 г.). «SMN, белок спинальной мышечной атрофии, образует предимпортный комплекс snRNP со снурпортином1 и импортином бета». Гм. Мол. Genet. 11 (15): 1785–95. Дои:10.1093 / hmg / 11.15.1785. ЧВК 1630493. PMID 12095920.
дальнейшее чтение
- Букринский М.И., Хаффар О.К. (1997). «Ядерный импорт ВИЧ-1: в поисках лидера». Передний. Biosci. 2 (4): d578–87. Дои:10.2741 / A213. PMID 9366553.
- Букринский М.И., Хаффар О.К. (1998). «Ядерный импорт ВИЧ-1: матричный белок снова в центре внимания, на этот раз вместе с Vpr». Мол. Med. 4 (3): 138–43. Дои:10.1007 / BF03401911. ЧВК 2230352. PMID 9562972.
- Кристоф Д., Кристоф-Хобертус С., Пишон Б. (2000). «Ядерное нацеливание белков: сколько разных сигналов?». Клетка. Сигнал. 12 (5): 337–41. Дои:10.1016 / S0898-6568 (00) 00077-2. PMID 10822175.
- Чук Ю.М., Блобель Г. (2001). «Кариоферины и ядерный импорт». Curr. Мнение. Struct. Биол. 11 (6): 703–15. Дои:10.1016 / S0959-440X (01) 00264-0. PMID 11751052.
- Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). «Роль вспомогательных белков ВИЧ-1 в вирусном патогенезе и взаимодействиях хозяин-патоген». Cell Res. 15 (11–12): 923–34. Дои:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID 16354571.
- Букринский М.И., Шарова Н., Демпси М.П., Стэнвик Т.Л., Букринская А.Г., Хаггерти С., Стивенсон М. (1992). «Активный ядерный импорт преинтеграционных комплексов вируса иммунодефицита человека 1 типа». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 89 (14): 6580–4. Дои:10.1073 / пнас.89.14.6580. ЧВК 49545. PMID 1631159.
- Букринский М.И., Хаггерти С., Демпси М.П., Шарова Н., Аджубель А., Шпиц Л., Льюис П., Гольдфарб Д., Эмерман М., Стивенсон М. (1993). «Сигнал ядерной локализации в матричном белке ВИЧ-1, который управляет инфекцией неделящихся клеток». Природа. 365 (6447): 666–9. Дои:10.1038 / 365666a0. PMID 8105392. S2CID 25678.
- Лаунсбери К.М., Ричардс С.А., Перлунгер Р.Р., Макара И.Г. (1996). «Связывающие домены Ran способствуют взаимодействию Ran с p97 / бета-кариоферином, связывая этапы стыковки и транслокации ядерного импорта». J. Biol. Chem. 271 (5): 2357–60. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2357. PMID 8576188.
- Гёрлих Д., Хенкляйн П., Ласки Р.А., Хартманн Э. (1996). «Мотив из 41 аминокислоты в импортине-альфа обеспечивает связывание с импортином-бета и, следовательно, транзит в ядро». EMBO J. 15 (8): 1810–7. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00530.x. ЧВК 450097. PMID 8617226.
- Вайс К., Райдер У., Ламонд А.И. (1996). «Консервативный аминоконцевой домен hSRP1 альфа необходим для импорта ядерного белка». EMBO J. 15 (8): 1818–25. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00531.x. ЧВК 450098. PMID 8617227.
- Морояну Дж., Блобель Дж., Раду А. (1996). «Импорт ядерного белка: Ran-GTP диссоциирует гетеродимер кариоферина алфавита, смещая альфа из перекрывающегося сайта связывания на бета». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 93 (14): 7059–62. Дои:10.1073 / пнас.93.14.7059. ЧВК 38935. PMID 8692944.
- Герлих Д., Панте Н., Кутай Ю., Эби Ю., Бишофф Ф. Р. (1996). «Идентификация различных ролей RanGDP и RanGTP в импорте ядерного белка». EMBO J. 15 (20): 5584–94. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00943.x. ЧВК 452303. PMID 8896452.
- Чи NC, Адам EJ, Адам С.А. (1997). «Различные связывающие домены для Ran-GTP и Ran-GDP / RanBP1 на ядерном импортном факторе p97». J. Biol. Chem. 272 (10): 6818–22. Дои:10.1074 / jbc.272.10.6818. PMID 9045717.
- Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID 9102465.
- Кутай У., Изаурральде Э., Бишофф Ф.Р., Маттай И.В., Гёрлих Д. (1997). «Доминантно-отрицательные мутанты импортина-бета блокируют множественные пути импорта и экспорта через комплекс ядерных пор». EMBO J. 16 (6): 1153–63. Дои:10.1093 / emboj / 16.6.1153. ЧВК 1169714. PMID 9135132.
- Бонифачи Н., Морояну Дж., Раду А., Блобель Г. (1997). «Кариоферин бета2 опосредует ядерный импорт мРНК-связывающего белка». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (10): 5055–60. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5055. ЧВК 24630. PMID 9144189.
- Герлих Д., Домбровски М., Бишофф Ф.Р., Кутай Ю., Борк П., Хартманн Э., Прен С., Изаурральде Э. (1997). «Новый класс белков, связывающих RanGTP». J. Cell Biol. 138 (1): 65–80. Дои:10.1083 / jcb.138.1.65. ЧВК 2139951. PMID 9214382.
- Тиганис Т, Флинт А.Дж., Адам С.А., Тонкс Н.К. (1997). «Ассоциация Т-клеточного протеина тирозинфосфатазы с ядерным импортным фактором p97». J. Biol. Chem. 272 (34): 21548–57. Дои:10.1074 / jbc.272.34.21548. PMID 9261175.
Галерея PDB | |
|---|---|
|
