Нуклеопорин 62 - Википедия - Nucleoporin 62

NUP62
NuclearPore crop.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыNUP62, IBSN, SNDI, p62, нуклеопорин 62 кДа, нуклеопорин 62
Внешние идентификаторыOMIM: 605815 MGI: 1351500 ГомолоГен: 68773 Генные карты: NUP62
Расположение гена (человек)
Хромосома 19 (человек)
Chr.Хромосома 19 (человек)[1]
Хромосома 19 (человек)
Genomic location for NUP62
Genomic location for NUP62
Группа19q13.33Начинать49,906,825 бп[1]
Конец49,929,763 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

23636

18226

Ансамбль

ENSG00000213024

ENSMUSG00000109511

UniProt

P37198

Q63850

RefSeq (мРНК)

NM_153719
NM_001193357
NM_012346
NM_016553
NM_153718

NM_053074

RefSeq (белок)

NP_001180286
NP_036478
NP_057637
NP_714940
NP_714941

NP_444304

Расположение (UCSC)Chr 19: 49.91 - 49.93 Мбн / д
PubMed поиск[2][3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Нуклеопорин p62 (p62) представляет собой белковый комплекс, связанный с ядерная оболочка. Белок p62 остается связанным с ядерный поровый комплекс -ламина фракция. p62 синтезируется как растворимый цитоплазматический предшественник 61 кДа[4] с последующей модификацией, включающей добавление остатков N-ацетилглюкозамина,[5] с последующей ассоциацией с другими сложными белками.

Комплекс ядерных пор представляет собой массивную структуру, которая простирается через ядерную оболочку, образуя ворота, которые регулируют поток макромолекул между ядром и цитоплазмой. Нуклеопорины являются основными компонентами комплекса ядерных пор в эукариотических клетках. Белок, кодируемый этим геном, является членом нуклеопоринов, содержащих FG-повтор, и локализован в центральной пробке ядерной поры. Этот белок связывается с комплексом importin альфа / бета, который участвует в импорте белков, содержащих сигналы ядерной локализации. Множественные варианты транскриптов этого гена кодируют одну изоформу белка.[6]

Структура

P62 представляет собой богатый серином / треонином белок, состоящий из ~ 520 аминокислот, с тетрапептидными повторами на аминоконце и серией альфа-спиральных участков с гидрофобными гептада повторяет[7] формирование бета-винт домен. P62 собирается в комплекс, содержащий 3 дополнительных белка, p60, p54 и p45. [8][9] формирование p62 комплекс ~ 235 кДа. О-GlcNAцилирование по-видимому, участвует в сборке и разборке p62 в комплексы более высокого порядка, а богатая серином / треонином линкерная область между Ser270 и Thr294, по-видимому, является регуляторной.[10] В p62 комплекс локализован как на нуклеоплазматической, так и на цитоплазматической сторонах порового комплекса, и относительный диаметр комплекса p62 по отношению к ядерному комплексу поры предполагает, что он взаимодействует при открытии пор.[11]

Функция

P62, по-видимому, взаимодействует с мРНК во время транспорта из ядра.[12] P62 также взаимодействует с белком фактора ядерного транспорта (NTF2), который участвует в транспортировке белков между цитоплазмой и ядром.[13] Другой белок, importin (бета), связывается с участком спирального стержня p62, который также связывает NTF2, что свидетельствует о формировании стробирующего комплекса более высокого порядка.[14] Кариоферин бета2 (транспортин), переносчик рибопротеинов, также взаимодействует с p62.[15] P62 также взаимодействует с Nup93,[16] и когда Nup98 истощен, p62 не может собраться с комплексами ядерных пор.[17] Мутантные поры не могут стыковаться / транспортировать белки с сигналами ядерной локализации или сигналами импорта M9.

Патология

Антитела к p62 комплекс вовлечены в одно или несколько аутоиммунных заболеваний. Гликозилирование P62 повышено при диабете[18] и может влиять на его связь с другими заболеваниями. p62 также чаще встречается на стадии IV. первичный билиарный цирроз и является прогностическим признаком тяжелого заболевания.[19]

Взаимодействия

Было показано, что нуклеопорин 62 взаимодействовать с:

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000213024 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  3. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ Дэвис Л.И., Блобель Г. (1986). «Идентификация и характеристика сложных белков ядерных пор». Клетка. 45 (5): 699–709. Дои:10.1016/0092-8674(86)90784-1. PMID  3518946. S2CID  22170880.
  5. ^ Дэвис Л.И., Блобель Г. (1987). «Комплекс ядерных пор содержит семейство гликопротеинов, которое включает р62: гликозилирование посредством ранее не идентифицированного клеточного пути». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 84 (21): 7552–6. Bibcode:1987PNAS ... 84.7552D. Дои:10.1073 / pnas.84.21.7552. ЧВК  299337. PMID  3313397.
  6. ^ «Ген Entrez: нуклеопорин NUP62 62 кДа».
  7. ^ Старр CM, Д'Онофрио М, Парк МК, Ганновер, Дж. А (1990). «Первичная последовательность и гетерологичная экспрессия гликопротеина р62 ядерных пор». J. Cell Biol. 110 (6): 1861–71. Дои:10.1083 / jcb.110.6.1861. ЧВК  2116139. PMID  2190987.
  8. ^ Кита К., Омата С., Хоригоме Т. (1993). «Очистка и характеристика гликопротеинового комплекса ядерной поры, содержащего p62». J. Biochem. 113 (3): 377–82. Дои:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a124054. PMID  8486610.
  9. ^ Басс Ф, Стюарт М (1995). «Макромолекулярные взаимодействия в комплексе нуклеопорина p62 ядерных пор крысы: связывание нуклеопорина p54 с стержневым доменом p62». J. Cell Biol. 128 (3): 251–61. Дои:10.1083 / jcb.128.3.251. ЧВК  2120351. PMID  7531196.
  10. ^ Любас В.А., Смит М., Старр К.М., Ганновер Дж. А. (1995). «Анализ гликозилирования белка р62 ядерных пор». Биохимия. 34 (5): 1686–94. Дои:10.1021 / bi00005a025. PMID  7849028.
  11. ^ Гуан Т., Мюллер С., Клир Дж., Панте Н., Блевитт Дж. М., Ханер М., Паскаль Б., Эби Ю., Джерас Л. (1995). «Структурный анализ комплекса p62, сборки O-связанных гликопротеинов, который располагается вблизи центрального закрытого канала комплекса ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 6 (11): 1591–603. Дои:10.1091 / mbc.6.11.1591. ЧВК  301313. PMID  8589458.
  12. ^ Dargemont C, Schmidt-Zachmann MS, Kühn LC (1995). «Прямое взаимодействие нуклеопорина p62 с мРНК во время его экспорта из ядра». J. Cell Sci. 108 (1): 257–63. PMID  7738103.
  13. ^ Баллок Т.Л., Кларксон В.Д., Кент Х.М., Стюарт М. (1996). «Кристаллическая структура с разрешением 1,6 ангстрем ядерного транспортного фактора 2 (NTF2)». J. Mol. Биол. 260 (3): 422–31. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0411. PMID  8757804.
  14. ^ а б Percipalle P, Кларксон WD, Кент HM, Rhodes D, Stewart M (1997). «Молекулярные взаимодействия между гетеродимером импортина альфа / бета и белками, участвующими в импорте ядерного белка позвоночных». J. Mol. Биол. 266 (4): 722–32. Дои:10.1006 / jmbi.1996.0801. PMID  9102465.
  15. ^ Ясин Н.Р., Блобель Г. (1997). «Клонирование и характеристика кариоферина β3 человека». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (9): 4451–6. Bibcode:1997PNAS ... 94.4451Y. Дои:10.1073 / пнас.94.9.4451. ЧВК  20743. PMID  9114010.
  16. ^ а б Гранди П., Данг Т., Пане Н., Шевченко А., Манн М., Форбс Д., Хёрт Э (1997). «Nup93, позвоночный гомолог дрожжевого Nic96p, образует комплекс с новым 205-кДа белком и необходим для правильной сборки ядерных пор». Мол. Биол. Клетка. 8 (10): 2017–38. Дои:10.1091 / mbc.8.10.2017. ЧВК  25664. PMID  9348540.
  17. ^ Ву Х, Каспер Л.Х., Манчева Р.Т., Манчев Г.Т., Спрингетт М.Дж., ван Дерсен Дж.М. (2001). «Нарушение FG нуклеопорина NUP98 вызывает избирательные изменения в стехиометрии и функции комплекса ядерных пор». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (6): 3191–6. Bibcode:2001PNAS ... 98,3191 Вт. Дои:10.1073 / pnas.051631598. ЧВК  30629. PMID  11248054.
  18. ^ Хан I, О ES, Kudlow JE (2000). «Чувствительность состояния O-связанной модификации N-ацетилглюкозамина белка ядерной поры p62 на внеклеточную концентрацию глюкозы». Biochem. J. 350 Pt 1 (Pt 1): 109–14. Дои:10.1042/0264-6021:3500109. ЧВК  1221231. PMID  10926833.
  19. ^ Миячи К., Хэнкинс Р.В., Мацусима Х., Кикучи Ф., Иномата Т., Хоригоме Т., Сибата М., Онодзука Й., Уэно Ю., Хашимото Е., Хаяси Н., Сибуя А., Амаки С., Миякава Х (2003). «Профиль и клиническое значение антител против ядерной оболочки, обнаруженных у пациентов с первичным билиарным циррозом: многоцентровое исследование». J. Аутоиммунный. 20 (3): 247–54. Дои:10.1016 / S0896-8411 (03) 00033-7. PMID  12753810.
  20. ^ Йошима Т., Юра Т., Янаги Х. (ноябрь 1997 г.). «Домен тримеризации фактора теплового шока 2 человека способен взаимодействовать с нуклеопорином p62». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 240 (1): 228–33. Дои:10.1006 / bbrc.1997.7662. PMID  9367915.
  21. ^ Бен-Эфраим I, Джерас Л. (январь 2001 г.). «Градиент увеличения сродства импортина бета к нуклеопоринам на пути ядерного импорта». J. Cell Biol. 152 (2): 411–7. Дои:10.1083 / jcb.152.2.411. ЧВК  2199621. PMID  11266456.
  22. ^ Ху Т., Гуань Т., Джерас Л. (август 1996 г.). «Молекулярная и функциональная характеристика комплекса p62, сборки гликопротеинов комплекса ядерных пор». J. Cell Biol. 134 (3): 589–601. Дои:10.1083 / jcb.134.3.589. ЧВК  2120945. PMID  8707840.
  23. ^ Паскаль Б.М., Джерас Л. (май 1995 г.). «Идентификация NTF2, цитозольного фактора ядерного импорта, который взаимодействует с белком комплекса ядерных пор p62». J. Cell Biol. 129 (4): 925–37. Дои:10.1083 / jcb.129.4.925. ЧВК  2120498. PMID  7744965.
  24. ^ Гампер C, ван Эйндховен WG, Schweiger E, Mossbacher M, Koo B, Lederman S (2000). «TRAF-3 взаимодействует с нуклеопорином p62, компонентом центральной пробки ядерной поры, которая связывает классические NLS-содержащие импортные комплексы». Мол. Иммунол. 37 (1–2): 73–84. Дои:10.1016 / S0161-5890 (00) 00015-8. PMID  10781837.
  25. ^ Келенбах Р., Дикманнс А., Келенбах А., Гуан Т., Джерас Л. (май 1999 г.). «Роль RanBP1 в высвобождении CRM1 из комплекса ядерных пор на конечном этапе ядерного экспорта». J. Cell Biol. 145 (4): 645–57. Дои:10.1083 / jcb.145.4.645. ЧВК  2133185. PMID  10330396.
  26. ^ Линдси М.Э., Холаска Дж.М., Велч К., Паскаль Б.М., Макара И.Г. (июнь 2001 г.). «Ran-связывающий белок 3 является кофактором для Crm1-опосредованного экспорта ядерного белка». J. Cell Biol. 153 (7): 1391–402. Дои:10.1083 / jcb.153.7.1391. ЧВК  2150735. PMID  11425870.

дальнейшее чтение